Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G240400.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QD67
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G293400 prostatic spermine-binding protein precursor, putative, expressed -
2 Sobic.003G278633 - -
3 Sobic.001G435100 transcription initiation factor IIF, alpha subunit domain containing protein, expressed K03138: TFIIF1, GTF2F1, transcription initiation factor TFIIF subunit alpha
4 Sobic.003G315000 homeobox-leucine zipper protein ATHB-54, putative, expressed -
5 Sobic.008G127250 - -
6 Sobic.009G251600 cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial precursor, putative, expressed K02265: cytochrome c oxidase subunit 5b
7 Sobic.003G349000 ruvB-like, putative, expressed K04499: RUVBL1, RVB1, RuvB-like protein 1 (pontin 52)
8 Sobic.003G282700 protein kri1, putative, expressed K14786: protein KRI1
9 Sobic.002G312800 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14841: NSA1, ribosome biogenesis protein NSA1
10 Sobic.010G047000 transport protein particle component, Bet3, domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G141700 acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32-related protein 2, putative, expressed K18647: acidic leucine-rich nuclear phosphoprotein 32 family member B
12 Sobic.004G068200 bfr-2, putative, expressed -
13 Sobic.002G259900 expressed protein -
14 Sobic.006G236900 gibberellin 20 oxidase 2, putative, expressed -
15 Sobic.004G095400 calcium-binding EF hand family protein, putative, expressed -
16 Sobic.008G047200 - -
17 Sobic.005G115350 - -
18 Sobic.010G105050 - -
19 Sobic.003G198080 - -
20 Sobic.004G081400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G240400 Sobic002G240400 Sobic002G293400 Sobic002G293400 Sobic002G240400--Sobic002G293400 Sobic003G278633 Sobic003G278633 Sobic002G240400--Sobic003G278633 Sobic001G435100 Sobic001G435100 Sobic002G240400--Sobic001G435100 Sobic003G315000 Sobic003G315000 Sobic002G240400--Sobic003G315000 Sobic008G127250 Sobic008G127250 Sobic002G240400--Sobic008G127250 Sobic009G251600 Sobic009G251600 Sobic002G240400--Sobic009G251600 Sobic003G349000 Sobic003G349000 Sobic002G240400--Sobic003G349000 Sobic003G282700 Sobic003G282700 Sobic002G240400--Sobic003G282700 Sobic002G312800 Sobic002G312800 Sobic002G240400--Sobic002G312800 Sobic001G141700 Sobic001G141700 Sobic002G293400--Sobic001G141700 Sobic002G293400--Sobic002G240400 Sobic001G541500 Sobic001G541500 Sobic002G293400--Sobic001G541500 Sobic004G068200 Sobic004G068200 Sobic002G293400--Sobic004G068200 Sobic002G293400--Sobic003G349000 Sobic002G293400--Sobic003G282700 Sobic010G241600 Sobic010G241600 Sobic002G293400--Sobic010G241600 Sobic010G237800 Sobic010G237800 Sobic002G293400--Sobic010G237800 Sobic009G172100 Sobic009G172100 Sobic002G293400--Sobic009G172100 Sobic009G018100 Sobic009G018100 Sobic003G278633--Sobic009G018100 Sobic002G259900 Sobic002G259900 Sobic003G278633--Sobic002G259900 Sobic009G066700 Sobic009G066700 Sobic003G278633--Sobic009G066700 Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic003G278633--Sobic004G273550 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic003G278633--Sobic006G118150 Sobic002G097500 Sobic002G097500 Sobic003G278633--Sobic002G097500 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic003G278633--Sobic008G016400 Sobic010G015400 Sobic010G015400 Sobic003G278633--Sobic010G015400 Sobic007G224700 Sobic007G224700 Sobic003G278633--Sobic007G224700 Sobic001G435100--Sobic003G278633 Sobic001G435100--Sobic002G259900 Sobic001G435100--Sobic002G240400 Sobic002G303900 Sobic002G303900 Sobic001G435100--Sobic002G303900 Sobic001G435100--Sobic009G018100 Sobic001G370500 Sobic001G370500 Sobic001G435100--Sobic001G370500 Sobic001G435100--Sobic004G273550 Sobic007G060550 Sobic007G060550 Sobic001G435100--Sobic007G060550 Sobic007G090439 Sobic007G090439 Sobic001G435100--Sobic007G090439 Sobic006G266850 Sobic006G266850 Sobic003G315000--Sobic006G266850 Sobic006G088450 Sobic006G088450 Sobic003G315000--Sobic006G088450 Sobic002G091500 Sobic002G091500 Sobic003G315000--Sobic002G091500 Sobic005G135300 Sobic005G135300 Sobic003G315000--Sobic005G135300 Sobic005G068400 Sobic005G068400 Sobic003G315000--Sobic005G068400 Sobic008G131601 Sobic008G131601 Sobic003G315000--Sobic008G131601 Sobic002G288500 Sobic002G288500 Sobic003G315000--Sobic002G288500 Sobic002G051500 Sobic002G051500 Sobic003G315000--Sobic002G051500 Sobic002G176800 Sobic002G176800 Sobic003G315000--Sobic002G176800 Sobic001G318100 Sobic001G318100 Sobic008G127250--Sobic001G318100 Sobic010G165900 Sobic010G165900 Sobic008G127250--Sobic010G165900 Sobic005G108225 Sobic005G108225 Sobic008G127250--Sobic005G108225 Sobic002G101100 Sobic002G101100 Sobic008G127250--Sobic002G101100 Sobic005G098900 Sobic005G098900 Sobic008G127250--Sobic005G098900 Sobic010G165700 Sobic010G165700 Sobic008G127250--Sobic010G165700 Sobic009G070250 Sobic009G070250 Sobic008G127250--Sobic009G070250 Sobic010G165800 Sobic010G165800 Sobic008G127250--Sobic010G165800 Sobic008G047200 Sobic008G047200 Sobic008G127250--Sobic008G047200 Sobic009G251600--Sobic003G282700 Sobic010G025100 Sobic010G025100 Sobic009G251600--Sobic010G025100 Sobic007G188200 Sobic007G188200 Sobic009G251600--Sobic007G188200 Sobic010G042700 Sobic010G042700 Sobic009G251600--Sobic010G042700 Sobic001G197100 Sobic001G197100 Sobic009G251600--Sobic001G197100 Sobic009G251600--Sobic002G293400 Sobic003G119100 Sobic003G119100 Sobic009G251600--Sobic003G119100 Sobic009G251600--Sobic002G240400 Sobic009G251600--Sobic010G241600 Sobic002G154400 Sobic002G154400 Sobic003G349000--Sobic002G154400 Sobic003G349000--Sobic002G312800 Sobic003G349000--Sobic001G141700 Sobic003G349000--Sobic003G282700 Sobic007G053700 Sobic007G053700 Sobic003G349000--Sobic007G053700 Sobic003G349000--Sobic010G237800 Sobic009G042100 Sobic009G042100 Sobic003G349000--Sobic009G042100 Sobic003G349000--Sobic010G241600 Sobic002G056000 Sobic002G056000 Sobic003G349000--Sobic002G056000 Sobic003G282700--Sobic007G188200 Sobic003G282700--Sobic003G349000 Sobic003G282700--Sobic010G241600 Sobic003G282700--Sobic007G053700 Sobic004G027700 Sobic004G027700 Sobic003G282700--Sobic004G027700 Sobic003G072500 Sobic003G072500 Sobic003G282700--Sobic003G072500 Sobic003G282700--Sobic002G154400 Sobic001G177400 Sobic001G177400 Sobic003G282700--Sobic001G177400 Sobic003G282700--Sobic010G237800 Sobic001G466600 Sobic001G466600 Sobic002G312800--Sobic001G466600 Sobic006G095400 Sobic006G095400 Sobic002G312800--Sobic006G095400 Sobic002G312800--Sobic003G349000 Sobic001G299800 Sobic001G299800 Sobic002G312800--Sobic001G299800 Sobic002G312800--Sobic002G154400 Sobic002G312800--Sobic010G241600 Sobic002G312800--Sobic009G042100 Sobic002G312800--Sobic003G282700 Sobic002G312800--Sobic007G053700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.