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Transcriptome id Sobic.007G173100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5YNA4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G131600 plasma membrane ATPase, putative, expressed -
2 Sobic.007G173150 - -
3 Sobic.004G133900 - -
4 Sobic.009G107800 - -
5 Sobic.008G088818 - -
6 Sobic.007G130200 - -
7 Sobic.002G173700 expressed protein -
8 Sobic.010G154600 OsSCP18 - Putative Serine Carboxypeptidase homologue, expressed K09646: serine carboxypeptidase 1
9 Sobic.002G103100 - -
10 Sobic.006G145800 Os4bglu14 - monolignol beta-glucoside homologue without catalytic acid/base, expressed K05350: beta-glucosidase
11 Sobic.010G119500 cadmium tolerance factor, putative, expressed K11267: sister chromatid cohesion protein PDS5
12 Sobic.004G239301 - -
13 Sobic.004G124900 - -
14 Sobic.003G261733 - -
15 Sobic.001G425150 - -
16 Sobic.002G408100 -(PubMedID : 29751546)@transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
17 Sobic.002G047333 - K04078: groES, chaperonin GroES
18 Sobic.009G185100 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G185800 MATE efflux family protein, putative, expressed K03327: TC.MATE, SLC47A, norM, mdtK, multidrug resistance protein, MATE family
20 Sobic.003G295300 -(PubMedID : 21930910)@-(PubMedID : 24884377)@osFTL9 FT-Like9 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein K16223: protein FLOWERING LOCUS T


Gene co-expression network
sample Sobic007G173100 Sobic007G173100 Sobic004G131600 Sobic004G131600 Sobic007G173100--Sobic004G131600 Sobic007G173150 Sobic007G173150 Sobic007G173100--Sobic007G173150 Sobic004G133900 Sobic004G133900 Sobic007G173100--Sobic004G133900 Sobic009G107800 Sobic009G107800 Sobic007G173100--Sobic009G107800 Sobic008G088818 Sobic008G088818 Sobic007G173100--Sobic008G088818 Sobic007G130200 Sobic007G130200 Sobic007G173100--Sobic007G130200 Sobic002G173700 Sobic002G173700 Sobic007G173100--Sobic002G173700 Sobic010G154600 Sobic010G154600 Sobic007G173100--Sobic010G154600 Sobic002G103100 Sobic002G103100 Sobic007G173100--Sobic002G103100 Sobic004G131600--Sobic007G173100 Sobic004G131600--Sobic007G173150 Sobic004G131600--Sobic010G154600 Sobic004G131600--Sobic004G133900 Sobic004G131600--Sobic009G107800 Sobic003G158900 Sobic003G158900 Sobic004G131600--Sobic003G158900 Sobic002G099350 Sobic002G099350 Sobic004G131600--Sobic002G099350 Sobic004G124900 Sobic004G124900 Sobic004G131600--Sobic004G124900 Sobic004G131600--Sobic008G088818 Sobic007G173150--Sobic007G173100 Sobic007G173150--Sobic004G131600 Sobic007G173150--Sobic004G133900 Sobic007G173150--Sobic009G107800 Sobic007G173150--Sobic002G103100 Sobic007G173150--Sobic010G154600 Sobic002G408100 Sobic002G408100 Sobic007G173150--Sobic002G408100 Sobic007G173150--Sobic008G088818 Sobic003G261733 Sobic003G261733 Sobic007G173150--Sobic003G261733 Sobic004G133900--Sobic007G173100 Sobic004G133900--Sobic007G173150 Sobic004G133900--Sobic004G131600 Sobic004G133900--Sobic002G408100 Sobic007G100350 Sobic007G100350 Sobic004G133900--Sobic007G100350 Sobic004G133900--Sobic002G173700 Sobic004G133900--Sobic003G261733 Sobic004G133900--Sobic002G103100 Sobic004G230700 Sobic004G230700 Sobic004G133900--Sobic004G230700 Sobic008G166800 Sobic008G166800 Sobic009G107800--Sobic008G166800 Sobic009G107800--Sobic008G088818 Sobic003G295300 Sobic003G295300 Sobic009G107800--Sobic003G295300 Sobic009G107800--Sobic004G131600 Sobic009G107800--Sobic007G173100 Sobic001G380300 Sobic001G380300 Sobic009G107800--Sobic001G380300 Sobic006G080100 Sobic006G080100 Sobic009G107800--Sobic006G080100 Sobic003G136100 Sobic003G136100 Sobic009G107800--Sobic003G136100 Sobic002G079500 Sobic002G079500 Sobic009G107800--Sobic002G079500 Sobic008G088818--Sobic003G295300 Sobic008G088818--Sobic009G107800 Sobic005G073800 Sobic005G073800 Sobic008G088818--Sobic005G073800 Sobic002G321300 Sobic002G321300 Sobic008G088818--Sobic002G321300 Sobic004G223400 Sobic004G223400 Sobic008G088818--Sobic004G223400 Sobic003G080300 Sobic003G080300 Sobic008G088818--Sobic003G080300 Sobic009G197800 Sobic009G197800 Sobic008G088818--Sobic009G197800 Sobic008G088818--Sobic007G173100 Sobic008G088818--Sobic004G131600 Sobic010G173201 Sobic010G173201 Sobic007G130200--Sobic010G173201 Sobic001G271100 Sobic001G271100 Sobic007G130200--Sobic001G271100 Sobic010G164350 Sobic010G164350 Sobic007G130200--Sobic010G164350 Sobic010G120700 Sobic010G120700 Sobic007G130200--Sobic010G120700 Sobic010G119500 Sobic010G119500 Sobic007G130200--Sobic010G119500 Sobic008G055366 Sobic008G055366 Sobic007G130200--Sobic008G055366 Sobic008G055432 Sobic008G055432 Sobic007G130200--Sobic008G055432 Sobic007G226600 Sobic007G226600 Sobic007G130200--Sobic007G226600 Sobic010G068200 Sobic010G068200 Sobic007G130200--Sobic010G068200 Sobic002G173700--Sobic004G133900 Sobic004G149600 Sobic004G149600 Sobic002G173700--Sobic004G149600 Sobic002G173700--Sobic002G103100 Sobic004G188000 Sobic004G188000 Sobic002G173700--Sobic004G188000 Sobic002G173700--Sobic010G119500 Sobic003G357400 Sobic003G357400 Sobic002G173700--Sobic003G357400 Sobic002G173700--Sobic003G261733 Sobic002G173700--Sobic007G130200 Sobic010G179750 Sobic010G179750 Sobic002G173700--Sobic010G179750 Sobic006G031833 Sobic006G031833 Sobic010G154600--Sobic006G031833 Sobic010G254300 Sobic010G254300 Sobic010G154600--Sobic010G254300 Sobic010G154600--Sobic004G131600 Sobic010G154600--Sobic003G158900 Sobic002G232200 Sobic002G232200 Sobic010G154600--Sobic002G232200 Sobic002G324400 Sobic002G324400 Sobic010G154600--Sobic002G324400 Sobic004G165500 Sobic004G165500 Sobic010G154600--Sobic004G165500 Sobic004G270600 Sobic004G270600 Sobic010G154600--Sobic004G270600 Sobic008G026700 Sobic008G026700 Sobic010G154600--Sobic008G026700 Sobic003G164950 Sobic003G164950 Sobic002G103100--Sobic003G164950 Sobic008G089800 Sobic008G089800 Sobic002G103100--Sobic008G089800 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic002G103100--Sobic007G198400 Sobic003G418733 Sobic003G418733 Sobic002G103100--Sobic003G418733 Sobic002G022100 Sobic002G022100 Sobic002G103100--Sobic002G022100 Sobic002G103100--Sobic004G188000 Sobic002G118101 Sobic002G118101 Sobic002G103100--Sobic002G118101 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic002G103100--Sobic007G202300 Sobic002G103100--Sobic002G408100
Octagon: transcription factors


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