Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G178600.1
Synonym Sb04g022842
Functional annotation OsFBX1 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A194YRG7
Pfam PF12937
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF154
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g05880.1 : OsFBX1 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044899
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G046601 - -
2 Sobic.007G005100 L-asparaginase precursor protein, putative, expressed K13051: ASRGL1, L-asparaginase / beta-aspartyl-peptidase
3 Sobic.004G187600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K10664: E3 ubiquitin-protein ligase ATL6/9/15/31/42/55
4 Sobic.004G089100 expressed protein -
5 Sobic.002G028566 - -
6 Sobic.003G315166 - K13024: PPIP5K, inositol-hexakisphosphate/diphosphoinositol-pentakisphosphate 1-kinase
7 Sobic.006G265100 endoglucanase precursor, putative, expressed -
8 Sobic.007G202360 - -
9 Sobic.002G189750 - -
10 Sobic.004G037100 cycloartenol synthase, putative, expressed K01853: cycloartenol synthase
11 Sobic.008G119700 NB-ARC domain containing disease resistance protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G070100 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR1 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed -
13 Sobic.005G057401 - -
14 Sobic.003G324800 expressed protein -
15 Sobic.008G123000 kinesin-4, putative, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
16 Sobic.001G292100 expressed protein -
17 Sobic.010G039300 cysteine synthase, putative, expressed K01738: cysteine synthase
18 Sobic.001G397850 - -
19 Sobic.004G301250 - -
20 Sobic.004G106500 hydroquinone glucosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G178600 Sobic004G178600 Sobic010G046601 Sobic010G046601 Sobic004G178600--Sobic010G046601 Sobic007G005100 Sobic007G005100 Sobic004G178600--Sobic007G005100 Sobic004G187600 Sobic004G187600 Sobic004G178600--Sobic004G187600 Sobic004G089100 Sobic004G089100 Sobic004G178600--Sobic004G089100 Sobic002G028566 Sobic002G028566 Sobic004G178600--Sobic002G028566 Sobic003G315166 Sobic003G315166 Sobic004G178600--Sobic003G315166 Sobic006G265100 Sobic006G265100 Sobic004G178600--Sobic006G265100 Sobic007G202360 Sobic007G202360 Sobic004G178600--Sobic007G202360 Sobic002G189750 Sobic002G189750 Sobic004G178600--Sobic002G189750 Sobic010G046601--Sobic007G202360 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic010G046601--Sobic001G505066 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic010G046601--Sobic005G065050 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic010G046601--Sobic010G120900 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic010G046601--Sobic002G190600 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic010G046601--Sobic001G488800 Sobic003G118600 Sobic003G118600 Sobic010G046601--Sobic003G118600 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic010G046601--Sobic003G192500 Sobic008G122250 Sobic008G122250 Sobic010G046601--Sobic008G122250 Sobic007G005100--Sobic004G187600 Sobic001G070100 Sobic001G070100 Sobic007G005100--Sobic001G070100 Sobic007G005100--Sobic004G089100 Sobic005G048400 Sobic005G048400 Sobic007G005100--Sobic005G048400 Sobic002G325500 Sobic002G325500 Sobic007G005100--Sobic002G325500 Sobic007G005100--Sobic002G028566 Sobic008G078800 Sobic008G078800 Sobic007G005100--Sobic008G078800 Sobic007G061600 Sobic007G061600 Sobic007G005100--Sobic007G061600 Sobic010G032500 Sobic010G032500 Sobic007G005100--Sobic010G032500 Sobic009G225800 Sobic009G225800 Sobic004G187600--Sobic009G225800 Sobic005G212800 Sobic005G212800 Sobic004G187600--Sobic005G212800 Sobic009G136800 Sobic009G136800 Sobic004G187600--Sobic009G136800 Sobic001G234100 Sobic001G234100 Sobic004G187600--Sobic001G234100 Sobic005G101000 Sobic005G101000 Sobic004G187600--Sobic005G101000 Sobic004G299500 Sobic004G299500 Sobic004G187600--Sobic004G299500 Sobic005G219500 Sobic005G219500 Sobic004G187600--Sobic005G219500 Sobic001G395900 Sobic001G395900 Sobic004G187600--Sobic001G395900 Sobic006G230100 Sobic006G230100 Sobic004G187600--Sobic006G230100 Sobic004G089100--Sobic002G028566 Sobic006G101900 Sobic006G101900 Sobic004G089100--Sobic006G101900 Sobic004G089100--Sobic004G187600 Sobic006G133300 Sobic006G133300 Sobic004G089100--Sobic006G133300 Sobic004G089100--Sobic005G219500 Sobic001G416100 Sobic001G416100 Sobic004G089100--Sobic001G416100 Sobic001G414800 Sobic001G414800 Sobic004G089100--Sobic001G414800 Sobic004G089100--Sobic007G005100 Sobic004G089100--Sobic009G225800 Sobic002G028566--Sobic005G219500 Sobic002G028566--Sobic004G089100 Sobic002G028566--Sobic004G187600 Sobic001G506900 Sobic001G506900 Sobic002G028566--Sobic001G506900 Sobic001G271200 Sobic001G271200 Sobic002G028566--Sobic001G271200 Sobic002G178200 Sobic002G178200 Sobic002G028566--Sobic002G178200 Sobic002G028566--Sobic007G005100 Sobic003G317300 Sobic003G317300 Sobic002G028566--Sobic003G317300 Sobic002G028566--Sobic009G225800 Sobic007G055900 Sobic007G055900 Sobic003G315166--Sobic007G055900 Sobic002G334100 Sobic002G334100 Sobic003G315166--Sobic002G334100 Sobic007G042600 Sobic007G042600 Sobic003G315166--Sobic007G042600 Sobic006G232100 Sobic006G232100 Sobic003G315166--Sobic006G232100 Sobic010G019600 Sobic010G019600 Sobic003G315166--Sobic010G019600 Sobic010G013000 Sobic010G013000 Sobic003G315166--Sobic010G013000 Sobic003G315166--Sobic001G070100 Sobic002G348300 Sobic002G348300 Sobic003G315166--Sobic002G348300 Sobic003G315166--Sobic004G187600 Sobic004G094000 Sobic004G094000 Sobic006G265100--Sobic004G094000 Sobic009G219700 Sobic009G219700 Sobic006G265100--Sobic009G219700 Sobic007G127500 Sobic007G127500 Sobic006G265100--Sobic007G127500 Sobic004G251600 Sobic004G251600 Sobic006G265100--Sobic004G251600 Sobic008G123000 Sobic008G123000 Sobic006G265100--Sobic008G123000 Sobic004G184101 Sobic004G184101 Sobic006G265100--Sobic004G184101 Sobic006G265100--Sobic002G189750 Sobic008G023300 Sobic008G023300 Sobic006G265100--Sobic008G023300 Sobic004G275800 Sobic004G275800 Sobic006G265100--Sobic004G275800 Sobic007G202360--Sobic001G505066 Sobic007G202360--Sobic002G190600 Sobic007G202360--Sobic005G065050 Sobic007G202360--Sobic003G192500 Sobic009G147450 Sobic009G147450 Sobic007G202360--Sobic009G147450 Sobic007G202360--Sobic010G120900 Sobic001G423666 Sobic001G423666 Sobic007G202360--Sobic001G423666 Sobic004G301250 Sobic004G301250 Sobic007G202360--Sobic004G301250 Sobic006G202900 Sobic006G202900 Sobic007G202360--Sobic006G202900 Sobic002G189750--Sobic008G123000 Sobic002G189750--Sobic006G265100 Sobic002G189750--Sobic004G178600 Sobic002G189750--Sobic004G184101 Sobic002G189750--Sobic010G046601 Sobic007G127550 Sobic007G127550 Sobic002G189750--Sobic007G127550 Sobic002G189750--Sobic003G118600 Sobic002G312000 Sobic002G312000 Sobic002G189750--Sobic002G312000 Sobic006G183500 Sobic006G183500 Sobic002G189750--Sobic006G183500
Octagon: transcription factors


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