Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G173150.1,Sobic.007G173150.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RAE9
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G173100 - -
2 Sobic.004G131600 plasma membrane ATPase, putative, expressed -
3 Sobic.004G133900 - -
4 Sobic.009G107800 - -
5 Sobic.002G103100 - -
6 Sobic.010G154600 OsSCP18 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09646: serine carboxypeptidase 1
7 Sobic.002G408100 -(PubMedID : 29751546)@transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
8 Sobic.008G088818 - -
9 Sobic.003G261733 - -
10 Sobic.003G158900 poly synthetase 2-A, putative, expressed K10798: poly [ADP-ribose] polymerase 2/3/4
11 Sobic.002G173700 expressed protein -
12 Sobic.006G145800 Os4bglu14 - monolignol beta-glucoside homologue without catalytic acid/base, expressed K05350: beta-glucosidase
13 Sobic.002G324300 tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, putative, expressed K10862: tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1
14 Sobic.004G285500 - -
15 Sobic.010G165950 - -
16 Sobic.007G130200 - -
17 Sobic.001G185800 MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
18 Sobic.004G124900 - -
19 Sobic.006G247300 AMP-binding enzyme, putative, expressed K01897: ACSL, long-chain acyl-CoA synthetase
20 Sobic.007G113400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G173150 Sobic007G173150 Sobic007G173100 Sobic007G173100 Sobic007G173150--Sobic007G173100 Sobic004G131600 Sobic004G131600 Sobic007G173150--Sobic004G131600 Sobic004G133900 Sobic004G133900 Sobic007G173150--Sobic004G133900 Sobic009G107800 Sobic009G107800 Sobic007G173150--Sobic009G107800 Sobic002G103100 Sobic002G103100 Sobic007G173150--Sobic002G103100 Sobic010G154600 Sobic010G154600 Sobic007G173150--Sobic010G154600 Sobic002G408100 Sobic002G408100 Sobic007G173150--Sobic002G408100 Sobic008G088818 Sobic008G088818 Sobic007G173150--Sobic008G088818 Sobic003G261733 Sobic003G261733 Sobic007G173150--Sobic003G261733 Sobic007G173100--Sobic004G131600 Sobic007G173100--Sobic007G173150 Sobic007G173100--Sobic004G133900 Sobic007G173100--Sobic009G107800 Sobic007G173100--Sobic008G088818 Sobic007G130200 Sobic007G130200 Sobic007G173100--Sobic007G130200 Sobic002G173700 Sobic002G173700 Sobic007G173100--Sobic002G173700 Sobic007G173100--Sobic010G154600 Sobic007G173100--Sobic002G103100 Sobic004G131600--Sobic007G173100 Sobic004G131600--Sobic007G173150 Sobic004G131600--Sobic010G154600 Sobic004G131600--Sobic004G133900 Sobic004G131600--Sobic009G107800 Sobic003G158900 Sobic003G158900 Sobic004G131600--Sobic003G158900 Sobic002G099350 Sobic002G099350 Sobic004G131600--Sobic002G099350 Sobic004G124900 Sobic004G124900 Sobic004G131600--Sobic004G124900 Sobic004G131600--Sobic008G088818 Sobic004G133900--Sobic007G173100 Sobic004G133900--Sobic007G173150 Sobic004G133900--Sobic004G131600 Sobic004G133900--Sobic002G408100 Sobic007G100350 Sobic007G100350 Sobic004G133900--Sobic007G100350 Sobic004G133900--Sobic002G173700 Sobic004G133900--Sobic003G261733 Sobic004G133900--Sobic002G103100 Sobic004G230700 Sobic004G230700 Sobic004G133900--Sobic004G230700 Sobic008G166800 Sobic008G166800 Sobic009G107800--Sobic008G166800 Sobic009G107800--Sobic008G088818 Sobic003G295300 Sobic003G295300 Sobic009G107800--Sobic003G295300 Sobic009G107800--Sobic004G131600 Sobic009G107800--Sobic007G173100 Sobic001G380300 Sobic001G380300 Sobic009G107800--Sobic001G380300 Sobic006G080100 Sobic006G080100 Sobic009G107800--Sobic006G080100 Sobic003G136100 Sobic003G136100 Sobic009G107800--Sobic003G136100 Sobic002G079500 Sobic002G079500 Sobic009G107800--Sobic002G079500 Sobic003G164950 Sobic003G164950 Sobic002G103100--Sobic003G164950 Sobic008G089800 Sobic008G089800 Sobic002G103100--Sobic008G089800 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic002G103100--Sobic007G198400 Sobic003G418733 Sobic003G418733 Sobic002G103100--Sobic003G418733 Sobic002G022100 Sobic002G022100 Sobic002G103100--Sobic002G022100 Sobic004G188000 Sobic004G188000 Sobic002G103100--Sobic004G188000 Sobic002G118101 Sobic002G118101 Sobic002G103100--Sobic002G118101 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic002G103100--Sobic007G202300 Sobic002G103100--Sobic002G408100 Sobic006G031833 Sobic006G031833 Sobic010G154600--Sobic006G031833 Sobic010G254300 Sobic010G254300 Sobic010G154600--Sobic010G254300 Sobic010G154600--Sobic004G131600 Sobic010G154600--Sobic003G158900 Sobic002G232200 Sobic002G232200 Sobic010G154600--Sobic002G232200 Sobic002G324400 Sobic002G324400 Sobic010G154600--Sobic002G324400 Sobic004G165500 Sobic004G165500 Sobic010G154600--Sobic004G165500 Sobic004G270600 Sobic004G270600 Sobic010G154600--Sobic004G270600 Sobic008G026700 Sobic008G026700 Sobic010G154600--Sobic008G026700 Sobic002G237900 Sobic002G237900 Sobic002G408100--Sobic002G237900 Sobic009G140000 Sobic009G140000 Sobic002G408100--Sobic009G140000 Sobic010G019000 Sobic010G019000 Sobic002G408100--Sobic010G019000 Sobic001G531500 Sobic001G531500 Sobic002G408100--Sobic001G531500 Sobic010G157300 Sobic010G157300 Sobic002G408100--Sobic010G157300 Sobic003G426700 Sobic003G426700 Sobic002G408100--Sobic003G426700 Sobic003G342100 Sobic003G342100 Sobic002G408100--Sobic003G342100 Sobic009G123900 Sobic009G123900 Sobic002G408100--Sobic009G123900 Sobic002G403600 Sobic002G403600 Sobic002G408100--Sobic002G403600 Sobic008G088818--Sobic003G295300 Sobic008G088818--Sobic009G107800 Sobic005G073800 Sobic005G073800 Sobic008G088818--Sobic005G073800 Sobic002G321300 Sobic002G321300 Sobic008G088818--Sobic002G321300 Sobic004G223400 Sobic004G223400 Sobic008G088818--Sobic004G223400 Sobic003G080300 Sobic003G080300 Sobic008G088818--Sobic003G080300 Sobic009G197800 Sobic009G197800 Sobic008G088818--Sobic009G197800 Sobic008G088818--Sobic007G173100 Sobic008G088818--Sobic004G131600 Sobic008G190400 Sobic008G190400 Sobic003G261733--Sobic008G190400 Sobic007G113400 Sobic007G113400 Sobic003G261733--Sobic007G113400 Sobic003G261733--Sobic004G133900 Sobic003G166875 Sobic003G166875 Sobic003G261733--Sobic003G166875 Sobic007G113500 Sobic007G113500 Sobic003G261733--Sobic007G113500 Sobic005G170900 Sobic005G170900 Sobic003G261733--Sobic005G170900 Sobic003G261733--Sobic002G103100 Sobic004G213900 Sobic004G213900 Sobic003G261733--Sobic004G213900 Sobic003G261733--Sobic002G173700
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.