Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G036600.2
Synonym UBQ13, Sb01g003385
Functional annotation ubiquitin family protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5S465
Pfam PF00240
Panther DB PTHR10666
NCBI CDD KOG0005; Ubiquitin-like protein KOG0001Ubiquitin and ubiquitin-like proteins
KEGG Orthology K08770; ubiquitin C
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G05320 : polyubiquitin 10
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g46770.1 : ubiquitin family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic001G036600 Sobic001G036600 Sobic006G211000 Sobic006G211000 Sobic001G036600--Sobic006G211000 Sobic004G191500 Sobic004G191500 Sobic001G036600--Sobic004G191500 Sobic001G007300 Sobic001G007300 Sobic001G036600--Sobic001G007300 Sobic002G164600 Sobic002G164600 Sobic001G036600--Sobic002G164600 Sobic008G084501 Sobic008G084501 Sobic001G036600--Sobic008G084501 Sobic003G098500 Sobic003G098500 Sobic001G036600--Sobic003G098500 Sobic006G124600 Sobic006G124600 Sobic001G036600--Sobic006G124600 Sobic010G118300 Sobic010G118300 Sobic001G036600--Sobic010G118300 Sobic008G059800 Sobic008G059800 Sobic001G036600--Sobic008G059800 Sobic009G034500 Sobic009G034500 Sobic006G211000--Sobic009G034500 Sobic008G137901 Sobic008G137901 Sobic006G211000--Sobic008G137901 Sobic001G510200 Sobic001G510200 Sobic006G211000--Sobic001G510200 Sobic009G151000 Sobic009G151000 Sobic006G211000--Sobic009G151000 Sobic006G166800 Sobic006G166800 Sobic006G211000--Sobic006G166800 Sobic010G196400 Sobic010G196400 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Octagon: transcription factors


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