Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G026900.1,Sobic.003G026900.5,Sobic.003G026900.4,Sobic.003G026900.3,Sobic.003G026900.6,Sobic.003G026900.2
Synonym Sb03g002520
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0VVJ0 , A0A1W0VVH0 , A0A1W0VVI5
Pfam -
Panther DB PTHR36892 PTHR36892:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G58770 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g10530.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022984
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G075700 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G131800 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, putative, expressed K03006: RPB1, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
3 Sobic.009G132650 - -
4 Sobic.001G067000 expressed protein K12606: RCD1, CNOT9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9
5 Sobic.006G186300 fasciclin-like arabinogalactan protein, putative, expressed -
6 Sobic.006G061100 CBS domain containing membrane protein, putative, expressed -
7 Sobic.002G230400 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase domain containing protein, expressed K11855: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36/42
8 Sobic.006G161300 vacuolar-processing enzyme precursor, putative, expressed K01369: legumain
9 Sobic.005G176875 - -
10 Sobic.010G047300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
11 Sobic.001G269650 - -
12 Sobic.010G207400 protein kinase domain containing protein, expressed -
13 Sobic.008G156200 zinc finger family protein, putative, expressed K16277: E3 ubiquitin-protein ligase DRIP
14 Sobic.007G066200 - -
15 Sobic.010G133150 - -
16 Sobic.001G123201 - -
17 Sobic.001G305100 pectinacetylesterase domain containing protein, expressed -
18 Sobic.002G015500 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G495700 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
20 Sobic.001G278700 Inositol 1, 3, 4-trisphosphate 5/6-kinase, putative, expressed K00913: inositol-1,3,4-trisphosphate 5/6-kinase / inositol-tetrakisphosphate 1-kinase


Gene co-expression network
sample Sobic003G026900 Sobic003G026900 Sobic004G075700 Sobic004G075700 Sobic003G026900--Sobic004G075700 Sobic005G131800 Sobic005G131800 Sobic003G026900--Sobic005G131800 Sobic009G132650 Sobic009G132650 Sobic003G026900--Sobic009G132650 Sobic001G067000 Sobic001G067000 Sobic003G026900--Sobic001G067000 Sobic006G186300 Sobic006G186300 Sobic003G026900--Sobic006G186300 Sobic006G061100 Sobic006G061100 Sobic003G026900--Sobic006G061100 Sobic002G230400 Sobic002G230400 Sobic003G026900--Sobic002G230400 Sobic006G161300 Sobic006G161300 Sobic003G026900--Sobic006G161300 Sobic005G176875 Sobic005G176875 Sobic003G026900--Sobic005G176875 Sobic004G075700--Sobic006G186300 Sobic010G207400 Sobic010G207400 Sobic004G075700--Sobic010G207400 Sobic006G015800 Sobic006G015800 Sobic004G075700--Sobic006G015800 Sobic001G305100 Sobic001G305100 Sobic004G075700--Sobic001G305100 Sobic001G278700 Sobic001G278700 Sobic004G075700--Sobic001G278700 Sobic004G075700--Sobic003G026900 Sobic004G075700--Sobic006G061100 Sobic004G075700--Sobic006G161300 Sobic004G075700--Sobic005G131800 Sobic005G131800--Sobic006G161300 Sobic010G112700 Sobic010G112700 Sobic005G131800--Sobic010G112700 Sobic005G131800--Sobic001G305100 Sobic005G131800--Sobic006G186300 Sobic002G286800 Sobic002G286800 Sobic005G131800--Sobic002G286800 Sobic005G131800--Sobic004G075700 Sobic001G183100 Sobic001G183100 Sobic005G131800--Sobic001G183100 Sobic006G040101 Sobic006G040101 Sobic005G131800--Sobic006G040101 Sobic007G025100 Sobic007G025100 Sobic005G131800--Sobic007G025100 Sobic009G132650--Sobic005G176875 Sobic009G060300 Sobic009G060300 Sobic009G132650--Sobic009G060300 Sobic002G273000 Sobic002G273000 Sobic009G132650--Sobic002G273000 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic009G132650--Sobic004G071100 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic009G132650--Sobic002G015500 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic009G132650--Sobic005G184500 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic009G132650--Sobic008G184500 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic009G132650--Sobic005G033400 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic009G132650--Sobic003G319050 Sobic001G067000--Sobic003G026900 Sobic006G143300 Sobic006G143300 Sobic001G067000--Sobic006G143300 Sobic002G420800 Sobic002G420800 Sobic001G067000--Sobic002G420800 Sobic001G067000--Sobic002G230400 Sobic007G076500 Sobic007G076500 Sobic001G067000--Sobic007G076500 Sobic002G147466 Sobic002G147466 Sobic001G067000--Sobic002G147466 Sobic004G196800 Sobic004G196800 Sobic001G067000--Sobic004G196800 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic001G067000--Sobic007G199500 Sobic010G193700 Sobic010G193700 Sobic001G067000--Sobic010G193700 Sobic010G047300 Sobic010G047300 Sobic006G186300--Sobic010G047300 Sobic007G041200 Sobic007G041200 Sobic006G186300--Sobic007G041200 Sobic002G122000 Sobic002G122000 Sobic006G186300--Sobic002G122000 Sobic006G186300--Sobic004G075700 Sobic006G186300--Sobic002G230400 Sobic010G084800 Sobic010G084800 Sobic006G186300--Sobic010G084800 Sobic006G186300--Sobic001G305100 Sobic006G186300--Sobic005G131800 Sobic005G171800 Sobic005G171800 Sobic006G186300--Sobic005G171800 Sobic006G061100--Sobic004G075700 Sobic006G061100--Sobic003G026900 Sobic006G061100--Sobic009G060300 Sobic006G061100--Sobic010G207400 Sobic006G015500 Sobic006G015500 Sobic006G061100--Sobic006G015500 Sobic004G154300 Sobic004G154300 Sobic006G061100--Sobic004G154300 Sobic009G113100 Sobic009G113100 Sobic006G061100--Sobic009G113100 Sobic004G311400 Sobic004G311400 Sobic006G061100--Sobic004G311400 Sobic006G061100--Sobic009G132650 Sobic002G354800 Sobic002G354800 Sobic002G230400--Sobic002G354800 Sobic002G230400--Sobic006G186300 Sobic002G230400--Sobic004G075700 Sobic002G230400--Sobic006G143300 Sobic004G014100 Sobic004G014100 Sobic002G230400--Sobic004G014100 Sobic004G163700 Sobic004G163700 Sobic002G230400--Sobic004G163700 Sobic002G230400--Sobic010G112700 Sobic002G343000 Sobic002G343000 Sobic002G230400--Sobic002G343000 Sobic010G273800 Sobic010G273800 Sobic002G230400--Sobic010G273800 Sobic005G035500 Sobic005G035500 Sobic006G161300--Sobic005G035500 Sobic002G217000 Sobic002G217000 Sobic006G161300--Sobic002G217000 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic006G161300--Sobic002G058900 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic006G161300--Sobic002G059500 Sobic006G004100 Sobic006G004100 Sobic006G161300--Sobic006G004100 Sobic006G161300--Sobic006G040101 Sobic002G101200 Sobic002G101200 Sobic006G161300--Sobic002G101200 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic006G161300--Sobic008G159300 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic006G161300--Sobic003G266100 Sobic005G176875--Sobic008G184500 Sobic001G269650 Sobic001G269650 Sobic005G176875--Sobic001G269650 Sobic005G176875--Sobic002G015500 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic005G176875--Sobic002G097100 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic005G176875--Sobic001G495700 Sobic005G176875--Sobic003G319050 Sobic005G176875--Sobic004G071100 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic005G176875--Sobic010G133150 Sobic005G176875--Sobic007G199500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.