Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G131600.1
Synonym OST2, HA1, AHA1, PMA
Functional annotation plasma membrane ATPase, putative, expressed
UniProt A0A194YQH3
Pfam PF00690
Panther DB PTHR24093
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G30190 : H(+)-ATPase 2
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g56160.1 : plasma membrane ATPase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032923 , Zm00025a045279
Brachypodium -
Barley HORVU0Hr1G017350.8 , HORVU0Hr1G017350.6 , HORVU0Hr1G017350.5 , HORVU0Hr1G017350.2 , HORVU0Hr1G017350.1
Wheat TraesCS6B02G393400 , TraesCS6D02G344000 , TraesCS6A02G360500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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2 Sobic.007G173150 - -
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20 Sobic.007G130200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G131600 Sobic004G131600 Sobic007G173100 Sobic007G173100 Sobic004G131600--Sobic007G173100 Sobic007G173150 Sobic007G173150 Sobic004G131600--Sobic007G173150 Sobic010G154600 Sobic010G154600 Sobic004G131600--Sobic010G154600 Sobic004G133900 Sobic004G133900 Sobic004G131600--Sobic004G133900 Sobic009G107800 Sobic009G107800 Sobic004G131600--Sobic009G107800 Sobic003G158900 Sobic003G158900 Sobic004G131600--Sobic003G158900 Sobic002G099350 Sobic002G099350 Sobic004G131600--Sobic002G099350 Sobic004G124900 Sobic004G124900 Sobic004G131600--Sobic004G124900 Sobic008G088818 Sobic008G088818 Sobic004G131600--Sobic008G088818 Sobic007G173100--Sobic004G131600 Sobic007G173100--Sobic007G173150 Sobic007G173100--Sobic004G133900 Sobic007G173100--Sobic009G107800 Sobic007G173100--Sobic008G088818 Sobic007G130200 Sobic007G130200 Sobic007G173100--Sobic007G130200 Sobic002G173700 Sobic002G173700 Sobic007G173100--Sobic002G173700 Sobic007G173100--Sobic010G154600 Sobic002G103100 Sobic002G103100 Sobic007G173100--Sobic002G103100 Sobic007G173150--Sobic007G173100 Sobic007G173150--Sobic004G131600 Sobic007G173150--Sobic004G133900 Sobic007G173150--Sobic009G107800 Sobic007G173150--Sobic002G103100 Sobic007G173150--Sobic010G154600 Sobic002G408100 Sobic002G408100 Sobic007G173150--Sobic002G408100 Sobic007G173150--Sobic008G088818 Sobic003G261733 Sobic003G261733 Sobic007G173150--Sobic003G261733 Sobic006G031833 Sobic006G031833 Sobic010G154600--Sobic006G031833 Sobic010G254300 Sobic010G254300 Sobic010G154600--Sobic010G254300 Sobic010G154600--Sobic004G131600 Sobic010G154600--Sobic003G158900 Sobic002G232200 Sobic002G232200 Sobic010G154600--Sobic002G232200 Sobic002G324400 Sobic002G324400 Sobic010G154600--Sobic002G324400 Sobic004G165500 Sobic004G165500 Sobic010G154600--Sobic004G165500 Sobic004G270600 Sobic004G270600 Sobic010G154600--Sobic004G270600 Sobic008G026700 Sobic008G026700 Sobic010G154600--Sobic008G026700 Sobic004G133900--Sobic007G173100 Sobic004G133900--Sobic007G173150 Sobic004G133900--Sobic004G131600 Sobic004G133900--Sobic002G408100 Sobic007G100350 Sobic007G100350 Sobic004G133900--Sobic007G100350 Sobic004G133900--Sobic002G173700 Sobic004G133900--Sobic003G261733 Sobic004G133900--Sobic002G103100 Sobic004G230700 Sobic004G230700 Sobic004G133900--Sobic004G230700 Sobic008G166800 Sobic008G166800 Sobic009G107800--Sobic008G166800 Sobic009G107800--Sobic008G088818 Sobic003G295300 Sobic003G295300 Sobic009G107800--Sobic003G295300 Sobic009G107800--Sobic004G131600 Sobic009G107800--Sobic007G173100 Sobic001G380300 Sobic001G380300 Sobic009G107800--Sobic001G380300 Sobic006G080100 Sobic006G080100 Sobic009G107800--Sobic006G080100 Sobic003G136100 Sobic003G136100 Sobic009G107800--Sobic003G136100 Sobic002G079500 Sobic002G079500 Sobic009G107800--Sobic002G079500 Sobic004G132600 Sobic004G132600 Sobic003G158900--Sobic004G132600 Sobic007G113400 Sobic007G113400 Sobic003G158900--Sobic007G113400 Sobic003G158900--Sobic008G026700 Sobic009G029001 Sobic009G029001 Sobic003G158900--Sobic009G029001 Sobic002G219366 Sobic002G219366 Sobic003G158900--Sobic002G219366 Sobic002G064000 Sobic002G064000 Sobic003G158900--Sobic002G064000 Sobic005G183400 Sobic005G183400 Sobic003G158900--Sobic005G183400 Sobic005G165500 Sobic005G165500 Sobic003G158900--Sobic005G165500 Sobic004G118900 Sobic004G118900 Sobic003G158900--Sobic004G118900 Sobic001G390200 Sobic001G390200 Sobic002G099350--Sobic001G390200 Sobic006G061900 Sobic006G061900 Sobic002G099350--Sobic006G061900 Sobic010G057633 Sobic010G057633 Sobic002G099350--Sobic010G057633 Sobic007G061100 Sobic007G061100 Sobic002G099350--Sobic007G061100 Sobic001G284475 Sobic001G284475 Sobic002G099350--Sobic001G284475 Sobic006G056800 Sobic006G056800 Sobic002G099350--Sobic006G056800 Sobic002G099350--Sobic004G131600 Sobic001G037300 Sobic001G037300 Sobic002G099350--Sobic001G037300 Sobic003G032500 Sobic003G032500 Sobic002G099350--Sobic003G032500 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic004G124900--Sobic001G209701 Sobic008G088818--Sobic003G295300 Sobic008G088818--Sobic009G107800 Sobic005G073800 Sobic005G073800 Sobic008G088818--Sobic005G073800 Sobic002G321300 Sobic002G321300 Sobic008G088818--Sobic002G321300 Sobic004G223400 Sobic004G223400 Sobic008G088818--Sobic004G223400 Sobic003G080300 Sobic003G080300 Sobic008G088818--Sobic003G080300 Sobic009G197800 Sobic009G197800 Sobic008G088818--Sobic009G197800 Sobic008G088818--Sobic007G173100 Sobic008G088818--Sobic004G131600
Octagon: transcription factors


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