Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G079700.1
Synonym Sb03g006715
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence. (PubMedID : 27586543)
Ser/Thr protein kinase, putative, expressed
UniProt C5XQP3
Pfam PF14380 PF13947 PF00069
Panther DB PTHR27009 PTHR27009:SF10
NCBI CDD KOG1187; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006468; protein phosphorylation GO:0005524ATP binding GO:0004672protein kinase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G66910 : Protein kinase superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g04570.1 : Ser/Thr protein kinase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023543
Brachypodium -
Barley HORVU3Hr1G007720.1 , HORVU3Hr1G007720.3 , HORVU3Hr1G007720.2 , HORVU3Hr1G007720.5 , HORVU3Hr1G007720.4
Wheat TraesCS3B02G057300 , TraesCS7D02G158100 , TraesCS4A02G499400 , TraesCS7A02G000600 , TraesCS3B02G058000
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G275600 resistance protein, putative, expressed -
2 Sobic.007G096833 - -
3 Sobic.008G042400 - -
4 Sobic.007G174000 carrier, putative, expressed -
5 Sobic.003G033300 expressed protein -
6 Sobic.001G037550 - -
7 Sobic.003G399200 peptide transporter PTR2, putative, expressed -
8 Sobic.010G263101 - -
9 Sobic.005G083400 expressed protein -
10 Sobic.004G203633 - -
11 Sobic.010G142501 - -
12 Sobic.003G368450 - -
13 Sobic.001G355700 - -
14 Sobic.009G011000 SCARECROW, putative, expressed -
15 Sobic.004G045700 phytosulfokine receptor precursor, putative, expressed -
16 Sobic.009G011100 SCARECROW, putative, expressed -
17 Sobic.007G174500 carrier, putative, expressed -
18 Sobic.006G103800 AGC_PVPK_like_CDK8.1 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed -
19 Sobic.001G174300 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
20 Sobic.006G075200 Aluminium activated malate transporter("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@aluminum-activated malate transporter, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G079700 Sobic003G079700 Sobic010G275600 Sobic010G275600 Sobic003G079700--Sobic010G275600 Sobic007G096833 Sobic007G096833 Sobic003G079700--Sobic007G096833 Sobic008G042400 Sobic008G042400 Sobic003G079700--Sobic008G042400 Sobic007G174000 Sobic007G174000 Sobic003G079700--Sobic007G174000 Sobic003G033300 Sobic003G033300 Sobic003G079700--Sobic003G033300 Sobic001G037550 Sobic001G037550 Sobic003G079700--Sobic001G037550 Sobic003G399200 Sobic003G399200 Sobic003G079700--Sobic003G399200 Sobic010G263101 Sobic010G263101 Sobic003G079700--Sobic010G263101 Sobic005G083400 Sobic005G083400 Sobic003G079700--Sobic005G083400 Sobic010G275600--Sobic001G037550 Sobic010G275600--Sobic010G263101 Sobic003G350000 Sobic003G350000 Sobic010G275600--Sobic003G350000 Sobic010G275600--Sobic008G042400 Sobic010G275600--Sobic003G079700 Sobic001G075900 Sobic001G075900 Sobic010G275600--Sobic001G075900 Sobic008G083650 Sobic008G083650 Sobic010G275600--Sobic008G083650 Sobic003G368450 Sobic003G368450 Sobic010G275600--Sobic003G368450 Sobic010G236800 Sobic010G236800 Sobic010G275600--Sobic010G236800 Sobic009G176100 Sobic009G176100 Sobic007G096833--Sobic009G176100 Sobic006G000200 Sobic006G000200 Sobic007G096833--Sobic006G000200 Sobic007G096833--Sobic003G399200 Sobic004G117850 Sobic004G117850 Sobic007G096833--Sobic004G117850 Sobic006G111000 Sobic006G111000 Sobic007G096833--Sobic006G111000 Sobic002G302800 Sobic002G302800 Sobic007G096833--Sobic002G302800 Sobic010G142501 Sobic010G142501 Sobic007G096833--Sobic010G142501 Sobic007G056300 Sobic007G056300 Sobic007G096833--Sobic007G056300 Sobic004G118300 Sobic004G118300 Sobic007G096833--Sobic004G118300 Sobic008G042400--Sobic003G368450 Sobic007G155950 Sobic007G155950 Sobic008G042400--Sobic007G155950 Sobic008G042400--Sobic004G117850 Sobic009G192450 Sobic009G192450 Sobic008G042400--Sobic009G192450 Sobic008G042400--Sobic007G174000 Sobic004G203633 Sobic004G203633 Sobic008G042400--Sobic004G203633 Sobic001G073550 Sobic001G073550 Sobic008G042400--Sobic001G073550 Sobic004G127766 Sobic004G127766 Sobic008G042400--Sobic004G127766 Sobic008G042400--Sobic010G275600 Sobic008G078500 Sobic008G078500 Sobic007G174000--Sobic008G078500 Sobic007G174000--Sobic004G203633 Sobic007G174000--Sobic003G399200 Sobic007G174000--Sobic007G155950 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic007G174000--Sobic004G357600 Sobic005G182100 Sobic005G182100 Sobic007G174000--Sobic005G182100 Sobic007G225050 Sobic007G225050 Sobic007G174000--Sobic007G225050 Sobic007G137100 Sobic007G137100 Sobic007G174000--Sobic007G137100 Sobic001G093732 Sobic001G093732 Sobic007G174000--Sobic001G093732 Sobic004G267950 Sobic004G267950 Sobic003G033300--Sobic004G267950 Sobic001G193700 Sobic001G193700 Sobic003G033300--Sobic001G193700 Sobic004G345200 Sobic004G345200 Sobic003G033300--Sobic004G345200 Sobic001G102901 Sobic001G102901 Sobic003G033300--Sobic001G102901 Sobic003G033300--Sobic003G079700 Sobic001G463650 Sobic001G463650 Sobic003G033300--Sobic001G463650 Sobic003G033300--Sobic010G236800 Sobic002G035100 Sobic002G035100 Sobic003G033300--Sobic002G035100 Sobic008G151900 Sobic008G151900 Sobic003G033300--Sobic008G151900 Sobic001G037550--Sobic010G275600 Sobic008G108000 Sobic008G108000 Sobic001G037550--Sobic008G108000 Sobic001G037550--Sobic010G263101 Sobic001G040701 Sobic001G040701 Sobic001G037550--Sobic001G040701 Sobic001G037550--Sobic008G083650 Sobic001G037550--Sobic001G075900 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic001G037550--Sobic007G124800 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic001G037550--Sobic008G086300 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic001G037550--Sobic002G367850 Sobic003G399200--Sobic007G137100 Sobic007G174500 Sobic007G174500 Sobic003G399200--Sobic007G174500 Sobic003G399200--Sobic004G118300 Sobic001G521800 Sobic001G521800 Sobic003G399200--Sobic001G521800 Sobic003G399200--Sobic007G096833 Sobic008G085800 Sobic008G085800 Sobic003G399200--Sobic008G085800 Sobic003G329300 Sobic003G329300 Sobic003G399200--Sobic003G329300 Sobic003G399200--Sobic004G117850 Sobic003G399200--Sobic007G174000 Sobic006G249800 Sobic006G249800 Sobic010G263101--Sobic006G249800 Sobic010G263101--Sobic003G350000 Sobic010G263101--Sobic010G275600 Sobic010G263101--Sobic008G083650 Sobic010G263101--Sobic001G037550 Sobic010G263101--Sobic001G463650 Sobic006G123100 Sobic006G123100 Sobic010G263101--Sobic006G123100 Sobic010G263101--Sobic001G102901 Sobic010G067950 Sobic010G067950 Sobic010G263101--Sobic010G067950 Sobic006G103800 Sobic006G103800 Sobic005G083400--Sobic006G103800 Sobic008G064200 Sobic008G064200 Sobic005G083400--Sobic008G064200 Sobic006G027800 Sobic006G027800 Sobic005G083400--Sobic006G027800 Sobic010G201444 Sobic010G201444 Sobic005G083400--Sobic010G201444 Sobic006G075200 Sobic006G075200 Sobic005G083400--Sobic006G075200 Sobic007G175600 Sobic007G175600 Sobic005G083400--Sobic007G175600 Sobic009G218450 Sobic009G218450 Sobic005G083400--Sobic009G218450 Sobic005G083400--Sobic004G203633 Sobic002G365300 Sobic002G365300 Sobic005G083400--Sobic002G365300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.