Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G194900.2,Sobic.002G194900.3,Sobic.002G194900.1
Synonym Sb02g024160
Functional annotation proline-rich protein 6, putative, expressed
UniProt C5XC46
Pfam PF04828
Panther DB PTHR28620 PTHR28620:SF1
NCBI CDD KOG4192; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016846; carbon-sulfur lyase activity GO:0008152metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G16940 : carbon-sulfur lyases
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g23370.1,LOC_Os09g23370.2 : proline-rich protein 6, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a013871 , Zm00025a013873 , Zm00025a013868
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G060620.1 , HORVU5Hr1G060620.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G105200 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@aldose 1-epimerase, putative, expressed K01785: galM, aldose 1-epimerase
2 Sobic.001G410400 - -
3 Sobic.006G087250 - -
4 Sobic.007G135301 - -
5 Sobic.003G137300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@LOI1, putative, expressed -
6 Sobic.003G380800 expressed protein -
7 Sobic.009G046300 - -
8 Sobic.001G329001 - K03129: transcription initiation factor TFIID subunit 4
9 Sobic.001G129200 receptor protein kinase TMK1 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.003G410000 expressed protein -
11 Sobic.005G068200 expressed protein -
12 Sobic.007G226300 expressed protein -
13 Sobic.003G159000 - -
14 Sobic.009G206150 - -
15 Sobic.007G084400 - -
16 Sobic.001G182400 - -
17 Sobic.007G114401 - -
18 Sobic.010G256866 - -
19 Sobic.009G177901 - -
20 Sobic.007G088200 haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 1A, putative, expressed K17623: PUDP, pseudouridine 5'-phosphatase


Gene co-expression network
sample Sobic002G194900 Sobic002G194900 Sobic006G105200 Sobic006G105200 Sobic002G194900--Sobic006G105200 Sobic001G410400 Sobic001G410400 Sobic002G194900--Sobic001G410400 Sobic006G087250 Sobic006G087250 Sobic002G194900--Sobic006G087250 Sobic007G135301 Sobic007G135301 Sobic002G194900--Sobic007G135301 Sobic003G137300 Sobic003G137300 Sobic002G194900--Sobic003G137300 Sobic003G380800 Sobic003G380800 Sobic002G194900--Sobic003G380800 Sobic009G046300 Sobic009G046300 Sobic002G194900--Sobic009G046300 Sobic001G329001 Sobic001G329001 Sobic002G194900--Sobic001G329001 Sobic001G129200 Sobic001G129200 Sobic002G194900--Sobic001G129200 Sobic006G105200--Sobic002G194900 Sobic006G105200--Sobic007G135301 Sobic001G073800 Sobic001G073800 Sobic006G105200--Sobic001G073800 Sobic009G246800 Sobic009G246800 Sobic006G105200--Sobic009G246800 Sobic006G105200--Sobic006G087250 Sobic010G036400 Sobic010G036400 Sobic006G105200--Sobic010G036400 Sobic007G022300 Sobic007G022300 Sobic006G105200--Sobic007G022300 Sobic001G045500 Sobic001G045500 Sobic006G105200--Sobic001G045500 Sobic008G139100 Sobic008G139100 Sobic006G105200--Sobic008G139100 Sobic001G410400--Sobic001G129200 Sobic009G206150 Sobic009G206150 Sobic001G410400--Sobic009G206150 Sobic001G410400--Sobic006G087250 Sobic001G410400--Sobic003G137300 Sobic006G145650 Sobic006G145650 Sobic001G410400--Sobic006G145650 Sobic007G226300 Sobic007G226300 Sobic001G410400--Sobic007G226300 Sobic004G346800 Sobic004G346800 Sobic001G410400--Sobic004G346800 Sobic001G410400--Sobic007G135301 Sobic001G039750 Sobic001G039750 Sobic001G410400--Sobic001G039750 Sobic006G087250--Sobic007G135301 Sobic006G087250--Sobic004G346800 Sobic001G048300 Sobic001G048300 Sobic006G087250--Sobic001G048300 Sobic006G087250--Sobic003G137300 Sobic001G071250 Sobic001G071250 Sobic006G087250--Sobic001G071250 Sobic006G087250--Sobic007G226300 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic006G087250--Sobic001G195550 Sobic009G069450 Sobic009G069450 Sobic006G087250--Sobic009G069450 Sobic003G393600 Sobic003G393600 Sobic006G087250--Sobic003G393600 Sobic007G135301--Sobic001G195550 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic007G135301--Sobic004G346700 Sobic007G135301--Sobic004G346800 Sobic007G135301--Sobic006G087250 Sobic001G417100 Sobic001G417100 Sobic007G135301--Sobic001G417100 Sobic007G223150 Sobic007G223150 Sobic007G135301--Sobic007G223150 Sobic007G135301--Sobic001G071250 Sobic007G135301--Sobic001G045500 Sobic007G135301--Sobic009G206150 Sobic009G029100 Sobic009G029100 Sobic003G137300--Sobic009G029100 Sobic003G412500 Sobic003G412500 Sobic003G137300--Sobic003G412500 Sobic005G101400 Sobic005G101400 Sobic003G137300--Sobic005G101400 Sobic003G137300--Sobic009G069450 Sobic003G137300--Sobic006G087250 Sobic003G423400 Sobic003G423400 Sobic003G137300--Sobic003G423400 Sobic001G217800 Sobic001G217800 Sobic003G137300--Sobic001G217800 Sobic008G108300 Sobic008G108300 Sobic003G137300--Sobic008G108300 Sobic002G165200 Sobic002G165200 Sobic003G137300--Sobic002G165200 Sobic005G030266 Sobic005G030266 Sobic003G380800--Sobic005G030266 Sobic005G068200 Sobic005G068200 Sobic003G380800--Sobic005G068200 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic003G380800--Sobic001G249900 Sobic006G130100 Sobic006G130100 Sobic003G380800--Sobic006G130100 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic003G380800--Sobic006G093550 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic003G380800--Sobic004G234766 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic003G380800--Sobic010G107901 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic003G380800--Sobic001G054050 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic003G380800--Sobic003G172450 Sobic009G153366 Sobic009G153366 Sobic009G046300--Sobic009G153366 Sobic002G216300 Sobic002G216300 Sobic009G046300--Sobic002G216300 Sobic009G046300--Sobic003G137300 Sobic009G046300--Sobic007G135301 Sobic005G137500 Sobic005G137500 Sobic009G046300--Sobic005G137500 Sobic009G046300--Sobic006G087250 Sobic006G172100 Sobic006G172100 Sobic009G046300--Sobic006G172100 Sobic009G046300--Sobic006G130100 Sobic009G046300--Sobic003G423400 Sobic003G410000 Sobic003G410000 Sobic001G329001--Sobic003G410000 Sobic004G058400 Sobic004G058400 Sobic001G329001--Sobic004G058400 Sobic002G086700 Sobic002G086700 Sobic001G329001--Sobic002G086700 Sobic002G257150 Sobic002G257150 Sobic001G329001--Sobic002G257150 Sobic002G076300 Sobic002G076300 Sobic001G329001--Sobic002G076300 Sobic008G177100 Sobic008G177100 Sobic001G329001--Sobic008G177100 Sobic010G195000 Sobic010G195000 Sobic001G329001--Sobic010G195000 Sobic003G347560 Sobic003G347560 Sobic001G329001--Sobic003G347560 Sobic006G134300 Sobic006G134300 Sobic001G329001--Sobic006G134300 Sobic001G129200--Sobic001G410400 Sobic001G129200--Sobic006G087250 Sobic001G129200--Sobic003G137300 Sobic001G129200--Sobic005G068200 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic001G129200--Sobic006G192600 Sobic001G129200--Sobic008G108300 Sobic001G144001 Sobic001G144001 Sobic001G129200--Sobic001G144001 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic001G129200--Sobic008G157700 Sobic001G129200--Sobic009G069450
Octagon: transcription factors


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