Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G302800.1
Synonym Sb02g033320, ROPGEF3, ATROPGEF3
Functional annotation ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed
UniProt C5X8K2
Pfam PF03759
Panther DB PTHR33101 PTHR33101:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005089; Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G00460 : RHO guanyl-nucleotide exchange factor 3
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g29780.1 : ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048038
Brachypodium KQK16245
Barley HORVU6Hr1G092860.5 , HORVU6Hr1G092860.4 , HORVU6Hr1G092860.7 , HORVU6Hr1G092860.6 , HORVU6Hr1G092860.3 , HORVU6Hr1G092860.2 , HORVU6Hr1G092860.8
Wheat TraesCS6D02G388300 , TraesCS6B02G449200 , TraesCS6A02G405000
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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19 Sobic.007G137100 - -
20 Sobic.002G208900 glutamate receptor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant


Gene co-expression network
sample Sobic002G302800 Sobic002G302800 Sobic007G075600 Sobic007G075600 Sobic002G302800--Sobic007G075600 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic002G302800--Sobic002G208700 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic002G302800--Sobic003G329300 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic002G302800--Sobic009G176100 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic002G302800--Sobic007G096833 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic002G302800--Sobic006G215650 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic002G302800--Sobic002G033200 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic002G302800--Sobic004G118300 Sobic007G056300 Sobic007G056300 Sobic002G302800--Sobic007G056300 Sobic004G072201 Sobic004G072201 Sobic007G075600--Sobic004G072201 Sobic006G157450 Sobic006G157450 Sobic007G075600--Sobic006G157450 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic007G075600--Sobic001G038700 Sobic007G075600--Sobic002G302800 Sobic001G383200 Sobic001G383200 Sobic007G075600--Sobic001G383200 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic007G075600--Sobic001G090700 Sobic002G374000 Sobic002G374000 Sobic007G075600--Sobic002G374000 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic007G075600--Sobic001G191500 Sobic010G042300 Sobic010G042300 Sobic007G075600--Sobic010G042300 Sobic002G208700--Sobic006G215650 Sobic002G208700--Sobic010G042300 Sobic006G279100 Sobic006G279100 Sobic002G208700--Sobic006G279100 Sobic002G208700--Sobic003G329300 Sobic007G149500 Sobic007G149500 Sobic002G208700--Sobic007G149500 Sobic002G208700--Sobic001G090700 Sobic002G208700--Sobic002G302800 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic002G208700--Sobic007G137100 Sobic001G187900 Sobic001G187900 Sobic002G208700--Sobic001G187900 Sobic003G329300--Sobic007G137100 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic003G329300--Sobic008G085800 Sobic010G274700 Sobic010G274700 Sobic003G329300--Sobic010G274700 Sobic003G329300--Sobic009G176100 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic003G329300--Sobic007G174500 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic003G329300--Sobic002G171901 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic003G329300--Sobic005G182100 Sobic003G358150 Sobic003G358150 Sobic003G329300--Sobic003G358150 Sobic003G329300--Sobic002G033200 Sobic009G176100--Sobic008G085800 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic009G176100--Sobic006G111000 Sobic009G176100--Sobic007G096833 Sobic009G176100--Sobic003G329300 Sobic009G176100--Sobic002G171901 Sobic008G100900 Sobic008G100900 Sobic009G176100--Sobic008G100900 Sobic009G176100--Sobic007G174500 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic009G176100--Sobic004G117850 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic009G176100--Sobic010G142501 Sobic007G096833--Sobic009G176100 Sobic006G000200 Sobic006G000200 Sobic007G096833--Sobic006G000200 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic007G096833--Sobic003G399200 Sobic007G096833--Sobic004G117850 Sobic007G096833--Sobic006G111000 Sobic007G096833--Sobic002G302800 Sobic007G096833--Sobic010G142501 Sobic007G096833--Sobic007G056300 Sobic007G096833--Sobic004G118300 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic006G215650--Sobic002G046150 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic006G215650--Sobic002G208900 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic006G215650--Sobic002G129900 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic006G215650--Sobic003G230800 Sobic006G215650--Sobic002G208700 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic006G215650--Sobic004G180950 Sobic006G215650--Sobic009G176100 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic006G215650--Sobic003G219300 Sobic005G018400 Sobic005G018400 Sobic006G215650--Sobic005G018400 Sobic002G033200--Sobic004G118300 Sobic002G033200--Sobic003G329300 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic002G033200--Sobic004G030850 Sobic002G033200--Sobic004G117850 Sobic002G033200--Sobic006G111000 Sobic009G137401 Sobic009G137401 Sobic002G033200--Sobic009G137401 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic002G033200--Sobic008G113200 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic002G033200--Sobic010G088100 Sobic002G033200--Sobic001G090700 Sobic004G118300--Sobic002G033200 Sobic004G118300--Sobic004G117850 Sobic004G118300--Sobic003G329300 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic004G118300--Sobic007G203800 Sobic004G118300--Sobic007G137100 Sobic004G118300--Sobic006G111000 Sobic004G118300--Sobic002G171901 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic004G118300--Sobic007G225050 Sobic004G118300--Sobic009G176100 Sobic002G212900 Sobic002G212900 Sobic007G056300--Sobic002G212900 Sobic004G103200 Sobic004G103200 Sobic007G056300--Sobic004G103200 Sobic001G499350 Sobic001G499350 Sobic007G056300--Sobic001G499350 Sobic007G056300--Sobic009G176100 Sobic007G056300--Sobic006G111000 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic007G056300--Sobic003G368550 Sobic007G056300--Sobic007G096833 Sobic007G115700 Sobic007G115700 Sobic007G056300--Sobic007G115700 Sobic007G056300--Sobic002G129900
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