Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G370500.1
Synonym Sb01g035240
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WZS1
Pfam PF09805
Panther DB PTHR14577
NCBI CDD KOG4709; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology K14851; RRP17, ribosomal RNA-processing protein 17
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G11240 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g23020.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052365
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G370500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G068200 bfr-2, putative, expressed -
2 Sobic.004G288100 HSPC171 protein, putative, expressed -
3 Sobic.010G262800 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14553: U3 small nucleolar RNA-associated protein 18
4 Sobic.001G466600 expressed protein -
5 Sobic.001G429800 heat shock protein DnaJ, putative, expressed K09528: DnaJ homolog subfamily C member 8
6 Sobic.001G453800 copper/zinc superoxide dismutase, putative, expressed K04565: superoxide dismutase, Cu-Zn family
7 Sobic.002G088100 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim, putative, expressed K17778: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM10
8 Sobic.008G088812 - -
9 Sobic.002G312800 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K14841: NSA1, ribosome biogenesis protein NSA1
10 Sobic.009G172100 GRF zinc finger family protein, expressed -
11 Sobic.001G095566 - -
12 Sobic.005G156201 - -
13 Sobic.009G018100 - -
14 Sobic.005G208425 - -
15 Sobic.001G435100 transcription initiation factor IIF, alpha subunit domain containing protein, expressed K03138: TFIIF1, GTF2F1, transcription initiation factor TFIIF subunit alpha
16 Sobic.002G329700 ribosomal protein L28 protein, putative, expressed K02902: RP-L28, MRPL28, large subunit ribosomal protein L28
17 Sobic.003G304700 AGAP003732-PA, putative, expressed -
18 Sobic.009G043900 O-methyltransferase, putative, expressed -
19 Sobic.003G019500 - -
20 Sobic.010G194801 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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