Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G543100.15,Sobic.001G543100.1,Sobic.001G543100.8,Sobic.001G543100.2,Sobic.001G543100.12,Sobic.001G543100.4,Sobic.001G543100.5,Sobic.001G543100.7,Sobic.001G543100.3,Sobic.001G543100.6,Sobic.001G543100.10,Sobic.001G543100.14,Sobic.001G543100.9,Sobic.001G543100.13,Sobic.001G543100.11
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5SC99 , A0A1Z5SCE4 , A0A1Z5SC51 , A0A1Z5SC31 , A0A1Z5SC77 , A0A1Z5SC97 , A0A1Z5SCH4 , A0A1Z5SC44 , A0A1Z5SC50 , A0A1Z5SC29 , A0A1Z5SC13 , A0A1Z5SC41 , A0A1Z5SC21 , A0A1Z5SC40 , A0A1Z5SC20
Pfam PF00271 PF00271 PF00176
Panther DB PTHR10799
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005524; ATP binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G44980 : SNF2 domain-containing protein / helicase domain-containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g01200.1 : SNF2 family N-terminal domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053608
Brachypodium PNT78386
Barley HORVU4Hr1G088540.11 , HORVU4Hr1G088540.10 , HORVU4Hr1G088540.9 , HORVU4Hr1G088540.8 , HORVU4Hr1G088540.7 , HORVU4Hr1G088540.6 , HORVU4Hr1G088540.5 , HORVU4Hr1G088540.4 , HORVU4Hr1G088540.3 , HORVU4Hr1G088540.2 , HORVU4Hr1G088540.1
Wheat TraesCS4D02G364600 , TraesCS4D02G364600 , TraesCS4D02G364600 , TraesCS5A02G541400 , TraesCS5A02G541400 , TraesCS4B02G372600
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G082400 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
2 Sobic.005G165850 - -
3 Sobic.006G076100 - -
4 Sobic.001G366600 OsFBX51 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.001G403800 expressed protein -
6 Sobic.001G366300 telomerase reverse transcriptase, putative, expressed K11126: TERT, telomerase reverse transcriptase
7 Sobic.010G111450 - -
8 Sobic.004G269900 "GS2/GL2(Ortholog in rice:Che et al., 2015(PubMedID : 31659888)@growth-regulating factor, putative, expressed -
9 Sobic.002G040201 - -
10 Sobic.002G022600 AP2-like ethylene-responsive transcription factor AINTEGUMENTA, putative, expressed K09285: OVM, AP2-like factor, ANT lineage
11 Sobic.007G076600 RNA-dependent RNA polymerase, putative, expressed K11699: RDR, RNA-dependent RNA polymerase
12 Sobic.006G098400 alpha/beta hydrolase fold, putative, expressed -
13 Sobic.003G013950 - -
14 Sobic.005G188400 remorin C-terminal domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G187150 - -
16 Sobic.001G463600 - -
17 Sobic.002G394466 - -
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19 Sobic.001G059900 type I inositol-1,4,5-trisphosphate 5-phosphatase, putative, expressed -
20 Sobic.001G499800 expansin precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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