Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G068200.1,Sobic.004G068200.2
Synonym Sb04g005700
Functional annotation bfr-2, putative, expressed
UniProt A0A194YN30
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g09140.1 : bfr-2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019303 , Zm00025a034723
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G068200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G370500 expressed protein K14851: RRP17, ribosomal RNA-processing protein 17
2 Sobic.002G293400 prostatic spermine-binding protein precursor, putative, expressed -
3 Sobic.003G278633 - -
4 Sobic.009G018100 - -
5 Sobic.003G315000 homeobox-leucine zipper protein ATHB-54, putative, expressed -
6 Sobic.006G236900 gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed -
7 Sobic.009G172100 GRF zinc finger family protein, expressed -
8 Sobic.001G095566 - -
9 Sobic.005G156201 - -
10 Sobic.002G240400 - -
11 Sobic.006G015000 expressed protein -
12 Sobic.004G039100 KIN, antigenic determinant of recA protein, putative, expressed K13102: DNA/RNA-binding protein KIN17
13 Sobic.009G066700 - -
14 Sobic.001G435100 transcription initiation factor IIF, alpha subunit domain containing protein, expressed K03138: TFIIF1, GTF2F1, transcription initiation factor TFIIF subunit alpha
15 Sobic.010G003000 - -
16 Sobic.008G088812 - -
17 Sobic.006G088450 - -
18 Sobic.003G019500 - -
19 Sobic.001G052900 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
20 Sobic.005G208425 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G068200 Sobic004G068200 Sobic001G370500 Sobic001G370500 Sobic004G068200--Sobic001G370500 Sobic002G293400 Sobic002G293400 Sobic004G068200--Sobic002G293400 Sobic003G278633 Sobic003G278633 Sobic004G068200--Sobic003G278633 Sobic009G018100 Sobic009G018100 Sobic004G068200--Sobic009G018100 Sobic003G315000 Sobic003G315000 Sobic004G068200--Sobic003G315000 Sobic006G236900 Sobic006G236900 Sobic004G068200--Sobic006G236900 Sobic009G172100 Sobic009G172100 Sobic004G068200--Sobic009G172100 Sobic001G095566 Sobic001G095566 Sobic004G068200--Sobic001G095566 Sobic005G156201 Sobic005G156201 Sobic004G068200--Sobic005G156201 Sobic001G370500--Sobic004G068200 Sobic004G288100 Sobic004G288100 Sobic001G370500--Sobic004G288100 Sobic010G262800 Sobic010G262800 Sobic001G370500--Sobic010G262800 Sobic001G466600 Sobic001G466600 Sobic001G370500--Sobic001G466600 Sobic001G429800 Sobic001G429800 Sobic001G370500--Sobic001G429800 Sobic001G453800 Sobic001G453800 Sobic001G370500--Sobic001G453800 Sobic002G088100 Sobic002G088100 Sobic001G370500--Sobic002G088100 Sobic008G088812 Sobic008G088812 Sobic001G370500--Sobic008G088812 Sobic002G312800 Sobic002G312800 Sobic001G370500--Sobic002G312800 Sobic001G141700 Sobic001G141700 Sobic002G293400--Sobic001G141700 Sobic002G240400 Sobic002G240400 Sobic002G293400--Sobic002G240400 Sobic001G541500 Sobic001G541500 Sobic002G293400--Sobic001G541500 Sobic002G293400--Sobic004G068200 Sobic003G349000 Sobic003G349000 Sobic002G293400--Sobic003G349000 Sobic003G282700 Sobic003G282700 Sobic002G293400--Sobic003G282700 Sobic010G241600 Sobic010G241600 Sobic002G293400--Sobic010G241600 Sobic010G237800 Sobic010G237800 Sobic002G293400--Sobic010G237800 Sobic002G293400--Sobic009G172100 Sobic003G278633--Sobic009G018100 Sobic002G259900 Sobic002G259900 Sobic003G278633--Sobic002G259900 Sobic009G066700 Sobic009G066700 Sobic003G278633--Sobic009G066700 Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic003G278633--Sobic004G273550 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic003G278633--Sobic006G118150 Sobic002G097500 Sobic002G097500 Sobic003G278633--Sobic002G097500 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic003G278633--Sobic008G016400 Sobic010G015400 Sobic010G015400 Sobic003G278633--Sobic010G015400 Sobic007G224700 Sobic007G224700 Sobic003G278633--Sobic007G224700 Sobic009G018100--Sobic005G156201 Sobic009G018100--Sobic009G066700 Sobic009G018100--Sobic009G172100 Sobic009G018100--Sobic008G088812 Sobic003G019500 Sobic003G019500 Sobic009G018100--Sobic003G019500 Sobic005G208425 Sobic005G208425 Sobic009G018100--Sobic005G208425 Sobic009G018100--Sobic003G278633 Sobic010G194801 Sobic010G194801 Sobic009G018100--Sobic010G194801 Sobic003G438100 Sobic003G438100 Sobic009G018100--Sobic003G438100 Sobic006G266850 Sobic006G266850 Sobic003G315000--Sobic006G266850 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic003G315000--Sobic006G088450 Sobic002G091500 Sobic002G091500 Sobic003G315000--Sobic002G091500 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic003G315000--Sobic005G135300 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic003G315000--Sobic005G068400 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic003G315000--Sobic008G131601 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic003G315000--Sobic002G288500 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic003G315000--Sobic002G051500 Sobic002G176800 Sobic002G176800 Sobic003G315000--Sobic002G176800 Sobic006G236900--Sobic004G068200 Sobic006G236900--Sobic003G278633 Sobic001G406500 Sobic001G406500 Sobic006G236900--Sobic001G406500 Sobic003G297400 Sobic003G297400 Sobic006G236900--Sobic003G297400 Sobic007G138200 Sobic007G138200 Sobic006G236900--Sobic007G138200 Sobic006G236900--Sobic002G259900 Sobic001G165301 Sobic001G165301 Sobic006G236900--Sobic001G165301 Sobic001G261464 Sobic001G261464 Sobic006G236900--Sobic001G261464 Sobic008G139250 Sobic008G139250 Sobic006G236900--Sobic008G139250 Sobic009G172100--Sobic005G156201 Sobic009G172100--Sobic008G088812 Sobic009G172100--Sobic009G018100 Sobic009G172100--Sobic010G194801 Sobic009G172100--Sobic003G019500 Sobic009G172100--Sobic005G208425 Sobic003G111700 Sobic003G111700 Sobic009G172100--Sobic003G111700 Sobic001G310000 Sobic001G310000 Sobic009G172100--Sobic001G310000 Sobic005G205100 Sobic005G205100 Sobic009G172100--Sobic005G205100 Sobic001G095566--Sobic005G156201 Sobic001G095566--Sobic009G018100 Sobic001G095566--Sobic003G019500 Sobic001G095566--Sobic009G172100 Sobic001G095566--Sobic010G194801 Sobic001G095566--Sobic008G088812 Sobic001G095566--Sobic001G310000 Sobic001G095566--Sobic009G066700 Sobic010G168100 Sobic010G168100 Sobic001G095566--Sobic010G168100 Sobic005G156201--Sobic003G019500 Sobic005G156201--Sobic009G018100 Sobic005G156201--Sobic008G088812 Sobic005G156201--Sobic010G194801 Sobic005G156201--Sobic009G172100 Sobic005G156201--Sobic003G111700 Sobic005G156201--Sobic001G310000 Sobic005G156201--Sobic005G208425 Sobic005G156201--Sobic005G205100
Octagon: transcription factors


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