Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G347200.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QF31
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G107901 - K13104: ZNF830, zinc finger protein 830
2 Sobic.002G397700 - -
3 Sobic.003G172450 - -
4 Sobic.004G234766 - -
5 Sobic.002G322101 - -
6 Sobic.006G093550 - -
7 Sobic.006G139200 zinc knuckle family protein, expressed -
8 Sobic.002G325700 expressed protein -
9 Sobic.002G040550 - -
10 Sobic.007G149750 - -
11 Sobic.002G385601 - K01166: ribonuclease T2
12 Sobic.003G337200 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@pentatricopeptide repeat-containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.010G133225 - -
14 Sobic.001G249900 - -
15 Sobic.010G173600 cytokinin dehydrogenase precursor, putative, expressed K00279: cytokinin dehydrogenase
16 Sobic.003G255850 - -
17 Sobic.006G147350 - -
18 Sobic.008G140050 - -
19 Sobic.008G024900 expressed protein -
20 Sobic.010G225400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G347200 Sobic002G347200 Sobic010G107901 Sobic010G107901 Sobic002G347200--Sobic010G107901 Sobic002G397700 Sobic002G397700 Sobic002G347200--Sobic002G397700 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic002G347200--Sobic003G172450 Sobic004G234766 Sobic004G234766 Sobic002G347200--Sobic004G234766 Sobic002G322101 Sobic002G322101 Sobic002G347200--Sobic002G322101 Sobic006G093550 Sobic006G093550 Sobic002G347200--Sobic006G093550 Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic002G347200--Sobic006G139200 Sobic002G325700 Sobic002G325700 Sobic002G347200--Sobic002G325700 Sobic002G040550 Sobic002G040550 Sobic002G347200--Sobic002G040550 Sobic010G107901--Sobic002G397700 Sobic010G107901--Sobic004G234766 Sobic010G107901--Sobic003G172450 Sobic010G107901--Sobic006G093550 Sobic010G107901--Sobic002G322101 Sobic010G133225 Sobic010G133225 Sobic010G107901--Sobic010G133225 Sobic008G024900 Sobic008G024900 Sobic010G107901--Sobic008G024900 Sobic003G337200 Sobic003G337200 Sobic010G107901--Sobic003G337200 Sobic001G249900 Sobic001G249900 Sobic010G107901--Sobic001G249900 Sobic002G397700--Sobic010G107901 Sobic002G397700--Sobic004G234766 Sobic002G397700--Sobic006G093550 Sobic002G397700--Sobic003G172450 Sobic002G397700--Sobic002G322101 Sobic002G397700--Sobic010G133225 Sobic007G149750 Sobic007G149750 Sobic002G397700--Sobic007G149750 Sobic002G397700--Sobic001G249900 Sobic002G397700--Sobic003G337200 Sobic003G172450--Sobic010G107901 Sobic003G172450--Sobic006G139200 Sobic003G172450--Sobic002G397700 Sobic003G172450--Sobic002G040550 Sobic003G172450--Sobic004G234766 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic003G172450--Sobic002G390200 Sobic003G172450--Sobic006G093550 Sobic003G172450--Sobic008G024900 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic003G172450--Sobic010G225400 Sobic004G234766--Sobic010G107901 Sobic004G234766--Sobic002G397700 Sobic004G234766--Sobic006G093550 Sobic004G234766--Sobic002G322101 Sobic004G234766--Sobic003G172450 Sobic004G234766--Sobic007G149750 Sobic004G234766--Sobic001G249900 Sobic004G234766--Sobic010G133225 Sobic004G234766--Sobic003G337200 Sobic002G322101--Sobic006G093550 Sobic002G322101--Sobic007G149750 Sobic002G322101--Sobic004G234766 Sobic010G173600 Sobic010G173600 Sobic002G322101--Sobic010G173600 Sobic003G255850 Sobic003G255850 Sobic002G322101--Sobic003G255850 Sobic006G147350 Sobic006G147350 Sobic002G322101--Sobic006G147350 Sobic002G322101--Sobic001G249900 Sobic002G322101--Sobic002G397700 Sobic002G322101--Sobic010G107901 Sobic006G093550--Sobic002G322101 Sobic006G093550--Sobic004G234766 Sobic006G093550--Sobic002G397700 Sobic006G093550--Sobic010G107901 Sobic006G093550--Sobic001G249900 Sobic006G093550--Sobic007G149750 Sobic006G093550--Sobic006G147350 Sobic006G093550--Sobic010G133225 Sobic006G093550--Sobic010G173600 Sobic006G139200--Sobic002G040550 Sobic006G139200--Sobic003G172450 Sobic006G139200--Sobic002G390200 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic006G139200--Sobic002G180732 Sobic009G087480 Sobic009G087480 Sobic006G139200--Sobic009G087480 Sobic006G139200--Sobic010G107901 Sobic006G139200--Sobic002G397700 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic006G139200--Sobic003G160300 Sobic006G139200--Sobic004G234766 Sobic001G197200 Sobic001G197200 Sobic002G325700--Sobic001G197200 Sobic004G094900 Sobic004G094900 Sobic002G325700--Sobic004G094900 Sobic001G197300 Sobic001G197300 Sobic002G325700--Sobic001G197300 Sobic007G100032 Sobic007G100032 Sobic002G325700--Sobic007G100032 Sobic001G381400 Sobic001G381400 Sobic002G325700--Sobic001G381400 Sobic002G325700--Sobic002G347200 Sobic002G388800 Sobic002G388800 Sobic002G325700--Sobic002G388800 Sobic002G390000 Sobic002G390000 Sobic002G325700--Sobic002G390000 Sobic002G250900 Sobic002G250900 Sobic002G325700--Sobic002G250900 Sobic002G040550--Sobic006G139200 Sobic002G040550--Sobic003G172450 Sobic002G040550--Sobic002G390200 Sobic002G040550--Sobic002G180732 Sobic002G040550--Sobic009G087480 Sobic002G040550--Sobic010G107901 Sobic002G040550--Sobic002G397700 Sobic002G040550--Sobic003G160300 Sobic002G040550--Sobic004G234766
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.