Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G258900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YRL4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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TAIR -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G050200 DNA binding protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G041300 amino acid permease family protein, putative, expressed -
3 Sobic.002G216100 cytochrome P450, putative, expressed -
4 Sobic.001G430100 - -
5 Sobic.005G065900 glycine-rich cell wall structural protein 2 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.002G404100 annexin, putative, expressed -
7 Sobic.009G221500 lipid phosphatase protein, putative, expressed -
8 Sobic.002G101400 erythronate-4-phosphate dehydrogenase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G148800 WRKY31, expressed -
10 Sobic.002G042200 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
11 Sobic.001G264000 dehydrogenase, putative, expressed K00001: E1.1.1.1, alcohol dehydrogenase
12 Sobic.006G197100 DNA binding protein, putative, expressed -
13 Sobic.003G324600 transcription factor-related, putative, expressed -
14 Sobic.002G361800 expressed protein -
15 Sobic.004G139300 "SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental, salt-induced, and dark-induced senescence."(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450 71D10, putative, expressed -
16 Sobic.007G178900 CXE carboxylesterase, putative, expressed -
17 Sobic.004G348800 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in root, expression induced by IAA and BR treatments"(PubMedID : 20499123)@DUF260 domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G185800 transporter, putative, expressed -
19 Sobic.001G455100 expressed protein -
20 Sobic.002G001700 ZOS7-01 - C2H2 zinc finger protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G258900 Sobic004G258900 Sobic007G050200 Sobic007G050200 Sobic004G258900--Sobic007G050200 Sobic005G041300 Sobic005G041300 Sobic004G258900--Sobic005G041300 Sobic002G216100 Sobic002G216100 Sobic004G258900--Sobic002G216100 Sobic001G430100 Sobic001G430100 Sobic004G258900--Sobic001G430100 Sobic005G065900 Sobic005G065900 Sobic004G258900--Sobic005G065900 Sobic002G404100 Sobic002G404100 Sobic004G258900--Sobic002G404100 Sobic009G221500 Sobic009G221500 Sobic004G258900--Sobic009G221500 Sobic002G101400 Sobic002G101400 Sobic004G258900--Sobic002G101400 Sobic010G148800 Sobic010G148800 Sobic004G258900--Sobic010G148800 Sobic004G322100 Sobic004G322100 Sobic007G050200--Sobic004G322100 Sobic004G323300 Sobic004G323300 Sobic007G050200--Sobic004G323300 Sobic007G050200--Sobic009G221500 Sobic003G140700 Sobic003G140700 Sobic007G050200--Sobic003G140700 Sobic007G050200--Sobic001G430100 Sobic006G256900 Sobic006G256900 Sobic007G050200--Sobic006G256900 Sobic001G058300 Sobic001G058300 Sobic007G050200--Sobic001G058300 Sobic009G199001 Sobic009G199001 Sobic007G050200--Sobic009G199001 Sobic009G219200 Sobic009G219200 Sobic007G050200--Sobic009G219200 Sobic005G041300--Sobic001G430100 Sobic005G041300--Sobic004G258900 Sobic008G034700 Sobic008G034700 Sobic005G041300--Sobic008G034700 Sobic006G183900 Sobic006G183900 Sobic005G041300--Sobic006G183900 Sobic001G455100 Sobic001G455100 Sobic005G041300--Sobic001G455100 Sobic010G096400 Sobic010G096400 Sobic005G041300--Sobic010G096400 Sobic008G035800 Sobic008G035800 Sobic005G041300--Sobic008G035800 Sobic004G348800 Sobic004G348800 Sobic005G041300--Sobic004G348800 Sobic002G365600 Sobic002G365600 Sobic005G041300--Sobic002G365600 Sobic004G139300 Sobic004G139300 Sobic002G216100--Sobic004G139300 Sobic002G216100--Sobic002G404100 Sobic007G178900 Sobic007G178900 Sobic002G216100--Sobic007G178900 Sobic010G113100 Sobic010G113100 Sobic002G216100--Sobic010G113100 Sobic007G176000 Sobic007G176000 Sobic002G216100--Sobic007G176000 Sobic002G185800 Sobic002G185800 Sobic002G216100--Sobic002G185800 Sobic001G360500 Sobic001G360500 Sobic002G216100--Sobic001G360500 Sobic005G046700 Sobic005G046700 Sobic002G216100--Sobic005G046700 Sobic002G042200 Sobic002G042200 Sobic002G216100--Sobic002G042200 Sobic002G183700 Sobic002G183700 Sobic001G430100--Sobic002G183700 Sobic003G311800 Sobic003G311800 Sobic001G430100--Sobic003G311800 Sobic001G430100--Sobic007G050200 Sobic001G049900 Sobic001G049900 Sobic001G430100--Sobic001G049900 Sobic002G001700 Sobic002G001700 Sobic001G430100--Sobic002G001700 Sobic001G430100--Sobic004G348800 Sobic004G297900 Sobic004G297900 Sobic001G430100--Sobic004G297900 Sobic006G197100 Sobic006G197100 Sobic001G430100--Sobic006G197100 Sobic009G109000 Sobic009G109000 Sobic001G430100--Sobic009G109000 Sobic005G065900--Sobic010G148800 Sobic005G066432 Sobic005G066432 Sobic005G065900--Sobic005G066432 Sobic005G065900--Sobic006G256900 Sobic005G065900--Sobic002G042200 Sobic005G065900--Sobic009G199001 Sobic005G065900--Sobic002G404100 Sobic004G322800 Sobic004G322800 Sobic005G065900--Sobic004G322800 Sobic005G066100 Sobic005G066100 Sobic005G065900--Sobic005G066100 Sobic005G065900--Sobic007G050200 Sobic006G028500 Sobic006G028500 Sobic002G404100--Sobic006G028500 Sobic002G404100--Sobic002G216100 Sobic002G404100--Sobic010G148800 Sobic003G240400 Sobic003G240400 Sobic002G404100--Sobic003G240400 Sobic002G404100--Sobic001G360500 Sobic002G404100--Sobic005G065900 Sobic002G404100--Sobic004G348800 Sobic002G404100--Sobic004G322800 Sobic010G082000 Sobic010G082000 Sobic002G404100--Sobic010G082000 Sobic009G221500--Sobic007G050200 Sobic009G221500--Sobic006G256900 Sobic009G221500--Sobic009G219200 Sobic009G221500--Sobic004G322100 Sobic009G221500--Sobic010G148800 Sobic009G221500--Sobic009G199001 Sobic009G221500--Sobic004G323300 Sobic001G438200 Sobic001G438200 Sobic009G221500--Sobic001G438200 Sobic009G221500--Sobic001G430100 Sobic002G101400--Sobic010G113100 Sobic002G101400--Sobic001G360500 Sobic002G101400--Sobic005G046700 Sobic006G092700 Sobic006G092700 Sobic002G101400--Sobic006G092700 Sobic007G170300 Sobic007G170300 Sobic002G101400--Sobic007G170300 Sobic003G053600 Sobic003G053600 Sobic002G101400--Sobic003G053600 Sobic007G073000 Sobic007G073000 Sobic002G101400--Sobic007G073000 Sobic007G057400 Sobic007G057400 Sobic002G101400--Sobic007G057400 Sobic010G028100 Sobic010G028100 Sobic002G101400--Sobic010G028100 Sobic010G148800--Sobic005G065900 Sobic010G148800--Sobic004G322800 Sobic010G148800--Sobic006G256900 Sobic010G148800--Sobic005G066432 Sobic010G148800--Sobic009G199001 Sobic010G148800--Sobic002G404100 Sobic010G148800--Sobic002G042200 Sobic010G148800--Sobic009G219200 Sobic006G079300 Sobic006G079300 Sobic010G148800--Sobic006G079300
Octagon: transcription factors


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