Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G006801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W1T6
Pfam PF04578 PF13968
Panther DB PTHR31325 PTHR31325:SF26
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45480 : Protein of unknown function (DUF594)
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g24240.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G189400 expressed protein -
2 Sobic.005G231400 cyclin, putative, expressed K18813: cyclin D7, plant
3 Sobic.007G012800 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
4 Sobic.001G488400 "PGL1(Ortholog in rice:Heang and Sassa, 2012)"(PubMedID : 31659850)@bHLH family protein, putative, expressed -
5 Sobic.008G158000 expressed protein -
6 Sobic.009G037300 transferase family protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G188500 expressed protein -
8 Sobic.008G187400 - -
9 Sobic.007G189400 BEE 1, putative, expressed -
10 Sobic.001G228100 gene responsible for epi-cuticular wax accumulation in sorghum.(PubMedID : 29379518)@GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
11 Sobic.007G103800 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -
12 Sobic.003G116100 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
13 Sobic.002G419200 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.006G181600 MYB family transcription factor, putative, expressed -
15 Sobic.010G027700 OsSAUR24 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
16 Sobic.009G260200 helix-loop-helix DNA-binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.002G183800 L-ascorbate oxidase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.002G072700 carboxyl-terminal peptidase, putative, expressed -
19 Sobic.009G254500 protein kinase, putative, expressed -
20 Sobic.010G273400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G006801 Sobic002G006801 Sobic006G189400 Sobic006G189400 Sobic002G006801--Sobic006G189400 Sobic005G231400 Sobic005G231400 Sobic002G006801--Sobic005G231400 Sobic007G012800 Sobic007G012800 Sobic002G006801--Sobic007G012800 Sobic001G488400 Sobic001G488400 Sobic002G006801--Sobic001G488400 Sobic008G158000 Sobic008G158000 Sobic002G006801--Sobic008G158000 Sobic009G037300 Sobic009G037300 Sobic002G006801--Sobic009G037300 Sobic005G188500 Sobic005G188500 Sobic002G006801--Sobic005G188500 Sobic008G187400 Sobic008G187400 Sobic002G006801--Sobic008G187400 Sobic007G189400 Sobic007G189400 Sobic002G006801--Sobic007G189400 Sobic006G189400--Sobic005G231400 Sobic006G189400--Sobic008G187400 Sobic006G189400--Sobic001G488400 Sobic003G116100 Sobic003G116100 Sobic006G189400--Sobic003G116100 Sobic003G338200 Sobic003G338200 Sobic006G189400--Sobic003G338200 Sobic002G419200 Sobic002G419200 Sobic006G189400--Sobic002G419200 Sobic001G345200 Sobic001G345200 Sobic006G189400--Sobic001G345200 Sobic006G189400--Sobic007G012800 Sobic003G300400 Sobic003G300400 Sobic006G189400--Sobic003G300400 Sobic005G231400--Sobic008G187400 Sobic005G231400--Sobic006G189400 Sobic005G231400--Sobic001G345200 Sobic008G170400 Sobic008G170400 Sobic005G231400--Sobic008G170400 Sobic005G098400 Sobic005G098400 Sobic005G231400--Sobic005G098400 Sobic005G231400--Sobic001G488400 Sobic003G418300 Sobic003G418300 Sobic005G231400--Sobic003G418300 Sobic005G231400--Sobic003G338200 Sobic007G094200 Sobic007G094200 Sobic005G231400--Sobic007G094200 Sobic005G209900 Sobic005G209900 Sobic007G012800--Sobic005G209900 Sobic007G012800--Sobic001G488400 Sobic009G154100 Sobic009G154100 Sobic007G012800--Sobic009G154100 Sobic009G134000 Sobic009G134000 Sobic007G012800--Sobic009G134000 Sobic007G012800--Sobic005G188500 Sobic010G107200 Sobic010G107200 Sobic007G012800--Sobic010G107200 Sobic007G103800 Sobic007G103800 Sobic007G012800--Sobic007G103800 Sobic006G032800 Sobic006G032800 Sobic007G012800--Sobic006G032800 Sobic003G277200 Sobic003G277200 Sobic007G012800--Sobic003G277200 Sobic001G488400--Sobic005G188500 Sobic010G027700 Sobic010G027700 Sobic001G488400--Sobic010G027700 Sobic006G044200 Sobic006G044200 Sobic001G488400--Sobic006G044200 Sobic001G488400--Sobic008G187400 Sobic001G438500 Sobic001G438500 Sobic001G488400--Sobic001G438500 Sobic001G488400--Sobic003G116100 Sobic001G488400--Sobic007G189400 Sobic002G068400 Sobic002G068400 Sobic001G488400--Sobic002G068400 Sobic008G035400 Sobic008G035400 Sobic001G488400--Sobic008G035400 Sobic008G158000--Sobic001G488400 Sobic008G158000--Sobic005G188500 Sobic008G158000--Sobic007G189400 Sobic008G158000--Sobic006G044200 Sobic002G072700 Sobic002G072700 Sobic008G158000--Sobic002G072700 Sobic001G228100 Sobic001G228100 Sobic008G158000--Sobic001G228100 Sobic008G158000--Sobic007G012800 Sobic008G158000--Sobic008G187400 Sobic008G043100 Sobic008G043100 Sobic008G158000--Sobic008G043100 Sobic002G183800 Sobic002G183800 Sobic009G037300--Sobic002G183800 Sobic009G037300--Sobic010G027700 Sobic008G012600 Sobic008G012600 Sobic009G037300--Sobic008G012600 Sobic002G023700 Sobic002G023700 Sobic009G037300--Sobic002G023700 Sobic005G110900 Sobic005G110900 Sobic009G037300--Sobic005G110900 Sobic003G120600 Sobic003G120600 Sobic009G037300--Sobic003G120600 Sobic007G125400 Sobic007G125400 Sobic009G037300--Sobic007G125400 Sobic009G254500 Sobic009G254500 Sobic009G037300--Sobic009G254500 Sobic001G266100 Sobic001G266100 Sobic009G037300--Sobic001G266100 Sobic005G188500--Sobic001G488400 Sobic005G188500--Sobic006G044200 Sobic005G188500--Sobic007G189400 Sobic005G188500--Sobic006G032800 Sobic005G188500--Sobic007G012800 Sobic005G188500--Sobic008G035400 Sobic010G065700 Sobic010G065700 Sobic005G188500--Sobic010G065700 Sobic005G188500--Sobic005G209900 Sobic005G188500--Sobic010G107200 Sobic008G187400--Sobic007G094200 Sobic008G187400--Sobic001G438500 Sobic008G187400--Sobic009G254500 Sobic008G187400--Sobic001G488400 Sobic002G011000 Sobic002G011000 Sobic008G187400--Sobic002G011000 Sobic008G187400--Sobic005G231400 Sobic008G187400--Sobic003G300400 Sobic002G032500 Sobic002G032500 Sobic008G187400--Sobic002G032500 Sobic003G309400 Sobic003G309400 Sobic008G187400--Sobic003G309400 Sobic007G189400--Sobic002G072700 Sobic007G189400--Sobic005G188500 Sobic007G189400--Sobic009G254500 Sobic003G339600 Sobic003G339600 Sobic007G189400--Sobic003G339600 Sobic007G189400--Sobic001G488400 Sobic010G020600 Sobic010G020600 Sobic007G189400--Sobic010G020600 Sobic007G189400--Sobic006G044200 Sobic001G119200 Sobic001G119200 Sobic007G189400--Sobic001G119200 Sobic002G139800 Sobic002G139800 Sobic007G189400--Sobic002G139800
Octagon: transcription factors


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