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Transcriptome id Sobic.002G048900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q995
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NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G022100 OsFBX212 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.002G016100 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
3 Sobic.007G141380 - -
4 Sobic.004G133900 - -
5 Sobic.007G035800 "Production of (E)-alpha-berg-amotene, sesquisabinene A, (E)-beta-farnesene and beta-bisabolene, cytoplasm"(PubMedID : 21880075)@terpene synthase, putative, expressed K15803: (-)-germacrene D synthase
6 Sobic.002G103100 - -
7 Sobic.007G198400 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
8 Sobic.007G198500 BTB/POZ domain containing protein, expressed K10523: speckle-type POZ protein
9 Sobic.002G408100 -(PubMedID : 29751546)@transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
10 Sobic.002G237900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@CSLE6 - cellulose synthase-like family E, expressed -
11 Sobic.009G185100 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G230700 ulp1 protease family, C-terminal catalytic domain containing protein, expressed -
13 Sobic.004G010151 - -
14 Sobic.003G164950 - -
15 Sobic.005G043600 coatomer subunit beta, putative, expressed K17302: COPB2, coatomer subunit beta'
16 Sobic.005G019500 - -
17 Sobic.010G119500 cadmium tolerance factor, putative, expressed K11267: sister chromatid cohesion protein PDS5
18 Sobic.001G359500 cytochrome P450, putative, expressed -
19 Sobic.009G260350 - -
20 Sobic.001G294150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G048900 Sobic002G048900 Sobic002G022100 Sobic002G022100 Sobic002G048900--Sobic002G022100 Sobic002G016100 Sobic002G016100 Sobic002G048900--Sobic002G016100 Sobic007G141380 Sobic007G141380 Sobic002G048900--Sobic007G141380 Sobic004G133900 Sobic004G133900 Sobic002G048900--Sobic004G133900 Sobic007G035800 Sobic007G035800 Sobic002G048900--Sobic007G035800 Sobic002G103100 Sobic002G103100 Sobic002G048900--Sobic002G103100 Sobic007G198400 Sobic007G198400 Sobic002G048900--Sobic007G198400 Sobic007G198500 Sobic007G198500 Sobic002G048900--Sobic007G198500 Sobic002G408100 Sobic002G408100 Sobic002G048900--Sobic002G408100 Sobic002G022100--Sobic002G048900 Sobic002G022100--Sobic007G141380 Sobic002G022100--Sobic002G016100 Sobic002G022100--Sobic002G103100 Sobic003G164950 Sobic003G164950 Sobic002G022100--Sobic003G164950 Sobic002G022100--Sobic007G198400 Sobic004G230700 Sobic004G230700 Sobic002G022100--Sobic004G230700 Sobic009G185100 Sobic009G185100 Sobic002G022100--Sobic009G185100 Sobic009G260350 Sobic009G260350 Sobic002G022100--Sobic009G260350 Sobic002G016100--Sobic002G022100 Sobic002G016100--Sobic002G103100 Sobic002G016100--Sobic002G048900 Sobic002G016100--Sobic009G260350 Sobic002G016100--Sobic003G164950 Sobic001G236700 Sobic001G236700 Sobic002G016100--Sobic001G236700 Sobic002G016100--Sobic007G198400 Sobic002G016100--Sobic009G185100 Sobic002G016100--Sobic007G141380 Sobic007G141380--Sobic004G230700 Sobic007G141380--Sobic007G198400 Sobic007G141380--Sobic002G022100 Sobic007G141380--Sobic009G260350 Sobic002G237900 Sobic002G237900 Sobic007G141380--Sobic002G237900 Sobic008G105366 Sobic008G105366 Sobic007G141380--Sobic008G105366 Sobic007G141380--Sobic002G408100 Sobic005G219300 Sobic005G219300 Sobic007G141380--Sobic005G219300 Sobic006G072601 Sobic006G072601 Sobic007G141380--Sobic006G072601 Sobic007G173100 Sobic007G173100 Sobic004G133900--Sobic007G173100 Sobic007G173150 Sobic007G173150 Sobic004G133900--Sobic007G173150 Sobic004G131600 Sobic004G131600 Sobic004G133900--Sobic004G131600 Sobic004G133900--Sobic002G408100 Sobic007G100350 Sobic007G100350 Sobic004G133900--Sobic007G100350 Sobic002G173700 Sobic002G173700 Sobic004G133900--Sobic002G173700 Sobic003G261733 Sobic003G261733 Sobic004G133900--Sobic003G261733 Sobic004G133900--Sobic002G103100 Sobic004G133900--Sobic004G230700 Sobic007G035800--Sobic002G048900 Sobic002G011700 Sobic002G011700 Sobic007G035800--Sobic002G011700 Sobic004G304200 Sobic004G304200 Sobic007G035800--Sobic004G304200 Sobic002G100700 Sobic002G100700 Sobic007G035800--Sobic002G100700 Sobic003G001701 Sobic003G001701 Sobic007G035800--Sobic003G001701 Sobic002G098200 Sobic002G098200 Sobic007G035800--Sobic002G098200 Sobic005G043600 Sobic005G043600 Sobic007G035800--Sobic005G043600 Sobic007G035800--Sobic002G022100 Sobic005G092200 Sobic005G092200 Sobic007G035800--Sobic005G092200 Sobic002G103100--Sobic003G164950 Sobic008G089800 Sobic008G089800 Sobic002G103100--Sobic008G089800 Sobic002G103100--Sobic007G198400 Sobic003G418733 Sobic003G418733 Sobic002G103100--Sobic003G418733 Sobic002G103100--Sobic002G022100 Sobic004G188000 Sobic004G188000 Sobic002G103100--Sobic004G188000 Sobic002G118101 Sobic002G118101 Sobic002G103100--Sobic002G118101 Sobic007G202300 Sobic007G202300 Sobic002G103100--Sobic007G202300 Sobic002G103100--Sobic002G408100 Sobic007G198400--Sobic007G141380 Sobic001G227900 Sobic001G227900 Sobic007G198400--Sobic001G227900 Sobic007G198400--Sobic004G230700 Sobic007G198400--Sobic006G072601 Sobic004G038800 Sobic004G038800 Sobic007G198400--Sobic004G038800 Sobic007G198400--Sobic008G105366 Sobic007G198400--Sobic007G202300 Sobic002G017500 Sobic002G017500 Sobic007G198400--Sobic002G017500 Sobic003G416000 Sobic003G416000 Sobic007G198400--Sobic003G416000 Sobic007G198500--Sobic005G043600 Sobic008G048900 Sobic008G048900 Sobic007G198500--Sobic008G048900 Sobic008G175032 Sobic008G175032 Sobic007G198500--Sobic008G175032 Sobic001G359500 Sobic001G359500 Sobic007G198500--Sobic001G359500 Sobic001G247550 Sobic001G247550 Sobic007G198500--Sobic001G247550 Sobic003G203200 Sobic003G203200 Sobic007G198500--Sobic003G203200 Sobic005G043900 Sobic005G043900 Sobic007G198500--Sobic005G043900 Sobic002G408100--Sobic002G237900 Sobic009G140000 Sobic009G140000 Sobic002G408100--Sobic009G140000 Sobic010G019000 Sobic010G019000 Sobic002G408100--Sobic010G019000 Sobic001G531500 Sobic001G531500 Sobic002G408100--Sobic001G531500 Sobic010G157300 Sobic010G157300 Sobic002G408100--Sobic010G157300 Sobic003G426700 Sobic003G426700 Sobic002G408100--Sobic003G426700 Sobic003G342100 Sobic003G342100 Sobic002G408100--Sobic003G342100 Sobic009G123900 Sobic009G123900 Sobic002G408100--Sobic009G123900 Sobic002G403600 Sobic002G403600 Sobic002G408100--Sobic002G403600
Octagon: transcription factors


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