Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G261733.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VYZ7 , C6JSF0
Pfam -
Panther DB PTHR33157 PTHR33157:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g17930.1 : transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a023566 , Zm00025a027854
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G190400 uridine/cytidine kinase-like 1, putative, expressed -
2 Sobic.007G113400 - -
3 Sobic.004G133900 - -
4 Sobic.003G166875 - -
5 Sobic.007G113500 - -
6 Sobic.005G170900 OsFBDUF64 - F-box and DUF domain containing protein -
7 Sobic.002G103100 - -
8 Sobic.004G213900 trafficking protein particle complex subunit, putative, expressed -
9 Sobic.002G173700 expressed protein -
10 Sobic.002G324300 tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, putative, expressed K10862: tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1
11 Sobic.005G007000 - -
12 Sobic.002G162701 - -
13 Sobic.004G113000 - -
14 Sobic.007G198400 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
15 Sobic.006G031833 - -
16 Sobic.003G066000 expressed protein -
17 Sobic.009G026300 expressed protein K17815: exonuclease V
18 Sobic.010G256466 - -
19 Sobic.008G025200 ankyrin, putative, expressed -
20 Sobic.004G185400 - -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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