Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G133900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YPE3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g24954.1 : ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G173100 - -
2 Sobic.007G173150 - -
3 Sobic.004G131600 plasma membrane ATPase, putative, expressed -
4 Sobic.002G408100 -(PubMedID : 29751546)@transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
5 Sobic.007G100350 - -
6 Sobic.002G173700 expressed protein -
7 Sobic.003G261733 - -
8 Sobic.002G103100 - -
9 Sobic.004G230700 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
10 Sobic.007G141380 - -
11 Sobic.002G237900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CSLE6 - cellulose synthase-like family E, expressed -
12 Sobic.002G022100 OsFBX212 - F-box domain containing protein, expressed -
13 Sobic.007G198400 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.002G048900 - -
15 Sobic.010G165950 - -
16 Sobic.001G247550 - -
17 Sobic.001G247550 - -
18 Sobic.001G247550 - -
19 Sobic.010G119500 cadmium tolerance factor, putative, expressed K11267: sister chromatid cohesion protein PDS5
20 Sobic.004G044900 DNA binding protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G133900 Sobic004G133900 Sobic007G173100 Sobic007G173100 Sobic004G133900--Sobic007G173100 Sobic007G173150 Sobic007G173150 Sobic004G133900--Sobic007G173150 Sobic004G131600 Sobic004G131600 Sobic004G133900--Sobic004G131600 Sobic002G408100 Sobic002G408100 Sobic004G133900--Sobic002G408100 Sobic007G100350 Sobic007G100350 Sobic004G133900--Sobic007G100350 Sobic002G173700 Sobic002G173700 Sobic004G133900--Sobic002G173700 Sobic003G261733 Sobic003G261733 Sobic004G133900--Sobic003G261733 Sobic002G103100 Sobic002G103100 Sobic004G133900--Sobic002G103100 Sobic004G230700 Sobic004G230700 Sobic004G133900--Sobic004G230700 Sobic007G173100--Sobic004G131600 Sobic007G173100--Sobic007G173150 Sobic007G173100--Sobic004G133900 Sobic009G107800 Sobic009G107800 Sobic007G173100--Sobic009G107800 Sobic008G088818 Sobic008G088818 Sobic007G173100--Sobic008G088818 Sobic007G130200 Sobic007G130200 Sobic007G173100--Sobic007G130200 Sobic007G173100--Sobic002G173700 Sobic010G154600 Sobic010G154600 Sobic007G173100--Sobic010G154600 Sobic007G173100--Sobic002G103100 Sobic007G173150--Sobic007G173100 Sobic007G173150--Sobic004G131600 Sobic007G173150--Sobic004G133900 Sobic007G173150--Sobic009G107800 Sobic007G173150--Sobic002G103100 Sobic007G173150--Sobic010G154600 Sobic007G173150--Sobic002G408100 Sobic007G173150--Sobic008G088818 Sobic007G173150--Sobic003G261733 Sobic004G131600--Sobic007G173100 Sobic004G131600--Sobic007G173150 Sobic004G131600--Sobic010G154600 Sobic004G131600--Sobic004G133900 Sobic004G131600--Sobic009G107800 Sobic003G158900 Sobic003G158900 Sobic004G131600--Sobic003G158900 Sobic002G099350 Sobic002G099350 Sobic004G131600--Sobic002G099350 Sobic004G124900 Sobic004G124900 Sobic004G131600--Sobic004G124900 Sobic004G131600--Sobic008G088818 Sobic002G237900 Sobic002G237900 Sobic002G408100--Sobic002G237900 Sobic009G140000 Sobic009G140000 Sobic002G408100--Sobic009G140000 Sobic010G019000 Sobic010G019000 Sobic002G408100--Sobic010G019000 Sobic001G531500 Sobic001G531500 Sobic002G408100--Sobic001G531500 Sobic010G157300 Sobic010G157300 Sobic002G408100--Sobic010G157300 Sobic003G426700 Sobic003G426700 Sobic002G408100--Sobic003G426700 Sobic003G342100 Sobic003G342100 Sobic002G408100--Sobic003G342100 Sobic009G123900 Sobic009G123900 Sobic002G408100--Sobic009G123900 Sobic002G403600 Sobic002G403600 Sobic002G408100--Sobic002G403600 Sobic007G100350--Sobic004G133900 Sobic007G141380 Sobic007G141380 Sobic007G100350--Sobic007G141380 Sobic007G100350--Sobic004G230700 Sobic008G091614 Sobic008G091614 Sobic007G100350--Sobic008G091614 Sobic006G056800 Sobic006G056800 Sobic007G100350--Sobic006G056800 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic007G100350--Sobic007G198400 Sobic007G198700 Sobic007G198700 Sobic007G100350--Sobic007G198700 Sobic001G284475 Sobic001G284475 Sobic007G100350--Sobic001G284475 Sobic007G100350--Sobic002G103100 Sobic002G173700--Sobic004G133900 Sobic004G149600 Sobic004G149600 Sobic002G173700--Sobic004G149600 Sobic002G173700--Sobic002G103100 Sobic004G188000 Sobic004G188000 Sobic002G173700--Sobic004G188000 Sobic010G119500 Sobic010G119500 Sobic002G173700--Sobic010G119500 Sobic003G357400 Sobic003G357400 Sobic002G173700--Sobic003G357400 Sobic002G173700--Sobic003G261733 Sobic002G173700--Sobic007G130200 Sobic010G179750 Sobic010G179750 Sobic002G173700--Sobic010G179750 Sobic008G190400 Sobic008G190400 Sobic003G261733--Sobic008G190400 Sobic007G113400 Sobic007G113400 Sobic003G261733--Sobic007G113400 Sobic003G261733--Sobic004G133900 Sobic003G166875 Sobic003G166875 Sobic003G261733--Sobic003G166875 Sobic007G113500 Sobic007G113500 Sobic003G261733--Sobic007G113500 Sobic005G170900 Sobic005G170900 Sobic003G261733--Sobic005G170900 Sobic003G261733--Sobic002G103100 Sobic004G213900 Sobic004G213900 Sobic003G261733--Sobic004G213900 Sobic003G261733--Sobic002G173700 Sobic003G164950 Sobic003G164950 Sobic002G103100--Sobic003G164950 Sobic008G089800 Sobic008G089800 Sobic002G103100--Sobic008G089800 Sobic002G103100--Sobic007G198400 Sobic003G418733 Sobic003G418733 Sobic002G103100--Sobic003G418733 Sobic002G022100 Sobic002G022100 Sobic002G103100--Sobic002G022100 Sobic002G103100--Sobic004G188000 Sobic002G118101 Sobic002G118101 Sobic002G103100--Sobic002G118101 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic002G103100--Sobic007G202300 Sobic002G103100--Sobic002G408100 Sobic004G230700--Sobic007G141380 Sobic004G230700--Sobic007G198400 Sobic009G260350 Sobic009G260350 Sobic004G230700--Sobic009G260350 Sobic010G057666 Sobic010G057666 Sobic004G230700--Sobic010G057666 Sobic010G033100 Sobic010G033100 Sobic004G230700--Sobic010G033100 Sobic006G072601 Sobic006G072601 Sobic004G230700--Sobic006G072601 Sobic004G230700--Sobic002G408100 Sobic004G230700--Sobic002G022100 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic004G230700--Sobic008G105366
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.