Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G143100.2
Synonym Sb04g017840
Functional annotation PPR repeat domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RN69
Pfam PF13041 PF12854
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF564
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G09900 : Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g27070.2 : PPR repeat domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020281
Brachypodium KQJ99460
Barley HORVU3Hr1G107710.2 , HORVU3Hr1G107710.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.002G012350 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G143100 Sobic004G143100 Sobic010G098866 Sobic010G098866 Sobic004G143100--Sobic010G098866 Sobic006G054233 Sobic006G054233 Sobic004G143100--Sobic006G054233 Sobic001G422600 Sobic001G422600 Sobic004G143100--Sobic001G422600 Sobic002G181700 Sobic002G181700 Sobic004G143100--Sobic002G181700 Sobic002G054200 Sobic002G054200 Sobic004G143100--Sobic002G054200 Sobic010G134600 Sobic010G134600 Sobic004G143100--Sobic010G134600 Sobic006G062200 Sobic006G062200 Sobic004G143100--Sobic006G062200 Sobic006G045200 Sobic006G045200 Sobic004G143100--Sobic006G045200 Sobic005G037400 Sobic005G037400 Sobic004G143100--Sobic005G037400 Sobic001G263801 Sobic001G263801 Sobic010G098866--Sobic001G263801 Sobic007G025350 Sobic007G025350 Sobic010G098866--Sobic007G025350 Sobic002G005500 Sobic002G005500 Sobic010G098866--Sobic002G005500 Sobic003G226950 Sobic003G226950 Sobic010G098866--Sobic003G226950 Sobic002G125500 Sobic002G125500 Sobic010G098866--Sobic002G125500 Sobic010G201100 Sobic010G201100 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Octagon: transcription factors


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