Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G027500.1
Synonym
Functional annotation rp1, putative, expressed
UniProt Q84YG3
Pfam -
Panther DB PTHR23155 PTHR23155:SF627
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g35210.1 : NB-ARC domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053792
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G121640.3 , HORVU5Hr1G121640.2 , HORVU5Hr1G121640.1
Wheat TraesCS4A02G475400 , TraesCS4A02G479700 , TraesCS4A02G478600
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G110508 - -
2 Sobic.005G110511 - -
3 Sobic.005G066500 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
4 Sobic.003G083800 DNA binding protein, putative, expressed -
5 Sobic.007G064900 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
6 Sobic.008G138700 MLA12, putative, expressed -
7 Sobic.003G317300 "a rapidly evolving gene family, termed Rp1/Pi37, which had an effector response that confers resistance to multiple pathogens across species."(PubMedID : 25928459)@rp1, putative, expressed -
8 Sobic.002G081850 - -
9 Sobic.003G020500 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
10 Sobic.002G029500 cytochrome P450 84A1, putative, expressed K09755: CYP84A, ferulate-5-hydroxylase
11 Sobic.010G242800 disease resistance protein RGA3, putative, expressed -
12 Sobic.005G066366 - -
13 Sobic.004G339800 phosphate transporter 1, putative, expressed -
14 Sobic.002G081800 RGH1A, putative, expressed -
15 Sobic.002G019000 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
16 Sobic.005G071900 expressed protein K13457: RPM1, disease resistance protein RPM1
17 Sobic.005G065700 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
18 Sobic.007G015100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence./late senescence marker during developmental senescence(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
19 Sobic.006G009700 expressed protein -
20 Sobic.004G080300 -(PubMedID : 23108465)@MONOCULM 1, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G027500 Sobic008G027500 Sobic005G110508 Sobic005G110508 Sobic008G027500--Sobic005G110508 Sobic005G110511 Sobic005G110511 Sobic008G027500--Sobic005G110511 Sobic005G066500 Sobic005G066500 Sobic008G027500--Sobic005G066500 Sobic003G083800 Sobic003G083800 Sobic008G027500--Sobic003G083800 Sobic007G064900 Sobic007G064900 Sobic008G027500--Sobic007G064900 Sobic008G138700 Sobic008G138700 Sobic008G027500--Sobic008G138700 Sobic003G317300 Sobic003G317300 Sobic008G027500--Sobic003G317300 Sobic002G081850 Sobic002G081850 Sobic008G027500--Sobic002G081850 Sobic003G020500 Sobic003G020500 Sobic008G027500--Sobic003G020500 Sobic005G110508--Sobic005G110511 Sobic005G110508--Sobic005G066500 Sobic004G312500 Sobic004G312500 Sobic005G110508--Sobic004G312500 Sobic005G066300 Sobic005G066300 Sobic005G110508--Sobic005G066300 Sobic005G066366 Sobic005G066366 Sobic005G110508--Sobic005G066366 Sobic005G071900 Sobic005G071900 Sobic005G110508--Sobic005G071900 Sobic002G411000 Sobic002G411000 Sobic005G110508--Sobic002G411000 Sobic005G197350 Sobic005G197350 Sobic005G110508--Sobic005G197350 Sobic005G079400 Sobic005G079400 Sobic005G110508--Sobic005G079400 Sobic005G110511--Sobic005G066500 Sobic010G242800 Sobic010G242800 Sobic005G110511--Sobic010G242800 Sobic005G110511--Sobic005G066366 Sobic005G110511--Sobic004G312500 Sobic005G065700 Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G065700 Sobic005G110511--Sobic005G071900 Sobic002G029500 Sobic002G029500 Sobic005G110511--Sobic002G029500 Sobic005G110511--Sobic007G064900 Sobic008G033100 Sobic008G033100 Sobic005G110511--Sobic008G033100 Sobic005G066500--Sobic005G110511 Sobic005G066500--Sobic005G065700 Sobic005G066500--Sobic005G071900 Sobic005G066500--Sobic008G138700 Sobic005G066500--Sobic004G312500 Sobic005G066500--Sobic005G197350 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic005G066500--Sobic006G009700 Sobic002G019000 Sobic002G019000 Sobic005G066500--Sobic002G019000 Sobic005G066500--Sobic002G411000 Sobic009G106100 Sobic009G106100 Sobic003G083800--Sobic009G106100 Sobic007G015100 Sobic007G015100 Sobic003G083800--Sobic007G015100 Sobic010G152500 Sobic010G152500 Sobic003G083800--Sobic010G152500 Sobic003G083800--Sobic002G029500 Sobic004G009200 Sobic004G009200 Sobic003G083800--Sobic004G009200 Sobic005G106300 Sobic005G106300 Sobic003G083800--Sobic005G106300 Sobic007G111800 Sobic007G111800 Sobic003G083800--Sobic007G111800 Sobic005G182900 Sobic005G182900 Sobic003G083800--Sobic005G182900 Sobic003G083800--Sobic010G242800 Sobic007G064900--Sobic002G029500 Sobic007G064900--Sobic010G242800 Sobic007G064900--Sobic008G033100 Sobic005G097900 Sobic005G097900 Sobic007G064900--Sobic005G097900 Sobic007G064900--Sobic005G182900 Sobic007G064900--Sobic005G110511 Sobic007G064900--Sobic002G019000 Sobic001G415100 Sobic001G415100 Sobic007G064900--Sobic001G415100 Sobic007G064900--Sobic005G065700 Sobic008G138700--Sobic006G009700 Sobic009G060700 Sobic009G060700 Sobic008G138700--Sobic009G060700 Sobic008G138700--Sobic005G066500 Sobic008G138700--Sobic005G065700 Sobic008G138700--Sobic005G110511 Sobic008G138700--Sobic005G071900 Sobic008G138700--Sobic004G312500 Sobic006G092100 Sobic006G092100 Sobic008G138700--Sobic006G092100 Sobic010G213600 Sobic010G213600 Sobic008G138700--Sobic010G213600 Sobic006G121000 Sobic006G121000 Sobic003G317300--Sobic006G121000 Sobic005G069166 Sobic005G069166 Sobic003G317300--Sobic005G069166 Sobic007G015000 Sobic007G015000 Sobic003G317300--Sobic007G015000 Sobic004G299500 Sobic004G299500 Sobic003G317300--Sobic004G299500 Sobic006G230100 Sobic006G230100 Sobic003G317300--Sobic006G230100 Sobic002G178200 Sobic002G178200 Sobic003G317300--Sobic002G178200 Sobic008G105800 Sobic008G105800 Sobic003G317300--Sobic008G105800 Sobic001G293100 Sobic001G293100 Sobic003G317300--Sobic001G293100 Sobic005G069332 Sobic005G069332 Sobic003G317300--Sobic005G069332 Sobic002G081850--Sobic005G197350 Sobic002G081850--Sobic005G066366 Sobic002G081850--Sobic005G110511 Sobic002G081850--Sobic005G066500 Sobic002G081850--Sobic005G066300 Sobic002G081800 Sobic002G081800 Sobic002G081850--Sobic002G081800 Sobic002G081850--Sobic002G411000 Sobic002G081850--Sobic004G312500 Sobic002G081850--Sobic005G065700 Sobic001G218500 Sobic001G218500 Sobic003G020500--Sobic001G218500 Sobic002G111900 Sobic002G111900 Sobic003G020500--Sobic002G111900 Sobic003G079100 Sobic003G079100 Sobic003G020500--Sobic003G079100 Sobic002G391300 Sobic002G391300 Sobic003G020500--Sobic002G391300 Sobic003G441601 Sobic003G441601 Sobic003G020500--Sobic003G441601 Sobic004G014600 Sobic004G014600 Sobic003G020500--Sobic004G014600 Sobic002G289500 Sobic002G289500 Sobic003G020500--Sobic002G289500 Sobic006G171100 Sobic006G171100 Sobic003G020500--Sobic006G171100 Sobic003G020500--Sobic002G029500
Octagon: transcription factors


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