Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G084501.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R5D5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G28706 : pfkB-like carbohydrate kinase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g45180.1 : kinase, pfkB family, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a005072
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G135500 Cupin domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G100500 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
3 Sobic.001G268850 - -
4 Sobic.002G073350 - -
5 Sobic.001G262400 acetyl-CoA carboxylase, putative, expressed -
6 Sobic.005G152600 - -
7 Sobic.006G248350 - -
8 Sobic.004G068350 - -
9 Sobic.004G155800 thiamine pyrophosphate enzyme, C-terminal TPP binding domain containing protein, expressed K01652: E2.2.1.6L, ilvB, ilvG, acetolactate synthase I/II/III large subunit
10 Sobic.003G300500 oxidoreductase, aldo/keto reductase family protein, putative, expressed -
11 Sobic.006G003951 - -
12 Sobic.001G206200 oxidoreductase, short chain dehydrogenase/reductase family domain containing family, expressed K00218: protochlorophyllide reductase
13 Sobic.001G011300 expressed protein -
14 Sobic.002G289100 chlorophyll A-B binding protein, putative, expressed -
15 Sobic.009G165200 plant-specific domain TIGR01589 family protein, expressed -
16 Sobic.010G146100 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
17 Sobic.003G055300 -(PubMedID : 29017446)@ultraviolet-B-repressible protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G338000 Chorophyll a/b binding protein CP29.1(PubMedID : 26186930)@Chlorophyll A-B binding protein CP29 LHCB4 (At)(PubMedID : 27208977)@Light harvesting complex-II subunit B4(PubMedID : 29017446)@chlorophyll A-B binding protein, putative, expressed K08915: light-harvesting complex II chlorophyll a/b binding protein 4
19 Sobic.001G036600 ubiquitin family protein, putative, expressed K08770: ubiquitin C
20 Sobic.010G156700 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K19038: E3 ubiquitin-protein ligase ATL41


Gene co-expression network
sample Sobic008G084501 Sobic008G084501 Sobic002G135500 Sobic002G135500 Sobic008G084501--Sobic002G135500 Sobic003G100500 Sobic003G100500 Sobic008G084501--Sobic003G100500 Sobic001G268850 Sobic001G268850 Sobic008G084501--Sobic001G268850 Sobic002G073350 Sobic002G073350 Sobic008G084501--Sobic002G073350 Sobic001G262400 Sobic001G262400 Sobic008G084501--Sobic001G262400 Sobic005G152600 Sobic005G152600 Sobic008G084501--Sobic005G152600 Sobic006G248350 Sobic006G248350 Sobic008G084501--Sobic006G248350 Sobic004G068350 Sobic004G068350 Sobic008G084501--Sobic004G068350 Sobic004G155800 Sobic004G155800 Sobic008G084501--Sobic004G155800 Sobic001G243666 Sobic001G243666 Sobic002G135500--Sobic001G243666 Sobic009G248000 Sobic009G248000 Sobic002G135500--Sobic009G248000 Sobic006G121700 Sobic006G121700 Sobic002G135500--Sobic006G121700 Sobic009G191801 Sobic009G191801 Sobic002G135500--Sobic009G191801 Sobic004G190200 Sobic004G190200 Sobic002G135500--Sobic004G190200 Sobic002G135500--Sobic004G155800 Sobic010G164100 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Sobic009G257500 Sobic004G155800--Sobic009G257500
Octagon: transcription factors


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