Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G139700.1,Sobic.003G139700.2
Synonym Sb03g011900
Functional annotation - (PubMedID : 26465154)
IF, putative, expressed
UniProt C5XI13 , C5XI16
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G26770 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g04530.1 : IF, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024236
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G095500 "CYP711A family, the cytochrome P450 homepage. Its recombinant protein did not converted CLA to 5DS or 5DS to hydroxylated 5DS."(PubMedID : 33793911)@Synthesized carlactonoic acid (CLA) from carlactone (CL).(PubMedID : 34970291)@cytochrome P450, putative, expressed -
2 Sobic.002G324801 - -
3 Sobic.008G086700 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -
4 Sobic.010G196466 - -
5 Sobic.009G087540 - -
6 Sobic.001G167000 HEAT repeat family protein, putative, expressed K11492: NCAPG2, condensin-2 complex subunit G2
7 Sobic.004G206600 osFTL5 FT-Like5 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
8 Sobic.002G012100 cytokinin inducible protein, putative, expressed -
9 Sobic.010G100700 HEAT repeat family protein, putative, expressed -
10 Sobic.007G141900 resistance protein SlVe1 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.008G072800 OsMADS33 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
12 Sobic.004G242800 - -
13 Sobic.004G032200 cytidylyltransferase domain containing protein, expressed K02201: pantetheine-phosphate adenylyltransferase
14 Sobic.004G093700 tetraspanin family protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G111200 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
16 Sobic.004G058400 RNA binding protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G270800 ras-related protein, putative, expressed K07933: Rab-like protein 3
18 Sobic.010G183350 - -
19 Sobic.008G132500 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
20 Sobic.002G009000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G139700 Sobic003G139700 Sobic004G095500 Sobic004G095500 Sobic003G139700--Sobic004G095500 Sobic002G324801 Sobic002G324801 Sobic003G139700--Sobic002G324801 Sobic008G086700 Sobic008G086700 Sobic003G139700--Sobic008G086700 Sobic010G196466 Sobic010G196466 Sobic003G139700--Sobic010G196466 Sobic009G087540 Sobic009G087540 Sobic003G139700--Sobic009G087540 Sobic001G167000 Sobic001G167000 Sobic003G139700--Sobic001G167000 Sobic004G206600 Sobic004G206600 Sobic003G139700--Sobic004G206600 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic003G139700--Sobic002G012100 Sobic010G100700 Sobic010G100700 Sobic003G139700--Sobic010G100700 Sobic004G093700 Sobic004G093700 Sobic004G095500--Sobic004G093700 Sobic004G095500--Sobic010G100700 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic004G095500--Sobic003G312800 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic004G095500--Sobic001G460900 Sobic008G072800 Sobic008G072800 Sobic004G095500--Sobic008G072800 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic004G095500--Sobic009G074800 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic004G095500--Sobic010G183350 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic004G095500--Sobic003G023450 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic004G095500--Sobic008G132500 Sobic002G324801--Sobic008G072800 Sobic003G016950 Sobic003G016950 Sobic002G324801--Sobic003G016950 Sobic002G324801--Sobic008G132500 Sobic002G324801--Sobic004G093700 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic002G324801--Sobic003G375500 Sobic002G324801--Sobic010G100700 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic002G324801--Sobic007G141900 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic002G324801--Sobic001G250750 Sobic002G324801--Sobic010G196466 Sobic006G048400 Sobic006G048400 Sobic008G086700--Sobic006G048400 Sobic008G086700--Sobic003G139700 Sobic009G210250 Sobic009G210250 Sobic008G086700--Sobic009G210250 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic008G086700--Sobic002G009000 Sobic008G086700--Sobic008G132500 Sobic008G086700--Sobic001G250750 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic008G086700--Sobic006G072701 Sobic002G176300 Sobic002G176300 Sobic008G086700--Sobic002G176300 Sobic010G136700 Sobic010G136700 Sobic008G086700--Sobic010G136700 Sobic010G196466--Sobic004G206600 Sobic010G196466--Sobic007G141900 Sobic010G196466--Sobic002G012100 Sobic010G196466--Sobic001G167000 Sobic010G196466--Sobic002G324801 Sobic003G267200 Sobic003G267200 Sobic010G196466--Sobic003G267200 Sobic010G196466--Sobic002G009000 Sobic004G242800 Sobic004G242800 Sobic010G196466--Sobic004G242800 Sobic010G196466--Sobic008G072800 Sobic001G270800 Sobic001G270800 Sobic009G087540--Sobic001G270800 Sobic009G087540--Sobic003G267200 Sobic009G087540--Sobic004G206600 Sobic009G087540--Sobic002G012100 Sobic009G175700 Sobic009G175700 Sobic009G087540--Sobic009G175700 Sobic001G107550 Sobic001G107550 Sobic009G087540--Sobic001G107550 Sobic009G087540--Sobic009G210250 Sobic005G045250 Sobic005G045250 Sobic009G087540--Sobic005G045250 Sobic003G030450 Sobic003G030450 Sobic009G087540--Sobic003G030450 Sobic001G167000--Sobic002G012100 Sobic001G167000--Sobic004G242800 Sobic001G167000--Sobic001G270800 Sobic001G182800 Sobic001G182800 Sobic001G167000--Sobic001G182800 Sobic003G330350 Sobic003G330350 Sobic001G167000--Sobic003G330350 Sobic004G299850 Sobic004G299850 Sobic001G167000--Sobic004G299850 Sobic003G064901 Sobic003G064901 Sobic001G167000--Sobic003G064901 Sobic001G167000--Sobic010G196466 Sobic009G102250 Sobic009G102250 Sobic001G167000--Sobic009G102250 Sobic004G206600--Sobic010G196466 Sobic004G206600--Sobic003G267200 Sobic004G206600--Sobic002G012100 Sobic004G206600--Sobic004G242800 Sobic004G206600--Sobic001G167000 Sobic004G206600--Sobic007G141900 Sobic004G206600--Sobic002G324801 Sobic004G206600--Sobic009G087540 Sobic009G236900 Sobic009G236900 Sobic004G206600--Sobic009G236900 Sobic002G012100--Sobic007G141900 Sobic002G012100--Sobic001G167000 Sobic002G012100--Sobic008G072800 Sobic002G012100--Sobic004G206600 Sobic008G067000 Sobic008G067000 Sobic002G012100--Sobic008G067000 Sobic002G012100--Sobic004G242800 Sobic002G012100--Sobic010G196466 Sobic009G064300 Sobic009G064300 Sobic002G012100--Sobic009G064300 Sobic002G012100--Sobic003G023450 Sobic010G100700--Sobic004G093700 Sobic010G100700--Sobic008G072800 Sobic010G100700--Sobic003G023450 Sobic010G100700--Sobic007G141900 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic010G100700--Sobic008G142200 Sobic003G063400 Sobic003G063400 Sobic010G100700--Sobic003G063400 Sobic010G100700--Sobic002G324801 Sobic010G100700--Sobic002G012100 Sobic010G100700--Sobic008G132500
Octagon: transcription factors


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