Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G385601.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W7D8
Pfam PF00445
Panther DB PTHR11240 PTHR11240:SF18
NCBI CDD -
KEGG Orthology K01166; ribonuclease T2
Gene Ontology GO:0003723; RNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G02990 : ribonuclease 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g43670.1 : ribonuclease T2 family domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS2A02G157300 , TraesCS2D02G163100 , TraesCS2A02G157300
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G160300 - -
2 Sobic.002G390200 pentatricopeptide, putative, expressed -
3 Sobic.006G130100 nucleotide-sugar transporter family protein, putative, expressed -
4 Sobic.005G096450 - -
5 Sobic.005G116400 apocytochrome f precursor, putative, expressed K02634: apocytochrome f
6 Sobic.010G225400 expressed protein -
7 Sobic.008G140050 - -
8 Sobic.001G011600 glutathione S-transferase, putative, expressed -
9 Sobic.003G160433 - -
10 Sobic.002G040550 - -
11 Sobic.006G139200 zinc knuckle family protein, expressed -
12 Sobic.003G330350 - -
13 Sobic.003G172450 - -
14 Sobic.007G149200 "DEP1/GGC2(Ortholog in rice:Huang et al., 2009(PubMedID : 31659905)@keratin-associated protein 5-4, putative, expressed -
15 Sobic.003G113100 OsFBX320 - F-box domain containing protein, expressed -
16 Sobic.003G050100 polygalacturonase, putative, expressed -
17 Sobic.010G201266 - K05573: NAD(P)H-quinone oxidoreductase subunit 2
K02992: RP-S7, MRPS7, small subunit ribosomal protein S7
18 Sobic.001G054050 - -
19 Sobic.007G085900 - -
20 Sobic.003G369533 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G385601 Sobic002G385601 Sobic003G160300 Sobic003G160300 Sobic002G385601--Sobic003G160300 Sobic002G390200 Sobic002G390200 Sobic002G385601--Sobic002G390200 Sobic006G130100 Sobic006G130100 Sobic002G385601--Sobic006G130100 Sobic005G096450 Sobic005G096450 Sobic002G385601--Sobic005G096450 Sobic005G116400 Sobic005G116400 Sobic002G385601--Sobic005G116400 Sobic010G225400 Sobic010G225400 Sobic002G385601--Sobic010G225400 Sobic008G140050 Sobic008G140050 Sobic002G385601--Sobic008G140050 Sobic001G011600 Sobic001G011600 Sobic002G385601--Sobic001G011600 Sobic003G160433 Sobic003G160433 Sobic002G385601--Sobic003G160433 Sobic003G160300--Sobic003G160433 Sobic003G160300--Sobic002G390200 Sobic007G085900 Sobic007G085900 Sobic003G160300--Sobic007G085900 Sobic003G160400 Sobic003G160400 Sobic003G160300--Sobic003G160400 Sobic003G160300--Sobic008G140050 Sobic005G216900 Sobic005G216900 Sobic003G160300--Sobic005G216900 Sobic001G128000 Sobic001G128000 Sobic003G160300--Sobic001G128000 Sobic002G180732 Sobic002G180732 Sobic003G160300--Sobic002G180732 Sobic001G054050 Sobic001G054050 Sobic003G160300--Sobic001G054050 Sobic002G390200--Sobic003G160300 Sobic002G390200--Sobic003G160433 Sobic002G390200--Sobic002G180732 Sobic002G390200--Sobic007G085900 Sobic002G390200--Sobic003G160400 Sobic006G139200 Sobic006G139200 Sobic002G390200--Sobic006G139200 Sobic002G390200--Sobic008G140050 Sobic002G040550 Sobic002G040550 Sobic002G390200--Sobic002G040550 Sobic003G172450 Sobic003G172450 Sobic002G390200--Sobic003G172450 Sobic006G130100--Sobic001G054050 Sobic006G130100--Sobic010G225400 Sobic006G130100--Sobic001G011600 Sobic006G130100--Sobic002G390200 Sobic006G130100--Sobic003G160300 Sobic006G130100--Sobic003G160400 Sobic003G113100 Sobic003G113100 Sobic006G130100--Sobic003G113100 Sobic003G218950 Sobic003G218950 Sobic006G130100--Sobic003G218950 Sobic003G050100 Sobic003G050100 Sobic006G130100--Sobic003G050100 Sobic005G096450--Sobic005G116400 Sobic007G149200 Sobic007G149200 Sobic005G096450--Sobic007G149200 Sobic007G137501 Sobic007G137501 Sobic005G096450--Sobic007G137501 Sobic010G201266 Sobic010G201266 Sobic005G096450--Sobic010G201266 Sobic002G278100 Sobic002G278100 Sobic005G096450--Sobic002G278100 Sobic007G141650 Sobic007G141650 Sobic005G096450--Sobic007G141650 Sobic003G168200 Sobic003G168200 Sobic005G096450--Sobic003G168200 Sobic005G096450--Sobic010G225400 Sobic003G369533 Sobic003G369533 Sobic005G096450--Sobic003G369533 Sobic005G116400--Sobic010G201266 Sobic005G116400--Sobic007G149200 Sobic005G116400--Sobic002G278100 Sobic005G116400--Sobic003G168200 Sobic005G116400--Sobic003G369533 SobicK029400 SobicK029400 Sobic005G116400--SobicK029400 Sobic003G352000 Sobic003G352000 Sobic005G116400--Sobic003G352000 Sobic010G107601 Sobic010G107601 Sobic005G116400--Sobic010G107601 Sobic005G116400--Sobic007G141650 Sobic010G225400--Sobic010G201266 Sobic010G225400--Sobic007G141650 Sobic005G167100 Sobic005G167100 Sobic010G225400--Sobic005G167100 Sobic010G225400--Sobic002G278100 Sobic005G096500 Sobic005G096500 Sobic010G225400--Sobic005G096500 Sobic010G225400--Sobic010G107601 Sobic010G225400--Sobic008G140050 Sobic003G172400 Sobic003G172400 Sobic010G225400--Sobic003G172400 Sobic009G104850 Sobic009G104850 Sobic010G225400--Sobic009G104850 Sobic008G140050--Sobic007G085900 Sobic008G140050--Sobic003G160300 Sobic008G140050--Sobic003G160400 Sobic008G140050--Sobic005G167100 Sobic008G140050--Sobic003G352000 Sobic008G140050--Sobic010G225400 Sobic008G140050--Sobic002G390200 Sobic008G140050--SobicK029400 Sobic009G192200 Sobic009G192200 Sobic008G140050--Sobic009G192200 Sobic001G011600--Sobic010G225400 Sobic001G011600--Sobic006G130100 Sobic001G011600--Sobic003G218950 Sobic003G369566 Sobic003G369566 Sobic001G011600--Sobic003G369566 Sobic001G011600--Sobic007G137501 Sobic001G011600--Sobic003G369533 Sobic001G519700 Sobic001G519700 Sobic001G011600--Sobic001G519700 Sobic001G011600--Sobic005G116400 Sobic001G011600--Sobic003G050100 Sobic003G160433--Sobic003G160300 Sobic003G160433--Sobic002G390200 Sobic003G160433--Sobic007G085900 Sobic003G160433--Sobic001G128000 Sobic003G160433--Sobic005G216900 Sobic003G160433--Sobic002G180732 Sobic003G160433--Sobic003G160400 Sobic003G160433--Sobic001G054050 Sobic003G160433--Sobic008G140050
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.