Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G135500.1
Synonym Sb02g012080, GLP4
Functional annotation Cupin domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QB23
Pfam PF07883
Panther DB PTHR31238 PTHR31238:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G02335 : germin-like protein subfamily 2 member 2 precursor
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g39530.1 : Cupin domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium PNT68692 , KQJ91594 , KQJ91593 , KQK02320
Barley HORVU5Hr1G080640.1 , HORVU5Hr1G080640.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G243666 - -
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8 Sobic.007G090442 - -
9 Sobic.007G075301 - -
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12 Sobic.004G157950 - -
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14 Sobic.009G078700 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
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19 Sobic.002G111400 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
20 Sobic.002G008200 flavin-containing monooxygenase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G135500 Sobic002G135500 Sobic001G243666 Sobic001G243666 Sobic002G135500--Sobic001G243666 Sobic009G248000 Sobic009G248000 Sobic002G135500--Sobic009G248000 Sobic006G121700 Sobic006G121700 Sobic002G135500--Sobic006G121700 Sobic009G191801 Sobic009G191801 Sobic002G135500--Sobic009G191801 Sobic004G190200 Sobic004G190200 Sobic002G135500--Sobic004G190200 Sobic004G155800 Sobic004G155800 Sobic002G135500--Sobic004G155800 Sobic010G164100 Sobic010G164100 Sobic002G135500--Sobic010G164100 Sobic007G090442 Sobic007G090442 Sobic002G135500--Sobic007G090442 Sobic007G075301 Sobic007G075301 Sobic002G135500--Sobic007G075301 Sobic001G243666--Sobic006G121700 Sobic001G243666--Sobic009G191801 Sobic001G243666--Sobic004G190200 Sobic001G243666--Sobic010G164100 Sobic001G088600 Sobic001G088600 Sobic001G243666--Sobic001G088600 Sobic001G243666--Sobic007G075301 Sobic001G534900 Sobic001G534900 Sobic001G243666--Sobic001G534900 Sobic002G111400 Sobic002G111400 Sobic001G243666--Sobic002G111400 Sobic009G115200 Sobic009G115200 Sobic001G243666--Sobic009G115200 Sobic009G013400 Sobic009G013400 Sobic009G248000--Sobic009G013400 Sobic004G157950 Sobic004G157950 Sobic009G248000--Sobic004G157950 Sobic003G421900 Sobic003G421900 Sobic009G248000--Sobic003G421900 Sobic009G248000--Sobic007G090442 Sobic009G041100 Sobic009G041100 Sobic009G248000--Sobic009G041100 Sobic003G153500 Sobic003G153500 Sobic009G248000--Sobic003G153500 Sobic004G270350 Sobic004G270350 Sobic009G248000--Sobic004G270350 Sobic010G237100 Sobic010G237100 Sobic009G248000--Sobic010G237100 Sobic005G110000 Sobic005G110000 Sobic009G248000--Sobic005G110000 Sobic006G121700--Sobic001G243666 Sobic006G121700--Sobic004G190200 Sobic006G121700--Sobic009G191801 Sobic006G121700--Sobic010G164100 Sobic006G121700--Sobic007G075301 Sobic006G121700--Sobic001G088600 Sobic006G121700--Sobic001G534900 Sobic004G294500 Sobic004G294500 Sobic006G121700--Sobic004G294500 Sobic006G121700--Sobic009G115200 Sobic009G191801--Sobic009G115200 Sobic009G191801--Sobic006G121700 Sobic009G191801--Sobic001G088600 Sobic009G191801--Sobic001G243666 Sobic009G191801--Sobic002G111400 Sobic009G191801--Sobic004G190200 Sobic009G209400 Sobic009G209400 Sobic009G191801--Sobic009G209400 Sobic009G191801--Sobic010G164100 Sobic002G302300 Sobic002G302300 Sobic009G191801--Sobic002G302300 Sobic004G190200--Sobic006G121700 Sobic004G190200--Sobic001G243666 Sobic009G253800 Sobic009G253800 Sobic004G190200--Sobic009G253800 Sobic004G190200--Sobic004G294500 Sobic004G190200--Sobic010G164100 Sobic004G190200--Sobic009G191801 Sobic002G141450 Sobic002G141450 Sobic004G190200--Sobic002G141450 Sobic004G190200--Sobic007G075301 Sobic001G518700 Sobic001G518700 Sobic004G190200--Sobic001G518700 Sobic001G423300 Sobic001G423300 Sobic004G155800--Sobic001G423300 Sobic001G480550 Sobic001G480550 Sobic004G155800--Sobic001G480550 Sobic005G072400 Sobic005G072400 Sobic004G155800--Sobic005G072400 Sobic001G130700 Sobic001G130700 Sobic004G155800--Sobic001G130700 Sobic005G187400 Sobic005G187400 Sobic004G155800--Sobic005G187400 Sobic005G046900 Sobic005G046900 Sobic004G155800--Sobic005G046900 Sobic003G022200 Sobic003G022200 Sobic004G155800--Sobic003G022200 Sobic010G270800 Sobic010G270800 Sobic004G155800--Sobic010G270800 Sobic009G257500 Sobic009G257500 Sobic004G155800--Sobic009G257500 Sobic010G164100--Sobic007G075301 Sobic005G193260 Sobic005G193260 Sobic010G164100--Sobic005G193260 Sobic005G192700 Sobic005G192700 Sobic010G164100--Sobic005G192700 Sobic005G185600 Sobic005G185600 Sobic010G164100--Sobic005G185600 Sobic005G192900 Sobic005G192900 Sobic010G164100--Sobic005G192900 Sobic005G192901 Sobic005G192901 Sobic010G164100--Sobic005G192901 Sobic010G044600 Sobic010G044600 Sobic010G164100--Sobic010G044600 Sobic005G192801 Sobic005G192801 Sobic010G164100--Sobic005G192801 Sobic002G362400 Sobic002G362400 Sobic010G164100--Sobic002G362400 Sobic007G090442--Sobic009G041100 Sobic007G090442--Sobic005G110000 Sobic007G090442--Sobic002G362400 Sobic005G087666 Sobic005G087666 Sobic007G090442--Sobic005G087666 Sobic007G090442--Sobic010G237100 Sobic007G090442--Sobic010G044600 Sobic009G010000 Sobic009G010000 Sobic007G090442--Sobic009G010000 Sobic003G392500 Sobic003G392500 Sobic007G090442--Sobic003G392500 Sobic005G199300 Sobic005G199300 Sobic007G090442--Sobic005G199300 Sobic007G075301--Sobic010G164100 Sobic007G075301--Sobic005G193260 Sobic007G075301--Sobic005G185600 Sobic007G075301--Sobic005G192700 Sobic007G075301--Sobic005G192900 Sobic007G075301--Sobic005G192901 Sobic007G075301--Sobic005G192801 Sobic007G029800 Sobic007G029800 Sobic007G075301--Sobic007G029800 Sobic007G075301--Sobic010G044600
Octagon: transcription factors


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