Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G046200.2
Synonym Sb03g004030
Functional annotation ATPase, putative, expressed
UniProt A0A1B6Q1A4
Pfam PF00004 PF14363
Panther DB PTHR23070 PTHR23070:SF27
NCBI CDD KOG0743; AAA+-type ATPase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005524; ATP binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G28610 : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g09470.1 : ATPase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a016039 , Zm00025a045292 , Zm00025a004879 , Zm00025a004881 , Zm00025a008606
Brachypodium PNT76855 , KQJ90448 , KQK20482 , KQK20481 , PNT76854 , PNT76856 , PNT76857 , KQJ98547 , KQJ90344 , KQK20476 , KQK20474
Barley HORVU3Hr1G086670.1 , HORVU3Hr1G086670.2 , HORVU3Hr1G086670.3 , HORVU3Hr1G086670.4 , HORVU3Hr1G086670.5 , HORVU6Hr1G021770.3 , HORVU6Hr1G021770.2 , HORVU6Hr1G021770.1 , HORVU6Hr1G021770.4 , HORVU5Hr1G107410.2 , HORVU5Hr1G107410.3 , HORVU5Hr1G107410.4 , HORVU6Hr1G093350.1
Wheat TraesCS3A02G357100 , TraesCS3B02G389700 , TraesCS3D02G350900 , TraesCS3D02G351000 , TraesCS1D02G438800 , TraesCS3A02G356800
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Gene co-expression network
sample Sobic003G046200 Sobic003G046200 Sobic003G154800 Sobic003G154800 Sobic003G046200--Sobic003G154800 Sobic007G100900 Sobic007G100900 Sobic003G046200--Sobic007G100900 Sobic001G349800 Sobic001G349800 Sobic003G046200--Sobic001G349800 Sobic001G393600 Sobic001G393600 Sobic003G046200--Sobic001G393600 Sobic006G088500 Sobic006G088500 Sobic003G046200--Sobic006G088500 Sobic004G327100 Sobic004G327100 Sobic003G046200--Sobic004G327100 Sobic002G013500 Sobic002G013500 Sobic003G046200--Sobic002G013500 Sobic008G024000 Sobic008G024000 Sobic003G046200--Sobic008G024000 Sobic010G065500 Sobic010G065500 Sobic003G046200--Sobic010G065500 Sobic003G154800--Sobic007G100900 Sobic003G154800--Sobic003G046200 Sobic003G318650 Sobic003G318650 Sobic003G154800--Sobic003G318650 Sobic003G154800--Sobic002G013500 Sobic002G085700 Sobic002G085700 Sobic003G154800--Sobic002G085700 Sobic010G140800 Sobic010G140800 Sobic003G154800--Sobic010G140800 Sobic003G154800--Sobic004G327100 Sobic003G154800--Sobic001G349800 Sobic005G201800 Sobic005G201800 Sobic003G154800--Sobic005G201800 Sobic007G100900--Sobic004G327100 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic007G100900--Sobic004G122700 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic007G100900--Sobic008G008701 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic007G100900--Sobic005G207550 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic007G100900--Sobic001G138500 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic007G100900--Sobic001G190600 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic007G100900--Sobic008G008601 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic007G100900--Sobic006G137900 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic007G100900--Sobic004G090900 Sobic001G349800--Sobic003G154800 Sobic001G349800--Sobic003G046200 Sobic001G349800--Sobic001G393600 Sobic009G194100 Sobic009G194100 Sobic001G349800--Sobic009G194100 Sobic008G147800 Sobic008G147800 Sobic001G349800--Sobic008G147800 Sobic001G349800--Sobic007G100900 Sobic003G298500 Sobic003G298500 Sobic001G349800--Sobic003G298500 Sobic009G190900 Sobic009G190900 Sobic001G349800--Sobic009G190900 Sobic005G030200 Sobic005G030200 Sobic001G349800--Sobic005G030200 Sobic001G393600--Sobic010G065500 Sobic001G393600--Sobic004G327100 Sobic002G070400 Sobic002G070400 Sobic001G393600--Sobic002G070400 Sobic001G393600--Sobic006G088500 Sobic004G082050 Sobic004G082050 Sobic001G393600--Sobic004G082050 Sobic001G393600--Sobic007G100900 Sobic003G407400 Sobic003G407400 Sobic001G393600--Sobic003G407400 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic001G393600--Sobic005G013700 Sobic003G066250 Sobic003G066250 Sobic001G393600--Sobic003G066250 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic006G088500--Sobic007G120600 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic006G088500--Sobic004G052700 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic006G088500--Sobic008G096401 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic006G088500--Sobic001G060001 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic006G088500--Sobic010G267651 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic006G088500--Sobic004G181100 Sobic002G188800 Sobic002G188800 Sobic006G088500--Sobic002G188800 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic006G088500--Sobic010G146350 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic006G088500--Sobic005G207600 Sobic004G327100--Sobic004G122700 Sobic004G327100--Sobic005G207550 Sobic004G327100--Sobic006G137900 Sobic004G327100--Sobic008G008701 Sobic004G327100--Sobic001G138500 Sobic004G327100--Sobic008G008601 Sobic004G327100--Sobic001G190600 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic004G327100--Sobic001G452300 Sobic004G327100--Sobic004G090900 Sobic002G013500--Sobic007G100900 Sobic006G076700 Sobic006G076700 Sobic002G013500--Sobic006G076700 Sobic004G184900 Sobic004G184900 Sobic002G013500--Sobic004G184900 Sobic003G046000 Sobic003G046000 Sobic002G013500--Sobic003G046000 Sobic008G053700 Sobic008G053700 Sobic002G013500--Sobic008G053700 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic002G013500--Sobic008G069901 Sobic001G177500 Sobic001G177500 Sobic002G013500--Sobic001G177500 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic002G013500--Sobic005G014600 Sobic009G113300 Sobic009G113300 Sobic002G013500--Sobic009G113300 Sobic008G024000--Sobic007G100900 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic008G024000--Sobic003G120050 Sobic008G024000--Sobic006G137900 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic008G024000--Sobic004G013400 Sobic008G024000--Sobic001G138500 Sobic008G024000--Sobic008G008601 Sobic008G024000--Sobic004G122700 Sobic008G024000--Sobic001G452300 Sobic008G024000--Sobic001G190600 Sobic010G065500--Sobic006G137900 Sobic010G065500--Sobic008G008601 Sobic010G065500--Sobic005G013700 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic010G065500--Sobic002G063500 Sobic010G065500--Sobic001G452300 Sobic010G065500--Sobic003G120050 Sobic010G065500--Sobic004G122700 Sobic010G065500--Sobic004G013400 Sobic010G065500--Sobic002G070400
Octagon: transcription factors


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