Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G026300.1
Synonym Sb09g002220
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YZ37
Pfam PF09810
Panther DB PTHR14464
NCBI CDD KOG4760; Uncharacterized conserved protein
KEGG Orthology K17815; exonuclease V
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G60370 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g03200.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040747
Brachypodium KQJ96060
Barley -
Wheat TraesCS7A02G142000 , TraesCS7D02G143300
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G055500 Protein-tyrosine phosphatase domain containing protein, expressed -
2 Sobic.006G115100 expressed protein -
3 Sobic.002G200000 zinc finger, C3HC4 type, putative, expressed -
4 Sobic.003G092800 white-brown complex homolog protein 7, putative, expressed -
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8 Sobic.007G076400 expressed protein -
9 Sobic.008G152700 expressed protein K07541: GPI mannosyltransferase 1 subunit X
10 Sobic.003G235100 HD domain containing protein 2, putative, expressed K07023: putative hydrolases of HD superfamily
11 Sobic.007G004300 phosphate/phosphoenolpyruvate translocator-related protein, putative, expressed -
12 Sobic.002G084800 expressed protein -
13 Sobic.003G433400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
14 Sobic.006G270000 expressed protein -
15 Sobic.003G402800 DUF647 domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.007G172700 ECT5, putative, expressed -
17 Sobic.008G069300 - -
18 Sobic.004G350700 kelch repeat protein, putative, expressed -
19 Sobic.002G180800 puromycin-sensitive aminopeptidase, putative, expressed K08776: puromycin-sensitive aminopeptidase
20 Sobic.004G176200 SacI homology domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G026300 Sobic009G026300 Sobic008G055500 Sobic008G055500 Sobic009G026300--Sobic008G055500 Sobic006G115100 Sobic006G115100 Sobic009G026300--Sobic006G115100 Sobic002G200000 Sobic002G200000 Sobic009G026300--Sobic002G200000 Sobic003G092800 Sobic003G092800 Sobic009G026300--Sobic003G092800 Sobic006G060000 Sobic006G060000 Sobic009G026300--Sobic006G060000 Sobic001G188400 Sobic001G188400 Sobic009G026300--Sobic001G188400 Sobic001G253300 Sobic001G253300 Sobic009G026300--Sobic001G253300 Sobic007G076400 Sobic007G076400 Sobic009G026300--Sobic007G076400 Sobic008G152700 Sobic008G152700 Sobic009G026300--Sobic008G152700 Sobic003G402800 Sobic003G402800 Sobic008G055500--Sobic003G402800 Sobic008G055500--Sobic006G060000 Sobic004G350700 Sobic004G350700 Sobic008G055500--Sobic004G350700 Sobic003G385300 Sobic003G385300 Sobic008G055500--Sobic003G385300 Sobic003G117800 Sobic003G117800 Sobic008G055500--Sobic003G117800 Sobic001G257800 Sobic001G257800 Sobic008G055500--Sobic001G257800 Sobic008G055500--Sobic008G152700 Sobic004G176200 Sobic004G176200 Sobic008G055500--Sobic004G176200 Sobic001G501900 Sobic001G501900 Sobic008G055500--Sobic001G501900 Sobic006G115100--Sobic001G188400 Sobic007G004300 Sobic007G004300 Sobic006G115100--Sobic007G004300 Sobic006G115100--Sobic008G055500 Sobic006G115100--Sobic002G200000 Sobic006G115100--Sobic004G176200 Sobic006G115100--Sobic001G253300 Sobic002G198100 Sobic002G198100 Sobic006G115100--Sobic002G198100 Sobic006G115100--Sobic007G076400 Sobic006G115100--Sobic009G026300 Sobic002G200000--Sobic006G060000 Sobic002G200000--Sobic007G076400 Sobic008G116700 Sobic008G116700 Sobic002G200000--Sobic008G116700 Sobic001G141400 Sobic001G141400 Sobic002G200000--Sobic001G141400 Sobic002G200000--Sobic006G115100 Sobic002G200000--Sobic008G055500 Sobic007G172700 Sobic007G172700 Sobic002G200000--Sobic007G172700 Sobic007G087000 Sobic007G087000 Sobic002G200000--Sobic007G087000 Sobic002G355800 Sobic002G355800 Sobic002G200000--Sobic002G355800 Sobic009G217400 Sobic009G217400 Sobic003G092800--Sobic009G217400 Sobic003G433400 Sobic003G433400 Sobic003G092800--Sobic003G433400 Sobic002G084800 Sobic002G084800 Sobic003G092800--Sobic002G084800 Sobic008G069300 Sobic008G069300 Sobic003G092800--Sobic008G069300 Sobic007G022600 Sobic007G022600 Sobic003G092800--Sobic007G022600 Sobic003G291800 Sobic003G291800 Sobic003G092800--Sobic003G291800 Sobic003G092800--Sobic009G026300 Sobic003G092800--Sobic007G076400 Sobic006G250800 Sobic006G250800 Sobic003G092800--Sobic006G250800 Sobic006G060000--Sobic008G055500 Sobic006G060000--Sobic004G350700 Sobic006G060000--Sobic007G172700 Sobic001G114200 Sobic001G114200 Sobic006G060000--Sobic001G114200 Sobic003G394500 Sobic003G394500 Sobic006G060000--Sobic003G394500 Sobic001G389200 Sobic001G389200 Sobic006G060000--Sobic001G389200 Sobic004G263500 Sobic004G263500 Sobic006G060000--Sobic004G263500 Sobic006G060000--Sobic003G117800 Sobic001G490900 Sobic001G490900 Sobic006G060000--Sobic001G490900 Sobic001G188400--Sobic006G115100 Sobic001G188400--Sobic001G253300 Sobic003G316200 Sobic003G316200 Sobic001G188400--Sobic003G316200 Sobic001G188400--Sobic006G250800 Sobic001G188400--Sobic007G004300 Sobic002G079000 Sobic002G079000 Sobic001G188400--Sobic002G079000 Sobic001G188400--Sobic002G355800 Sobic001G188400--Sobic002G084800 Sobic001G188400--Sobic008G055500 Sobic001G253300--Sobic003G316200 Sobic001G253300--Sobic001G188400 Sobic001G253300--Sobic007G172700 Sobic008G097900 Sobic008G097900 Sobic001G253300--Sobic008G097900 Sobic003G365100 Sobic003G365100 Sobic001G253300--Sobic003G365100 Sobic005G177700 Sobic005G177700 Sobic001G253300--Sobic005G177700 Sobic001G253300--Sobic002G355800 Sobic001G253300--Sobic006G250800 Sobic009G162100 Sobic009G162100 Sobic001G253300--Sobic009G162100 Sobic007G076400--Sobic002G084800 Sobic007G076400--Sobic002G200000 Sobic007G076400--Sobic007G087000 Sobic007G076400--Sobic002G079000 Sobic007G076400--Sobic008G116700 Sobic007G076400--Sobic006G250800 Sobic007G076400--Sobic006G060000 Sobic007G076400--Sobic001G188400 Sobic007G076400--Sobic006G115100 Sobic001G149000 Sobic001G149000 Sobic008G152700--Sobic001G149000 Sobic008G152700--Sobic003G385300 Sobic008G152700--Sobic003G117800 Sobic004G077300 Sobic004G077300 Sobic008G152700--Sobic004G077300 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic008G152700--Sobic009G046900 Sobic008G152700--Sobic007G172700 Sobic003G428000 Sobic003G428000 Sobic008G152700--Sobic003G428000 Sobic008G152700--Sobic003G394500 Sobic001G385000 Sobic001G385000 Sobic008G152700--Sobic001G385000
Octagon: transcription factors


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