Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G131550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RIE8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G504500 expressed protein -
2 Sobic.004G349450 - -
3 Sobic.002G280950 - -
4 Sobic.002G243300 amino acid permease family protein, putative, expressed -
5 Sobic.003G079532 - -
6 Sobic.004G189000 - -
7 Sobic.003G211233 - -
8 Sobic.001G453600 beta-hexosaminidase precursor, putative, expressed K12373: hexosaminidase
9 Sobic.007G220150 - -
10 Sobic.008G076100 expressed protein -
11 Sobic.008G136601 - -
12 Sobic.002G212300 - -
13 Sobic.001G024400 pectinesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G156900 expressed protein -
15 Sobic.010G104600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Caleosin-related family protein(PubMedID : 26320239)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@caleosin related protein, putative, expressed K17991: peroxygenase
16 Sobic.002G193200 - -
17 Sobic.009G044100 pectinesterase inhibitor domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G019200 - -
19 Sobic.003G022400 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@hydrolase, acting on carbon-nitrogen, putative, expressed -
20 Sobic.006G177700 uncharacterized mscS family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G131550 Sobic005G131550 Sobic001G504500 Sobic001G504500 Sobic005G131550--Sobic001G504500 Sobic004G349450 Sobic004G349450 Sobic005G131550--Sobic004G349450 Sobic002G280950 Sobic002G280950 Sobic005G131550--Sobic002G280950 Sobic002G243300 Sobic002G243300 Sobic005G131550--Sobic002G243300 Sobic003G079532 Sobic003G079532 Sobic005G131550--Sobic003G079532 Sobic004G189000 Sobic004G189000 Sobic005G131550--Sobic004G189000 Sobic003G211233 Sobic003G211233 Sobic005G131550--Sobic003G211233 Sobic001G453600 Sobic001G453600 Sobic005G131550--Sobic001G453600 Sobic007G220150 Sobic007G220150 Sobic005G131550--Sobic007G220150 Sobic001G504500--Sobic001G453600 Sobic002G389600 Sobic002G389600 Sobic001G504500--Sobic002G389600 Sobic001G024400 Sobic001G024400 Sobic001G504500--Sobic001G024400 Sobic001G504500--Sobic004G349450 Sobic010G202200 Sobic010G202200 Sobic001G504500--Sobic010G202200 Sobic003G024100 Sobic003G024100 Sobic001G504500--Sobic003G024100 Sobic001G133400 Sobic001G133400 Sobic001G504500--Sobic001G133400 Sobic002G414800 Sobic002G414800 Sobic001G504500--Sobic002G414800 Sobic007G039200 Sobic007G039200 Sobic001G504500--Sobic007G039200 Sobic007G112500 Sobic007G112500 Sobic004G349450--Sobic007G112500 Sobic004G052600 Sobic004G052600 Sobic004G349450--Sobic004G052600 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic004G349450--Sobic006G017900 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic004G349450--Sobic006G017700 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic004G349450--Sobic001G211700 Sobic008G036100 Sobic008G036100 Sobic004G349450--Sobic008G036100 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic004G349450--Sobic005G000900 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic004G349450--Sobic004G046700 Sobic004G328500 Sobic004G328500 Sobic004G349450--Sobic004G328500 Sobic003G064100 Sobic003G064100 Sobic002G280950--Sobic003G064100 Sobic002G280950--Sobic003G211233 Sobic002G000800 Sobic002G000800 Sobic002G280950--Sobic002G000800 Sobic002G193200 Sobic002G193200 Sobic002G280950--Sobic002G193200 Sobic005G198800 Sobic005G198800 Sobic002G280950--Sobic005G198800 Sobic008G008000 Sobic008G008000 Sobic002G280950--Sobic008G008000 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic002G280950--Sobic005G077001 Sobic002G280950--Sobic003G079532 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic002G280950--Sobic005G058600 Sobic002G243300--Sobic004G349450 Sobic005G055700 Sobic005G055700 Sobic002G243300--Sobic005G055700 Sobic002G243300--Sobic007G112500 Sobic005G043300 Sobic005G043300 Sobic002G243300--Sobic005G043300 Sobic003G014200 Sobic003G014200 Sobic002G243300--Sobic003G014200 Sobic008G076100 Sobic008G076100 Sobic002G243300--Sobic008G076100 Sobic003G111000 Sobic003G111000 Sobic002G243300--Sobic003G111000 Sobic005G185900 Sobic005G185900 Sobic002G243300--Sobic005G185900 Sobic002G073600 Sobic002G073600 Sobic002G243300--Sobic002G073600 Sobic003G079532--Sobic003G211233 Sobic002G359100 Sobic002G359100 Sobic003G079532--Sobic002G359100 Sobic003G079532--Sobic002G193200 Sobic003G079532--Sobic007G220150 Sobic008G019200 Sobic008G019200 Sobic003G079532--Sobic008G019200 Sobic010G140100 Sobic010G140100 Sobic003G079532--Sobic010G140100 Sobic002G316100 Sobic002G316100 Sobic003G079532--Sobic002G316100 Sobic004G210300 Sobic004G210300 Sobic003G079532--Sobic004G210300 Sobic008G191900 Sobic008G191900 Sobic003G079532--Sobic008G191900 Sobic006G117700 Sobic006G117700 Sobic004G189000--Sobic006G117700 Sobic006G071362 Sobic006G071362 Sobic004G189000--Sobic006G071362 Sobic003G156900 Sobic003G156900 Sobic004G189000--Sobic003G156900 Sobic009G061500 Sobic009G061500 Sobic004G189000--Sobic009G061500 Sobic004G140400 Sobic004G140400 Sobic004G189000--Sobic004G140400 Sobic006G093600 Sobic006G093600 Sobic004G189000--Sobic006G093600 Sobic001G340800 Sobic001G340800 Sobic004G189000--Sobic001G340800 Sobic001G232600 Sobic001G232600 Sobic004G189000--Sobic001G232600 Sobic010G130601 Sobic010G130601 Sobic004G189000--Sobic010G130601 Sobic003G211233--Sobic002G193200 Sobic003G211233--Sobic003G079532 Sobic003G211233--Sobic008G008000 Sobic003G211233--Sobic005G198800 Sobic003G211233--Sobic008G019200 Sobic009G044100 Sobic009G044100 Sobic003G211233--Sobic009G044100 Sobic009G244100 Sobic009G244100 Sobic003G211233--Sobic009G244100 Sobic003G211233--Sobic003G064100 Sobic003G211233--Sobic002G280950 Sobic010G145100 Sobic010G145100 Sobic001G453600--Sobic010G145100 Sobic004G046800 Sobic004G046800 Sobic001G453600--Sobic004G046800 Sobic001G453600--Sobic006G093600 Sobic009G229400 Sobic009G229400 Sobic001G453600--Sobic009G229400 Sobic009G202000 Sobic009G202000 Sobic001G453600--Sobic009G202000 Sobic006G162400 Sobic006G162400 Sobic001G453600--Sobic006G162400 Sobic001G387300 Sobic001G387300 Sobic001G453600--Sobic001G387300 Sobic001G453600--Sobic003G024100 Sobic001G453600--Sobic009G061500 Sobic007G220150--Sobic010G140100 Sobic007G220150--Sobic008G019200 Sobic001G479700 Sobic001G479700 Sobic007G220150--Sobic001G479700 Sobic001G278100 Sobic001G278100 Sobic007G220150--Sobic001G278100 Sobic003G243300 Sobic003G243300 Sobic007G220150--Sobic003G243300 Sobic001G366700 Sobic001G366700 Sobic007G220150--Sobic001G366700 Sobic001G045400 Sobic001G045400 Sobic007G220150--Sobic001G045400 Sobic001G529800 Sobic001G529800 Sobic007G220150--Sobic001G529800 Sobic003G114900 Sobic003G114900 Sobic007G220150--Sobic003G114900
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.