Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G257800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q5B5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G394550 - -
2 Sobic.003G091850 - -
3 Sobic.003G081601 - -
4 Sobic.002G054901 - -
5 Sobic.006G123600 transcriptional regulator Sir2 family protein, putative, expressed K11416: SIRT6, NAD+-dependent protein deacetylase sirtuin 6
6 Sobic.009G228201 - -
7 Sobic.002G284600 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@OsSAUR39 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
8 Sobic.005G108300 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expression induced by BR treatment"(PubMedID : 20499123)@OsGH3.3 - Probable indole-3-acetic acid-amido synthetase, expressed K14506: jasmonic acid-amino synthetase
9 Sobic.002G417700 DUF623 domain containing protein, expressed -
10 Sobic.010G260900 - -
11 Sobic.003G263600 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
12 Sobic.008G182500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@thaumatin, putative, expressed -
13 Sobic.009G237350 - -
14 Sobic.005G124850 - -
15 Sobic.008G178300 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
16 Sobic.009G205000 pentatricopeptide repeat protein PPR986-12, putative, expressed -
17 Sobic.008G178200 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G079100 - -
19 Sobic.010G035801 - -
20 Sobic.003G031750 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G257800 Sobic003G257800 Sobic002G394550 Sobic002G394550 Sobic003G257800--Sobic002G394550 Sobic003G091850 Sobic003G091850 Sobic003G257800--Sobic003G091850 Sobic003G081601 Sobic003G081601 Sobic003G257800--Sobic003G081601 Sobic002G054901 Sobic002G054901 Sobic003G257800--Sobic002G054901 Sobic006G123600 Sobic006G123600 Sobic003G257800--Sobic006G123600 Sobic009G228201 Sobic009G228201 Sobic003G257800--Sobic009G228201 Sobic002G284600 Sobic002G284600 Sobic003G257800--Sobic002G284600 Sobic005G108300 Sobic005G108300 Sobic003G257800--Sobic005G108300 Sobic002G417700 Sobic002G417700 Sobic003G257800--Sobic002G417700 Sobic002G394550--Sobic003G257800 Sobic002G394550--Sobic003G091850 Sobic001G477500 Sobic001G477500 Sobic002G394550--Sobic001G477500 Sobic001G209550 Sobic001G209550 Sobic002G394550--Sobic001G209550 Sobic002G059700 Sobic002G059700 Sobic002G394550--Sobic002G059700 Sobic010G262950 Sobic010G262950 Sobic002G394550--Sobic010G262950 Sobic002G070500 Sobic002G070500 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Octagon: transcription factors


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