Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G082700.1
Synonym Sb08g008250
Functional annotation WW domain containing protein, expressed
UniProt C5YTZ5
Pfam -
Panther DB PTHR23181
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G78170 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g13100.1 : WW domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a054509 , Zm00025a025009
Brachypodium KQJ91780
Barley HORVU4Hr1G070580.1 , HORVU4Hr1G070580.3
Wheat TraesCS4D02G261300 , TraesCS4B02G261300 , TraesCS4A02G040300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G302800 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
2 Sobic.006G000200 - -
3 Sobic.002G208900 glutamate receptor, putative, expressed K05387: glutamate receptor, ionotropic, plant
4 Sobic.006G215650 - -
5 Sobic.004G030850 - -
6 Sobic.001G202550 - -
7 Sobic.006G021100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@L-ascorbate peroxidase (Os)(PubMedID : 27208977)@Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@OsAPx3 - Peroxisomal Ascorbate Peroxidase encoding gene 5,8, expressed K00434: L-ascorbate peroxidase
8 Sobic.005G018400 NB-ARC domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G118300 OsFBD15 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
10 Sobic.009G176100 - -
11 Sobic.003G336550 - -
12 Sobic.001G139800 growth regulating factor protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G129900 - -
14 Sobic.007G096833 - -
15 Sobic.004G084600 similar to Putative uncharacterized protein(PubMedID : 29862293)@AP2 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G053750 - -
17 Sobic.010G088100 ADP-ribosylation factor 1, putative, expressed K07977: Arf/Sar family, other
18 Sobic.008G086300 - -
19 Sobic.006G041200 - -
20 Sobic.006G111000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic008G082700 Sobic008G082700 Sobic002G302800 Sobic002G302800 Sobic008G082700--Sobic002G302800 Sobic006G000200 Sobic006G000200 Sobic008G082700--Sobic006G000200 Sobic002G208900 Sobic002G208900 Sobic008G082700--Sobic002G208900 Sobic006G215650 Sobic006G215650 Sobic008G082700--Sobic006G215650 Sobic004G030850 Sobic004G030850 Sobic008G082700--Sobic004G030850 Sobic001G202550 Sobic001G202550 Sobic008G082700--Sobic001G202550 Sobic006G021100 Sobic006G021100 Sobic008G082700--Sobic006G021100 Sobic005G018400 Sobic005G018400 Sobic008G082700--Sobic005G018400 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic008G082700--Sobic004G118300 Sobic007G075600 Sobic007G075600 Sobic002G302800--Sobic007G075600 Sobic002G208700 Sobic002G208700 Sobic002G302800--Sobic002G208700 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic002G302800--Sobic003G329300 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic002G302800--Sobic009G176100 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic002G302800--Sobic007G096833 Sobic002G302800--Sobic006G215650 Sobic002G033200 Sobic002G033200 Sobic002G302800--Sobic002G033200 Sobic002G302800--Sobic004G118300 Sobic007G056300 Sobic007G056300 Sobic002G302800--Sobic007G056300 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic006G000200--Sobic008G086300 Sobic006G000200--Sobic007G096833 Sobic006G000200--Sobic009G176100 Sobic002G129900 Sobic002G129900 Sobic006G000200--Sobic002G129900 Sobic003G336550 Sobic003G336550 Sobic006G000200--Sobic003G336550 Sobic006G000200--Sobic006G021100 Sobic006G000200--Sobic005G018400 Sobic006G000200--Sobic001G202550 Sobic006G000200--Sobic006G215650 Sobic002G208900--Sobic006G215650 Sobic008G169500 Sobic008G169500 Sobic002G208900--Sobic008G169500 Sobic002G208900--Sobic004G118300 Sobic001G150100 Sobic001G150100 Sobic002G208900--Sobic001G150100 Sobic007G038200 Sobic007G038200 Sobic002G208900--Sobic007G038200 Sobic002G208900--Sobic002G129900 Sobic002G208900--Sobic002G208700 Sobic006G280250 Sobic006G280250 Sobic002G208900--Sobic006G280250 Sobic002G208900--Sobic006G000200 Sobic002G046150 Sobic002G046150 Sobic006G215650--Sobic002G046150 Sobic006G215650--Sobic002G208900 Sobic006G215650--Sobic002G129900 Sobic003G230800 Sobic003G230800 Sobic006G215650--Sobic003G230800 Sobic006G215650--Sobic002G208700 Sobic004G180950 Sobic004G180950 Sobic006G215650--Sobic004G180950 Sobic006G215650--Sobic009G176100 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic006G215650--Sobic003G219300 Sobic006G215650--Sobic005G018400 Sobic004G030850--Sobic003G336550 Sobic004G084600 Sobic004G084600 Sobic004G030850--Sobic004G084600 Sobic010G088100 Sobic010G088100 Sobic004G030850--Sobic010G088100 Sobic008G113200 Sobic008G113200 Sobic004G030850--Sobic008G113200 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic004G030850--Sobic006G072701 Sobic004G255550 Sobic004G255550 Sobic004G030850--Sobic004G255550 Sobic002G171901 Sobic002G171901 Sobic004G030850--Sobic002G171901 Sobic003G053750 Sobic003G053750 Sobic004G030850--Sobic003G053750 Sobic006G041200 Sobic006G041200 Sobic004G030850--Sobic006G041200 Sobic004G008100 Sobic004G008100 Sobic001G202550--Sobic004G008100 Sobic001G202550--Sobic006G000200 Sobic001G047500 Sobic001G047500 Sobic001G202550--Sobic001G047500 Sobic005G031400 Sobic005G031400 Sobic001G202550--Sobic005G031400 Sobic001G202550--Sobic004G030850 Sobic001G202550--Sobic007G075600 Sobic001G202550--Sobic010G088100 Sobic003G358800 Sobic003G358800 Sobic001G202550--Sobic003G358800 Sobic001G202550--Sobic002G302800 Sobic006G021100--Sobic003G336550 Sobic006G021100--Sobic006G041200 Sobic007G089566 Sobic007G089566 Sobic006G021100--Sobic007G089566 Sobic006G021100--Sobic003G219300 Sobic007G203800 Sobic007G203800 Sobic006G021100--Sobic007G203800 Sobic002G226200 Sobic002G226200 Sobic006G021100--Sobic002G226200 Sobic006G021100--Sobic004G030850 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic006G021100--Sobic006G111000 Sobic006G021100--Sobic004G084600 Sobic005G018400--Sobic002G129900 Sobic009G199750 Sobic009G199750 Sobic005G018400--Sobic009G199750 Sobic005G018400--Sobic004G180950 Sobic002G200400 Sobic002G200400 Sobic005G018400--Sobic002G200400 Sobic001G283400 Sobic001G283400 Sobic005G018400--Sobic001G283400 Sobic003G368550 Sobic003G368550 Sobic005G018400--Sobic003G368550 Sobic006G097600 Sobic006G097600 Sobic005G018400--Sobic006G097600 Sobic005G018400--Sobic003G230800 Sobic008G129500 Sobic008G129500 Sobic005G018400--Sobic008G129500 Sobic004G118300--Sobic002G033200 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic004G118300--Sobic004G117850 Sobic004G118300--Sobic003G329300 Sobic004G118300--Sobic007G203800 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic004G118300--Sobic007G137100 Sobic004G118300--Sobic006G111000 Sobic004G118300--Sobic002G171901 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic004G118300--Sobic007G225050 Sobic004G118300--Sobic009G176100
Octagon: transcription factors


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