Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G235100.1
Synonym Sb03g029250
Functional annotation HD domain containing protein 2, putative, expressed
UniProt C5XEK7
Pfam PF01966
Panther DB PTHR11845 PTHR11845:SF15
NCBI CDD KOG3197; Predicted hydrolases of HD superfamily
KEGG Orthology K07023; putative hydrolases of HD superfamily
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G26160 : Metal-dependent phosphohydrolase
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g45390.2 : HD domain containing protein 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a028281
Brachypodium KQK08927 , KQK08928
Barley -
Wheat TraesCS3B02G259900 , TraesCS3A02G230600 , TraesCS3A02G230600 , TraesCS3D02G222700 , TraesCS3D02G222700
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cDNA sequences
Sobic.003G235100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.009G252200 expressed protein K11644: paired amphipathic helix protein Sin3a


Gene co-expression network
sample Sobic003G235100 Sobic003G235100 Sobic009G046900 Sobic009G046900 Sobic003G235100--Sobic009G046900 Sobic007G004300 Sobic007G004300 Sobic003G235100--Sobic007G004300 Sobic009G116900 Sobic009G116900 Sobic003G235100--Sobic009G116900 Sobic002G084800 Sobic002G084800 Sobic003G235100--Sobic002G084800 Sobic005G145201 Sobic005G145201 Sobic003G235100--Sobic005G145201 Sobic008G152700 Sobic008G152700 Sobic003G235100--Sobic008G152700 Sobic003G402800 Sobic003G402800 Sobic003G235100--Sobic003G402800 Sobic004G350700 Sobic004G350700 Sobic003G235100--Sobic004G350700 Sobic004G107100 Sobic004G107100 Sobic003G235100--Sobic004G107100 Sobic001G149000 Sobic001G149000 Sobic009G046900--Sobic001G149000 Sobic009G178400 Sobic009G178400 Sobic009G046900--Sobic009G178400 Sobic002G233600 Sobic002G233600 Sobic009G046900--Sobic002G233600 Sobic006G134500 Sobic006G134500 Sobic009G046900--Sobic006G134500 Sobic002G074800 Sobic002G074800 Sobic009G046900--Sobic002G074800 Sobic003G385300 Sobic003G385300 Sobic009G046900--Sobic003G385300 Sobic001G384200 Sobic001G384200 Sobic009G046900--Sobic001G384200 Sobic006G193400 Sobic006G193400 Sobic009G046900--Sobic006G193400 Sobic003G358600 Sobic003G358600 Sobic009G046900--Sobic003G358600 Sobic004G176200 Sobic004G176200 Sobic007G004300--Sobic004G176200 Sobic006G115100 Sobic006G115100 Sobic007G004300--Sobic006G115100 Sobic002G103800 Sobic002G103800 Sobic007G004300--Sobic002G103800 Sobic007G004300--Sobic003G402800 Sobic008G055500 Sobic008G055500 Sobic007G004300--Sobic008G055500 Sobic007G004300--Sobic003G235100 Sobic007G004300--Sobic003G385300 Sobic009G252200 Sobic009G252200 Sobic007G004300--Sobic009G252200 Sobic002G180800 Sobic002G180800 Sobic007G004300--Sobic002G180800 Sobic007G172700 Sobic007G172700 Sobic009G116900--Sobic007G172700 Sobic009G116900--Sobic003G235100 Sobic001G257800 Sobic001G257800 Sobic009G116900--Sobic001G257800 Sobic006G250800 Sobic006G250800 Sobic009G116900--Sobic006G250800 Sobic009G116900--Sobic004G350700 Sobic001G404900 Sobic001G404900 Sobic009G116900--Sobic001G404900 Sobic009G116900--Sobic008G055500 Sobic009G116900--Sobic008G152700 Sobic002G198100 Sobic002G198100 Sobic009G116900--Sobic002G198100 Sobic007G076400 Sobic007G076400 Sobic002G084800--Sobic007G076400 Sobic002G084800--Sobic003G235100 Sobic002G084800--Sobic006G250800 Sobic002G084800--Sobic007G172700 Sobic002G079000 Sobic002G079000 Sobic002G084800--Sobic002G079000 Sobic007G087000 Sobic007G087000 Sobic002G084800--Sobic007G087000 Sobic001G188400 Sobic001G188400 Sobic002G084800--Sobic001G188400 Sobic008G037700 Sobic008G037700 Sobic002G084800--Sobic008G037700 Sobic002G084800--Sobic009G116900 Sobic003G040700 Sobic003G040700 Sobic005G145201--Sobic003G040700 Sobic005G145201--Sobic004G107100 Sobic003G089100 Sobic003G089100 Sobic005G145201--Sobic003G089100 Sobic006G120900 Sobic006G120900 Sobic005G145201--Sobic006G120900 Sobic003G234500 Sobic003G234500 Sobic005G145201--Sobic003G234500 Sobic005G145201--Sobic003G235100 Sobic010G105000 Sobic010G105000 Sobic005G145201--Sobic010G105000 Sobic001G408400 Sobic001G408400 Sobic005G145201--Sobic001G408400 Sobic010G173300 Sobic010G173300 Sobic005G145201--Sobic010G173300 Sobic008G152700--Sobic001G149000 Sobic008G152700--Sobic003G385300 Sobic003G117800 Sobic003G117800 Sobic008G152700--Sobic003G117800 Sobic004G077300 Sobic004G077300 Sobic008G152700--Sobic004G077300 Sobic008G152700--Sobic009G046900 Sobic008G152700--Sobic007G172700 Sobic003G428000 Sobic003G428000 Sobic008G152700--Sobic003G428000 Sobic003G394500 Sobic003G394500 Sobic008G152700--Sobic003G394500 Sobic001G385000 Sobic001G385000 Sobic008G152700--Sobic001G385000 Sobic003G402800--Sobic003G385300 Sobic003G402800--Sobic001G257800 Sobic003G402800--Sobic008G055500 Sobic003G402800--Sobic002G074800 Sobic005G048500 Sobic005G048500 Sobic003G402800--Sobic005G048500 Sobic005G185500 Sobic005G185500 Sobic003G402800--Sobic005G185500 Sobic004G064200 Sobic004G064200 Sobic003G402800--Sobic004G064200 Sobic003G402800--Sobic009G046900 Sobic003G402800--Sobic001G149000 Sobic004G350700--Sobic008G055500 Sobic004G350700--Sobic003G394500 Sobic004G350700--Sobic003G385300 Sobic001G424800 Sobic001G424800 Sobic004G350700--Sobic001G424800 Sobic006G060000 Sobic006G060000 Sobic004G350700--Sobic006G060000 Sobic004G350700--Sobic001G149000 Sobic004G350700--Sobic007G172700 Sobic001G114200 Sobic001G114200 Sobic004G350700--Sobic001G114200 Sobic004G350700--Sobic003G117800 Sobic004G107100--Sobic010G173300 Sobic004G113600 Sobic004G113600 Sobic004G107100--Sobic004G113600 Sobic003G244400 Sobic003G244400 Sobic004G107100--Sobic003G244400 Sobic004G107100--Sobic001G384200 Sobic006G267100 Sobic006G267100 Sobic004G107100--Sobic006G267100 Sobic001G414650 Sobic001G414650 Sobic004G107100--Sobic001G414650 Sobic001G400000 Sobic001G400000 Sobic004G107100--Sobic001G400000 Sobic001G112600 Sobic001G112600 Sobic004G107100--Sobic001G112600 Sobic001G387300 Sobic001G387300 Sobic004G107100--Sobic001G387300
Octagon: transcription factors


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