Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G212300.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W5A3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G504500 expressed protein -
2 Sobic.004G349450 - -
3 Sobic.005G131550 - -
4 Sobic.006G162500 - -
5 Sobic.008G056600 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
6 Sobic.002G102300 - -
7 Sobic.002G280950 - -
8 Sobic.005G185500 - -
9 Sobic.002G243300 amino acid permease family protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G225500 expressed protein -
11 Sobic.008G036600 expressed protein -
12 Sobic.007G101600 - -
13 Sobic.004G303000 DTA2, putative, expressed -
14 Sobic.002G418300 vacuolar-sorting receptor precursor, putative, expressed -
15 Sobic.007G216800 expressed protein -
16 Sobic.005G110424 - -
17 Sobic.003G234701 - -
18 Sobic.003G079532 - -
19 Sobic.003G211233 - -
20 Sobic.008G054200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@csAtPR5, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G212300 Sobic002G212300 Sobic001G504500 Sobic001G504500 Sobic002G212300--Sobic001G504500 Sobic004G349450 Sobic004G349450 Sobic002G212300--Sobic004G349450 Sobic005G131550 Sobic005G131550 Sobic002G212300--Sobic005G131550 Sobic006G162500 Sobic006G162500 Sobic002G212300--Sobic006G162500 Sobic008G056600 Sobic008G056600 Sobic002G212300--Sobic008G056600 Sobic002G102300 Sobic002G102300 Sobic002G212300--Sobic002G102300 Sobic002G280950 Sobic002G280950 Sobic002G212300--Sobic002G280950 Sobic005G185500 Sobic005G185500 Sobic002G212300--Sobic005G185500 Sobic002G243300 Sobic002G243300 Sobic002G212300--Sobic002G243300 Sobic001G453600 Sobic001G453600 Sobic001G504500--Sobic001G453600 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic001G504500--Sobic002G389600 Sobic001G024400 Sobic001G024400 Sobic001G504500--Sobic001G024400 Sobic001G504500--Sobic004G349450 Sobic010G202200 Sobic010G202200 Sobic001G504500--Sobic010G202200 Sobic003G024100 Sobic003G024100 Sobic001G504500--Sobic003G024100 Sobic001G133400 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Octagon: transcription factors


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