Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G435100.1
Synonym Sb01g040940, RAP74, ATRAP74
Functional annotation transcription initiation factor IIF, alpha subunit domain containing protein, expressed
UniProt A0A109NDY8 , C5WQW6 , C6JRX7 , C6JRY1 , C6JRY0
Pfam PF05793
Panther DB PTHR13011
NCBI CDD KOG2393; Transcription initiation factor IIF, large subunit (RAP74)
KEGG Orthology K03138; TFIIF1, GTF2F1, transcription initiation factor TFIIF subunit alpha
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding GO:0005634nucleus GO:0006367transcription initiation from RNA polymerase II promoter


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G12610 : transcription activators;DNA binding;RNA polymerase II transcription factors;catalytics;transcription initiation factors
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g10990.1 : transcription initiation factor IIF, alpha subunit domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a017996 , Zm00025a052870
Brachypodium KQJ96401 , KQJ96402
Barley HORVU4Hr1G062770.1 , HORVU4Hr1G062770.2 , HORVU4Hr1G062770.3 , HORVU4Hr1G062770.4 , HORVU4Hr1G062770.5 , HORVU4Hr1G062770.6 , HORVU4Hr1G062770.7 , HORVU4Hr1G062770.8 , HORVU4Hr1G062770.9 , HORVU4Hr1G062770.23 , HORVU4Hr1G062770.22 , HORVU4Hr1G062770.21 , HORVU4Hr1G062770.20 , HORVU4Hr1G062770.18 , HORVU4Hr1G062770.19 , HORVU4Hr1G062770.12 , HORVU4Hr1G062770.10 , HORVU4Hr1G062770.11 , HORVU4Hr1G062770.13 , HORVU4Hr1G062770.14 , HORVU4Hr1G062770.15
Wheat TraesCS4B02G222300 , TraesCS4B02G222300 , TraesCS4A02G081500 , TraesCS4D02G222800
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cDNA sequences
Sobic.001G435100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic001G435100 Sobic001G435100 Sobic003G278633 Sobic003G278633 Sobic001G435100--Sobic003G278633 Sobic002G259900 Sobic002G259900 Sobic001G435100--Sobic002G259900 Sobic002G240400 Sobic002G240400 Sobic001G435100--Sobic002G240400 Sobic002G303900 Sobic002G303900 Sobic001G435100--Sobic002G303900 Sobic009G018100 Sobic009G018100 Sobic001G435100--Sobic009G018100 Sobic001G370500 Sobic001G370500 Sobic001G435100--Sobic001G370500 Sobic004G273550 Sobic004G273550 Sobic001G435100--Sobic004G273550 Sobic007G060550 Sobic007G060550 Sobic001G435100--Sobic007G060550 Sobic007G090439 Sobic007G090439 Sobic001G435100--Sobic007G090439 Sobic003G278633--Sobic009G018100 Sobic003G278633--Sobic002G259900 Sobic009G066700 Sobic009G066700 Sobic003G278633--Sobic009G066700 Sobic003G278633--Sobic004G273550 Sobic006G118150 Sobic006G118150 Sobic003G278633--Sobic006G118150 Sobic002G097500 Sobic002G097500 Sobic003G278633--Sobic002G097500 Sobic008G016400 Sobic008G016400 Sobic003G278633--Sobic008G016400 Sobic010G015400 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Octagon: transcription factors


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