Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G324300.4,Sobic.002G324300.3,Sobic.002G324300.1,Sobic.002G324300.2
Synonym TDP1, Sb02g035180
Functional annotation tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, putative, expressed
UniProt A0A1W0W6J8 , A0A1W0W6K4 , A0A1B6QEP1
Pfam PF06087
Panther DB PTHR12415 PTHR12415:SF0
NCBI CDD KOG2031; Tyrosyl-DNA phosphodiesterase
KEGG Orthology K10862; tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1
Gene Ontology GO:0008081; phosphoric diester hydrolase activity GO:0006281DNA repair GO:0005634nucleus


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G15170 : tyrosyl-DNA phosphodiesterase-related
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g34598.1,LOC_Os07g34598.2 : tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a048262
Brachypodium KQK15923
Barley HORVU2Hr1G045220.12 , HORVU2Hr1G045220.19 , HORVU2Hr1G045220.18 , HORVU2Hr1G045220.17 , HORVU2Hr1G045220.16 , HORVU2Hr1G045220.14 , HORVU2Hr1G045220.11 , HORVU2Hr1G045220.10 , HORVU2Hr1G045220.7 , HORVU2Hr1G045220.26 , HORVU2Hr1G045220.24 , HORVU2Hr1G045220.25 , HORVU2Hr1G045220.22 , HORVU2Hr1G045220.23 , HORVU2Hr1G045220.20 , HORVU2Hr1G045220.21 , HORVU2Hr1G045220.15 , HORVU2Hr1G045220.6 , HORVU2Hr1G045220.5 , HORVU2Hr1G045220.4 , HORVU2Hr1G045220.3 , HORVU2Hr1G045220.2 , HORVU2Hr1G045220.1 , HORVU2Hr1G045220.13 , HORVU2Hr1G045220.9 , HORVU2Hr1G045220.8 , HORVU2Hr1G045160.1
Wheat TraesCS2B02G244300 , TraesCS2B02G244300 , TraesCS2D02G224500 , TraesCS2A02G218900
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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G066900 POLD1 - Putative DNA polymerase delta catalytic subunit, expressed K02327: DNA polymerase delta subunit 1
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19 Sobic.010G260000 pentatricopeptide, putative, expressed -
20 Sobic.003G433200 BAS1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G324300 Sobic002G324300 Sobic005G066900 Sobic005G066900 Sobic002G324300--Sobic005G066900 Sobic006G031833 Sobic006G031833 Sobic002G324300--Sobic006G031833 Sobic002G399800 Sobic002G399800 Sobic002G324300--Sobic002G399800 Sobic008G140700 Sobic008G140700 Sobic002G324300--Sobic008G140700 Sobic007G097400 Sobic007G097400 Sobic002G324300--Sobic007G097400 Sobic001G340000 Sobic001G340000 Sobic002G324300--Sobic001G340000 Sobic006G029100 Sobic006G029100 Sobic002G324300--Sobic006G029100 Sobic002G318800 Sobic002G318800 Sobic002G324300--Sobic002G318800 Sobic002G308700 Sobic002G308700 Sobic002G324300--Sobic002G308700 Sobic003G143800 Sobic003G143800 Sobic005G066900--Sobic003G143800 Sobic008G091300 Sobic008G091300 Sobic005G066900--Sobic008G091300 Sobic003G375200 Sobic003G375200 Sobic005G066900--Sobic003G375200 Sobic003G039000 Sobic003G039000 Sobic005G066900--Sobic003G039000 Sobic002G371600 Sobic002G371600 Sobic005G066900--Sobic002G371600 Sobic004G322300 Sobic004G322300 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