Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G048200.1
Synonym Sb05g003946
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PQ75
Pfam -
Panther DB PTHR33248 PTHR33248:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G42860 : zinc knuckle (CCHC-type) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g08530.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G350800 - -
2 Sobic.010G102366 - -
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10 Sobic.005G053700 - -
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15 Sobic.002G062800 NB-ARC domain containing protein, expressed -
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19 Sobic.009G073100 metal cation transporter, putative, expressed K14709: SLC39A1_2_3, solute carrier family 39 (zinc transporter), member 1/2/3
20 Sobic.006G259700 methylthioribose kinase, putative, expressed K00899: 5-methylthioribose kinase


Gene co-expression network
sample Sobic005G048200 Sobic005G048200 Sobic004G350800 Sobic004G350800 Sobic005G048200--Sobic004G350800 Sobic010G102366 Sobic010G102366 Sobic005G048200--Sobic010G102366 Sobic003G070800 Sobic003G070800 Sobic005G048200--Sobic003G070800 Sobic005G053800 Sobic005G053800 Sobic005G048200--Sobic005G053800 Sobic009G016600 Sobic009G016600 Sobic005G048200--Sobic009G016600 Sobic002G286300 Sobic002G286300 Sobic005G048200--Sobic002G286300 Sobic004G152900 Sobic004G152900 Sobic005G048200--Sobic004G152900 Sobic010G137100 Sobic010G137100 Sobic005G048200--Sobic010G137100 Sobic004G340300 Sobic004G340300 Sobic005G048200--Sobic004G340300 Sobic004G350800--Sobic010G102366 Sobic004G350800--Sobic005G048200 Sobic003G134700 Sobic003G134700 Sobic004G350800--Sobic003G134700 Sobic004G350800--Sobic004G340300 Sobic004G350800--Sobic010G137100 Sobic001G542150 Sobic001G542150 Sobic004G350800--Sobic001G542150 Sobic008G004300 Sobic008G004300 Sobic004G350800--Sobic008G004300 Sobic010G135250 Sobic010G135250 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Octagon: transcription factors


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