Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G265100.1
Synonym Sb06g032760, GH9C1, AtGH9C1
Functional annotation endoglucanase precursor, putative, expressed
UniProt C5YAG9
Pfam PF09478 PF00759
Panther DB PTHR22298 PTHR22298:SF41
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005975; carbohydrate metabolic process GO:0004553hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G48930 : glycosyl hydrolase 9C1
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g57860.1 : endoglucanase precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a057371
Brachypodium KQJ85266
Barley HORVU2Hr1G120100.1 , HORVU2Hr1G120100.2 , HORVU2Hr1G120100.3 , HORVU2Hr1G120100.4
Wheat TraesCS2A02G556300 , TraesCS2A02G556300 , TraesCS2B02G586600 , TraesCS2D02G557500
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic006G265100 Sobic006G265100 Sobic004G094000 Sobic004G094000 Sobic006G265100--Sobic004G094000 Sobic009G219700 Sobic009G219700 Sobic006G265100--Sobic009G219700 Sobic007G127500 Sobic007G127500 Sobic006G265100--Sobic007G127500 Sobic004G251600 Sobic004G251600 Sobic006G265100--Sobic004G251600 Sobic008G123000 Sobic008G123000 Sobic006G265100--Sobic008G123000 Sobic004G184101 Sobic004G184101 Sobic006G265100--Sobic004G184101 Sobic002G189750 Sobic002G189750 Sobic006G265100--Sobic002G189750 Sobic008G023300 Sobic008G023300 Sobic006G265100--Sobic008G023300 Sobic004G275800 Sobic004G275800 Sobic006G265100--Sobic004G275800 Sobic004G126500 Sobic004G126500 Sobic004G094000--Sobic004G126500 Sobic007G106500 Sobic007G106500 Sobic004G094000--Sobic007G106500 Sobic001G238500 Sobic001G238500 Sobic004G094000--Sobic001G238500 Sobic007G020700 Sobic007G020700 Sobic004G094000--Sobic007G020700 Sobic005G104200 Sobic005G104200 Sobic004G094000--Sobic005G104200 Sobic004G156250 Sobic004G156250 Sobic004G094000--Sobic004G156250 Sobic002G082700 Sobic002G082700 Sobic004G094000--Sobic002G082700 Sobic006G009700 Sobic006G009700 Sobic004G094000--Sobic006G009700 Sobic010G115000 Sobic010G115000 Sobic004G094000--Sobic010G115000 Sobic010G250300 Sobic010G250300 Sobic009G219700--Sobic010G250300 Sobic009G219700--Sobic007G127500 Sobic009G219700--Sobic004G251600 Sobic009G219700--Sobic008G023300 Sobic009G244900 Sobic009G244900 Sobic009G219700--Sobic009G244900 Sobic009G103400 Sobic009G103400 Sobic009G219700--Sobic009G103400 Sobic009G219700--Sobic004G094000 Sobic007G192500 Sobic007G192500 Sobic009G219700--Sobic007G192500 Sobic002G201700 Sobic002G201700 Sobic009G219700--Sobic002G201700 Sobic007G127500--Sobic008G023300 Sobic010G089600 Sobic010G089600 Sobic007G127500--Sobic010G089600 Sobic007G127550 Sobic007G127550 Sobic007G127500--Sobic007G127550 Sobic007G127500--Sobic010G250300 Sobic003G187700 Sobic003G187700 Sobic007G127500--Sobic003G187700 Sobic001G213666 Sobic001G213666 Sobic007G127500--Sobic001G213666 Sobic006G256000 Sobic006G256000 Sobic007G127500--Sobic006G256000 Sobic001G342101 Sobic001G342101 Sobic007G127500--Sobic001G342101 Sobic010G189432 Sobic010G189432 Sobic007G127500--Sobic010G189432 Sobic004G251600--Sobic010G250300 Sobic004G232700 Sobic004G232700 Sobic004G251600--Sobic004G232700 Sobic007G212100 Sobic007G212100 Sobic004G251600--Sobic007G212100 Sobic003G087700 Sobic003G087700 Sobic004G251600--Sobic003G087700 Sobic001G102100 Sobic001G102100 Sobic004G251600--Sobic001G102100 Sobic007G127400 Sobic007G127400 Sobic004G251600--Sobic007G127400 Sobic009G176400 Sobic009G176400 Sobic004G251600--Sobic009G176400 Sobic004G251600--Sobic004G275800 Sobic004G251600--Sobic007G127500 Sobic006G183500 Sobic006G183500 Sobic008G123000--Sobic006G183500 Sobic001G332933 Sobic001G332933 Sobic008G123000--Sobic001G332933 Sobic002G276500 Sobic002G276500 Sobic008G123000--Sobic002G276500 Sobic010G241450 Sobic010G241450 Sobic008G123000--Sobic010G241450 Sobic008G123000--Sobic002G189750 Sobic001G110500 Sobic001G110500 Sobic008G123000--Sobic001G110500 Sobic008G123000--Sobic006G265100 Sobic003G204750 Sobic003G204750 Sobic008G123000--Sobic003G204750 Sobic007G070100 Sobic007G070100 Sobic008G123000--Sobic007G070100 Sobic004G184101--Sobic007G127550 Sobic004G184101--Sobic008G023300 Sobic004G184101--Sobic010G089600 Sobic004G184101--Sobic003G187700 Sobic004G184101--Sobic010G189432 Sobic002G381400 Sobic002G381400 Sobic004G184101--Sobic002G381400 Sobic002G096300 Sobic002G096300 Sobic004G184101--Sobic002G096300 Sobic004G184101--Sobic001G213666 Sobic004G184101--Sobic007G127500 Sobic002G189750--Sobic008G123000 Sobic002G189750--Sobic006G265100 Sobic004G178600 Sobic004G178600 Sobic002G189750--Sobic004G178600 Sobic002G189750--Sobic004G184101 Sobic010G046601 Sobic010G046601 Sobic002G189750--Sobic010G046601 Sobic002G189750--Sobic007G127550 Sobic003G118600 Sobic003G118600 Sobic002G189750--Sobic003G118600 Sobic002G312000 Sobic002G312000 Sobic002G189750--Sobic002G312000 Sobic002G189750--Sobic006G183500 Sobic008G023300--Sobic007G127500 Sobic008G023300--Sobic007G127550 Sobic008G023300--Sobic010G089600 Sobic008G023300--Sobic004G184101 Sobic008G023300--Sobic002G381400 Sobic008G023300--Sobic001G213666 Sobic004G035400 Sobic004G035400 Sobic008G023300--Sobic004G035400 Sobic008G023300--Sobic010G250300 Sobic008G023300--Sobic003G187700 Sobic006G096100 Sobic006G096100 Sobic004G275800--Sobic006G096100 Sobic002G082800 Sobic002G082800 Sobic004G275800--Sobic002G082800 Sobic004G275800--Sobic004G251600 Sobic002G118900 Sobic002G118900 Sobic004G275800--Sobic002G118900 Sobic004G275800--Sobic007G127400 Sobic010G066800 Sobic010G066800 Sobic004G275800--Sobic010G066800 Sobic003G269900 Sobic003G269900 Sobic004G275800--Sobic003G269900 Sobic008G158266 Sobic008G158266 Sobic004G275800--Sobic008G158266 Sobic010G158400 Sobic010G158400 Sobic004G275800--Sobic010G158400
Octagon: transcription factors


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