Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G152900.1,Sobic.004G152900.2,Sobic.004G152900.3
Synonym Sb04g020460
Functional annotation leucine aminopeptidase, chloroplast precursor, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RMK7 , A0A1Z5RN13 , C5XSJ5
Pfam PF02789 PF00883
Panther DB PTHR11963 PTHR11963:SF17
NCBI CDD KOG2597; Predicted aminopeptidase of the M17 family
KEGG Orthology K01255; CARP, leucyl aminopeptidase
Gene Ontology GO:0006508; proteolysis GO:0005622intracellular GO:0004177aminopeptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G24200 : Cytosol aminopeptidase family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g55140.1 : leucine aminopeptidase, chloroplast precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020385 , Zm00025a022458
Brachypodium KQK01133 , KQJ96129
Barley HORVU5Hr1G123620.1
Wheat TraesCS6B02G389200 , TraesCS6A02G357200 , TraesCS6D02G339200
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G223500 asparate aminotransferase, putative, expressed -
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16 Sobic.006G035400 - -
17 Sobic.008G003800 - -
18 Sobic.007G109900 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G157733 - -
20 Sobic.007G021100 carrier, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G152900 Sobic004G152900 Sobic002G223500 Sobic002G223500 Sobic004G152900--Sobic002G223500 Sobic004G161501 Sobic004G161501 Sobic004G152900--Sobic004G161501 Sobic002G162450 Sobic002G162450 Sobic004G152900--Sobic002G162450 Sobic004G062000 Sobic004G062000 Sobic004G152900--Sobic004G062000 Sobic004G153100 Sobic004G153100 Sobic004G152900--Sobic004G153100 Sobic006G222000 Sobic006G222000 Sobic004G152900--Sobic006G222000 Sobic007G022000 Sobic007G022000 Sobic004G152900--Sobic007G022000 Sobic005G053700 Sobic005G053700 Sobic004G152900--Sobic005G053700 Sobic003G204501 Sobic003G204501 Sobic004G152900--Sobic003G204501 Sobic002G193900 Sobic002G193900 Sobic002G223500--Sobic002G193900 Sobic002G223500--Sobic004G152900 Sobic004G129800 Sobic004G129800 Sobic002G223500--Sobic004G129800 Sobic002G223500--Sobic003G204501 Sobic002G306700 Sobic002G306700 Sobic002G223500--Sobic002G306700 Sobic004G079700 Sobic004G079700 Sobic002G223500--Sobic004G079700 Sobic007G109900 Sobic007G109900 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Sobic002G122800 Sobic003G204501--Sobic002G122800 Sobic009G114000 Sobic009G114000 Sobic003G204501--Sobic009G114000
Octagon: transcription factors


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