Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G130100.1
Synonym Sb03g011070
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q2W0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g26510.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024131
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G130100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G328800 transferase family protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G003300 ABC-2 type transporter, putative, expressed -
3 Sobic.002G188200 RING-H2 finger protein, putative, expressed -
4 Sobic.001G086100 - -
5 Sobic.010G196200 OsSub51 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
6 Sobic.005G050900 - -
7 Sobic.002G046400 oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed K18054: 2'-deoxymugineic-acid 2'-dioxygenase / mugineic-acid 3-dioxygenase
8 Sobic.005G025500 expressed protein -
9 Sobic.008G045300 citrate-binding protein precursor, putative, expressed -
10 Sobic.002G345100 expressed protein -
11 Sobic.004G293600 OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.008G175933 - -
13 Sobic.004G082050 - K02935: RP-L7, MRPL12, large subunit ribosomal protein L7/L12
14 Sobic.010G065500 BHLH transcription factor, putative, expressed -
15 Sobic.008G055650 - -
16 Sobic.002G070400 - -
17 Sobic.002G334900 S-domain receptor-like protein kinase, putative, expressed -
18 Sobic.001G001000 expressed protein -
19 Sobic.004G013400 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, FKBP-type, putative, expressed K01802: peptidylprolyl isomerase
20 Sobic.002G063500 Leucine Rich Repeat family protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G130100 Sobic003G130100 Sobic004G328800 Sobic004G328800 Sobic003G130100--Sobic004G328800 Sobic001G003300 Sobic001G003300 Sobic003G130100--Sobic001G003300 Sobic002G188200 Sobic002G188200 Sobic003G130100--Sobic002G188200 Sobic001G086100 Sobic001G086100 Sobic003G130100--Sobic001G086100 Sobic010G196200 Sobic010G196200 Sobic003G130100--Sobic010G196200 Sobic005G050900 Sobic005G050900 Sobic003G130100--Sobic005G050900 Sobic002G046400 Sobic002G046400 Sobic003G130100--Sobic002G046400 Sobic005G025500 Sobic005G025500 Sobic003G130100--Sobic005G025500 Sobic008G045300 Sobic008G045300 Sobic003G130100--Sobic008G045300 Sobic004G328800--Sobic002G188200 Sobic008G175933 Sobic008G175933 Sobic004G328800--Sobic008G175933 Sobic004G328800--Sobic001G003300 Sobic004G328800--Sobic005G025500 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic004G328800--Sobic001G190600 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic004G328800--Sobic004G013400 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic004G328800--Sobic004G122700 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic004G328800--Sobic005G207550 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic004G328800--Sobic001G138500 Sobic001G003300--Sobic002G188200 Sobic001G003300--Sobic004G328800 Sobic001G003300--Sobic008G175933 Sobic006G044466 Sobic006G044466 Sobic001G003300--Sobic006G044466 Sobic001G003300--Sobic010G196200 Sobic001G003300--Sobic001G190600 Sobic001G003300--Sobic005G025500 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic001G003300--Sobic005G207600 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic001G003300--Sobic010G146350 Sobic002G188200--Sobic004G328800 Sobic002G188200--Sobic008G175933 Sobic002G188200--Sobic001G003300 Sobic002G188200--Sobic010G196200 Sobic002G188200--Sobic006G044466 Sobic002G188200--Sobic008G045300 Sobic009G142600 Sobic009G142600 Sobic002G188200--Sobic009G142600 Sobic002G188200--Sobic005G025500 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic002G188200--Sobic008G008601 Sobic004G293600 Sobic004G293600 Sobic001G086100--Sobic004G293600 Sobic002G345100 Sobic002G345100 Sobic001G086100--Sobic002G345100 Sobic001G086100--Sobic002G046400 Sobic001G086100--Sobic005G025500 Sobic003G002800 Sobic003G002800 Sobic001G086100--Sobic003G002800 Sobic001G086100--Sobic004G328800 Sobic006G144900 Sobic006G144900 Sobic001G086100--Sobic006G144900 Sobic001G086100--Sobic009G142600 Sobic005G014600 Sobic005G014600 Sobic001G086100--Sobic005G014600 Sobic010G196200--Sobic002G188200 Sobic003G250340 Sobic003G250340 Sobic010G196200--Sobic003G250340 Sobic010G196200--Sobic008G045300 Sobic010G196200--Sobic004G328800 Sobic010G196200--Sobic006G044466 Sobic004G325832 Sobic004G325832 Sobic010G196200--Sobic004G325832 Sobic010G196200--Sobic001G003300 Sobic010G196200--Sobic008G175933 Sobic002G152000 Sobic002G152000 Sobic010G196200--Sobic002G152000 Sobic005G050900--Sobic001G190600 Sobic010G065500 Sobic010G065500 Sobic005G050900--Sobic010G065500 Sobic005G050900--Sobic004G013400 Sobic001G001000 Sobic001G001000 Sobic005G050900--Sobic001G001000 Sobic005G050900--Sobic005G207550 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic005G050900--Sobic006G137900 Sobic005G050900--Sobic005G207600 Sobic005G050900--Sobic001G138500 Sobic008G008701 Sobic008G008701 Sobic005G050900--Sobic008G008701 Sobic002G046400--Sobic005G025500 Sobic008G045100 Sobic008G045100 Sobic002G046400--Sobic008G045100 Sobic004G162800 Sobic004G162800 Sobic002G046400--Sobic004G162800 Sobic001G358101 Sobic001G358101 Sobic002G046400--Sobic001G358101 Sobic001G234700 Sobic001G234700 Sobic002G046400--Sobic001G234700 Sobic005G025500--Sobic008G008601 Sobic005G025500--Sobic005G014600 Sobic005G025500--Sobic004G122700 Sobic004G090900 Sobic004G090900 Sobic005G025500--Sobic004G090900 Sobic008G069901 Sobic008G069901 Sobic005G025500--Sobic008G069901 Sobic005G025500--Sobic008G008701 Sobic002G063500 Sobic002G063500 Sobic005G025500--Sobic002G063500 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic005G025500--Sobic001G452300 Sobic002G046500 Sobic002G046500 Sobic005G025500--Sobic002G046500 Sobic003G333150 Sobic003G333150 Sobic008G045300--Sobic003G333150 Sobic008G045300--Sobic002G188200 Sobic008G045300--Sobic004G293600 Sobic009G203600 Sobic009G203600 Sobic008G045300--Sobic009G203600 Sobic008G045300--Sobic010G196200 Sobic008G045300--Sobic004G328800 Sobic008G045300--Sobic008G175933 Sobic008G045300--Sobic002G345100 Sobic008G045300--Sobic006G144900
Octagon: transcription factors


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