Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G394550.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W7J0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G06950 : bZIP transcription factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g17260.1 : transcription factor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G257800 - -
2 Sobic.003G091850 - -
3 Sobic.001G477500 - -
4 Sobic.001G209550 - -
5 Sobic.002G059700 Rf1, mitochondrial precursor, putative, expressed -
6 Sobic.010G262950 - -
7 Sobic.002G070500 anthocyanidin 3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
8 Sobic.005G130500 terpene synthase, putative, expressed -
9 Sobic.008G109650 - -
10 Sobic.003G314566 - -
11 Sobic.002G162601 - -
12 Sobic.006G167250 - -
13 Sobic.007G178300 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
14 Sobic.003G395600 CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed K16075: MRS2, magnesium transporter
15 Sobic.003G245000 expressed protein -
16 Sobic.008G176266 - -
17 Sobic.002G347850 - -
18 Sobic.004G007166 - -
19 Sobic.002G284600 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsSAUR39 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
20 Sobic.001G311400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G394550 Sobic002G394550 Sobic003G257800 Sobic003G257800 Sobic002G394550--Sobic003G257800 Sobic003G091850 Sobic003G091850 Sobic002G394550--Sobic003G091850 Sobic001G477500 Sobic001G477500 Sobic002G394550--Sobic001G477500 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic002G394550--Sobic001G209550 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic002G394550--Sobic002G059700 Sobic010G262950 Sobic010G262950 Sobic002G394550--Sobic010G262950 Sobic002G070500 Sobic002G070500 Sobic002G394550--Sobic002G070500 Sobic005G130500 Sobic005G130500 Sobic002G394550--Sobic005G130500 Sobic008G109650 Sobic008G109650 Sobic002G394550--Sobic008G109650 Sobic003G257800--Sobic002G394550 Sobic003G257800--Sobic003G091850 Sobic003G081601 Sobic003G081601 Sobic003G257800--Sobic003G081601 Sobic002G054901 Sobic002G054901 Sobic003G257800--Sobic002G054901 Sobic006G123600 Sobic006G123600 Sobic003G257800--Sobic006G123600 Sobic009G228201 Sobic009G228201 Sobic003G257800--Sobic009G228201 Sobic002G284600 Sobic002G284600 Sobic003G257800--Sobic002G284600 Sobic005G108300 Sobic005G108300 Sobic003G257800--Sobic005G108300 Sobic002G417700 Sobic002G417700 Sobic003G257800--Sobic002G417700 Sobic008G182500 Sobic008G182500 Sobic003G091850--Sobic008G182500 Sobic003G091850--Sobic002G394550 Sobic003G091850--Sobic003G257800 Sobic008G178300 Sobic008G178300 Sobic003G091850--Sobic008G178300 Sobic003G091850--Sobic005G108300 Sobic006G062400 Sobic006G062400 Sobic003G091850--Sobic006G062400 Sobic004G046001 Sobic004G046001 Sobic003G091850--Sobic004G046001 Sobic010G104200 Sobic010G104200 Sobic003G091850--Sobic010G104200 Sobic003G091850--Sobic002G284600 Sobic003G390000 Sobic003G390000 Sobic001G477500--Sobic003G390000 Sobic002G221000 Sobic002G221000 Sobic001G477500--Sobic002G221000 Sobic001G477500--Sobic002G070500 Sobic001G477500--Sobic001G209550 Sobic001G070900 Sobic001G070900 Sobic001G477500--Sobic001G070900 Sobic001G477500--Sobic002G059700 Sobic004G007166 Sobic004G007166 Sobic001G477500--Sobic004G007166 Sobic004G272000 Sobic004G272000 Sobic001G477500--Sobic004G272000 Sobic008G176266 Sobic008G176266 Sobic001G477500--Sobic008G176266 Sobic001G209550--Sobic002G059700 Sobic001G209550--Sobic002G070500 Sobic006G147101 Sobic006G147101 Sobic001G209550--Sobic006G147101 Sobic002G347850 Sobic002G347850 Sobic001G209550--Sobic002G347850 Sobic001G209550--Sobic008G109650 Sobic005G134900 Sobic005G134900 Sobic001G209550--Sobic005G134900 Sobic001G208166 Sobic001G208166 Sobic001G209550--Sobic001G208166 Sobic004G080901 Sobic004G080901 Sobic001G209550--Sobic004G080901 Sobic002G162601 Sobic002G162601 Sobic001G209550--Sobic002G162601 Sobic002G059700--Sobic001G209550 Sobic002G059700--Sobic002G070500 Sobic002G059700--Sobic005G134900 Sobic002G059700--Sobic006G147101 Sobic002G059700--Sobic002G347850 Sobic002G059700--Sobic008G109650 Sobic002G059700--Sobic001G208166 Sobic001G230600 Sobic001G230600 Sobic002G059700--Sobic001G230600 Sobic010G034700 Sobic010G034700 Sobic002G059700--Sobic010G034700 Sobic006G222200 Sobic006G222200 Sobic010G262950--Sobic006G222200 Sobic001G221750 Sobic001G221750 Sobic010G262950--Sobic001G221750 Sobic003G245000 Sobic003G245000 Sobic010G262950--Sobic003G245000 Sobic002G033100 Sobic002G033100 Sobic010G262950--Sobic002G033100 Sobic005G150250 Sobic005G150250 Sobic010G262950--Sobic005G150250 Sobic006G155400 Sobic006G155400 Sobic010G262950--Sobic006G155400 Sobic001G084133 Sobic001G084133 Sobic010G262950--Sobic001G084133 Sobic001G421450 Sobic001G421450 Sobic010G262950--Sobic001G421450 Sobic003G193900 Sobic003G193900 Sobic010G262950--Sobic003G193900 Sobic002G070500--Sobic002G059700 Sobic002G070500--Sobic004G007166 Sobic002G070500--Sobic001G209550 Sobic002G070500--Sobic005G134900 Sobic001G210101 Sobic001G210101 Sobic002G070500--Sobic001G210101 Sobic008G187450 Sobic008G187450 Sobic002G070500--Sobic008G187450 Sobic002G070500--Sobic008G176266 Sobic001G387400 Sobic001G387400 Sobic002G070500--Sobic001G387400 Sobic009G028650 Sobic009G028650 Sobic002G070500--Sobic009G028650 Sobic008G145400 Sobic008G145400 Sobic005G130500--Sobic008G145400 Sobic003G174601 Sobic003G174601 Sobic005G130500--Sobic003G174601 Sobic004G120866 Sobic004G120866 Sobic005G130500--Sobic004G120866 Sobic006G167250 Sobic006G167250 Sobic005G130500--Sobic006G167250 Sobic005G130500--Sobic010G104200 Sobic007G111901 Sobic007G111901 Sobic005G130500--Sobic007G111901 Sobic006G045800 Sobic006G045800 Sobic005G130500--Sobic006G045800 Sobic004G080700 Sobic004G080700 Sobic005G130500--Sobic004G080700 Sobic001G216900 Sobic001G216900 Sobic005G130500--Sobic001G216900 Sobic008G109650--Sobic003G245000 Sobic008G109650--Sobic001G209550 Sobic008G109650--Sobic001G208166 Sobic008G109650--Sobic006G147101 Sobic002G321000 Sobic002G321000 Sobic008G109650--Sobic002G321000 Sobic008G109650--Sobic002G059700 Sobic008G109650--Sobic001G084133 Sobic008G109650--Sobic004G272000 Sobic008G109650--Sobic002G347850
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.