Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G162701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W4B9
Pfam -
Panther DB PTHR38362
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G75388 : conserved peptide upstream open reading frame 5
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G162800 expressed protein -
2 Sobic.010G273900 "SbeI(Ortholog in maize:Jiang et al., 2013)"(PubMedID : 31659938)@transmembrane protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G055500 - -
4 Sobic.003G261733 - -
5 Sobic.008G097900 protein kinase domain containing protein, expressed -
6 Sobic.006G195800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@multidrug resistance-associated protein, putative, expressed K05665: ATP-binding cassette, subfamily C (CFTR/MRP), member 1
7 Sobic.003G204600 expressed protein -
8 Sobic.009G012200 RPA1C - Putative single-stranded DNA binding complex subunit 1, expressed K07466: RFA1, RPA1, replication factor A1
9 Sobic.001G253300 phosphofructokinase, putative, expressed K00850: pfkA, 6-phosphofructokinase 1
10 Sobic.003G114400 expressed protein K05288: GPI ethanolamine phosphate transferase 3 subunit O
11 Sobic.002G181700 metallo-beta-lactamase family protein, putative, expressed -
12 Sobic.006G132600 - -
13 Sobic.005G007000 - -
14 Sobic.002G426300 actin, putative, expressed K17260: ACTR2, actin-related protein 2
15 Sobic.002G071300 - -
16 Sobic.003G156400 OsPDIL2-2 protein disulfide isomerase PDIL2-2, expressed K09584: PDIA6, protein disulfide-isomerase A6
17 Sobic.001G188400 tobamovirus multiplication protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G190400 uridine/cytidine kinase-like 1, putative, expressed -
19 Sobic.001G364800 Mo25, putative, expressed K08272: CAB39, calcium binding protein 39
20 Sobic.007G198500 BTB/POZ domain containing protein, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic002G162701 Sobic002G162701 Sobic002G162800 Sobic002G162800 Sobic002G162701--Sobic002G162800 Sobic010G273900 Sobic010G273900 Sobic002G162701--Sobic010G273900 Sobic009G055500 Sobic009G055500 Sobic002G162701--Sobic009G055500 Sobic003G261733 Sobic003G261733 Sobic002G162701--Sobic003G261733 Sobic008G097900 Sobic008G097900 Sobic002G162701--Sobic008G097900 Sobic006G195800 Sobic006G195800 Sobic002G162701--Sobic006G195800 Sobic003G204600 Sobic003G204600 Sobic002G162701--Sobic003G204600 Sobic009G012200 Sobic009G012200 Sobic002G162701--Sobic009G012200 Sobic001G253300 Sobic001G253300 Sobic002G162701--Sobic001G253300 Sobic002G162800--Sobic002G162701 Sobic001G162500 Sobic001G162500 Sobic002G162800--Sobic001G162500 Sobic002G162800--Sobic010G273900 Sobic010G233100 Sobic010G233100 Sobic002G162800--Sobic010G233100 Sobic006G235900 Sobic006G235900 Sobic002G162800--Sobic006G235900 Sobic009G249800 Sobic009G249800 Sobic002G162800--Sobic009G249800 Sobic005G003300 Sobic005G003300 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Octagon: transcription factors


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