Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G262000.1
Synonym Sb04g030020
Functional annotation RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RP40
Pfam PF00076
Panther DB PTHR24012 PTHR24012:SF421
NCBI CDD KOG0149; Predicted RNA-binding protein SEB4 (RRM superfamily)
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003676; nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G76460 : RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g48340.2 : RNA recognition motif containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a021799 , Zm00025a032513
Brachypodium KQK01006
Barley HORVU6Hr1G070170.5 , HORVU6Hr1G070170.3 , HORVU6Hr1G070170.1 , HORVU6Hr1G070140.2 , HORVU6Hr1G070140.3 , HORVU6Hr1G070140.1 , HORVU6Hr1G070170.7 , HORVU6Hr1G070170.6 , HORVU6Hr1G070170.4 , HORVU6Hr1G070170.2 , HORVU6Hr1G070170.8 , HORVU6Hr1G070150.1
Wheat TraesCS6A02G278300 , TraesCS6A02G278300 , TraesCS6A02G278300 , TraesCS6B02G306600 , TraesCS6D02G258900 , TraesCS6D02G258900 , TraesCS6D02G258900 , TraesCS6D02G258900
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G195100 RNA recognition motif containing protein, putative, expressed -
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20 Sobic.005G055150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G262000 Sobic004G262000 Sobic010G195100 Sobic010G195100 Sobic004G262000--Sobic010G195100 Sobic009G127900 Sobic009G127900 Sobic004G262000--Sobic009G127900 Sobic007G178700 Sobic007G178700 Sobic004G262000--Sobic007G178700 Sobic009G134500 Sobic009G134500 Sobic004G262000--Sobic009G134500 Sobic004G082500 Sobic004G082500 Sobic004G262000--Sobic004G082500 Sobic006G082600 Sobic006G082600 Sobic004G262000--Sobic006G082600 Sobic003G087400 Sobic003G087400 Sobic004G262000--Sobic003G087400 Sobic004G290800 Sobic004G290800 Sobic004G262000--Sobic004G290800 Sobic003G268300 Sobic003G268300 Sobic004G262000--Sobic003G268300 Sobic005G055150 Sobic005G055150 Sobic010G195100--Sobic005G055150 Sobic001G479500 Sobic001G479500 Sobic010G195100--Sobic001G479500 Sobic006G009400 Sobic006G009400 Sobic010G195100--Sobic006G009400 Sobic010G195100--Sobic009G127900 Sobic001G128800 Sobic001G128800 Sobic010G195100--Sobic001G128800 Sobic006G196000 Sobic006G196000 Sobic010G195100--Sobic006G196000 Sobic010G195100--Sobic007G178700 Sobic001G454401 Sobic001G454401 Sobic010G195100--Sobic001G454401 Sobic001G543900 Sobic001G543900 Sobic010G195100--Sobic001G543900 Sobic009G127900--Sobic007G178700 Sobic009G127900--Sobic003G268300 Sobic001G446900 Sobic001G446900 Sobic009G127900--Sobic001G446900 Sobic006G066650 Sobic006G066650 Sobic009G127900--Sobic006G066650 Sobic009G127900--Sobic004G290800 Sobic010G026400 Sobic010G026400 Sobic009G127900--Sobic010G026400 Sobic007G037900 Sobic007G037900 Sobic009G127900--Sobic007G037900 Sobic008G173900 Sobic008G173900 Sobic009G127900--Sobic008G173900 Sobic001G111900 Sobic001G111900 Sobic009G127900--Sobic001G111900 Sobic007G178700--Sobic009G127900 Sobic007G178700--Sobic003G268300 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic002G243900 Sobic007G178700--Sobic003G087400 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic007G178700--Sobic004G007100 Sobic001G162300 Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G162300 Sobic007G178700--Sobic001G446900 Sobic005G144400 Sobic005G144400 Sobic007G178700--Sobic005G144400 Sobic001G420200 Sobic001G420200 Sobic007G178700--Sobic001G420200 Sobic006G246900 Sobic006G246900 Sobic009G134500--Sobic006G246900 Sobic009G134500--Sobic006G082600 Sobic009G134500--Sobic009G127900 Sobic009G134500--Sobic001G162300 Sobic002G157000 Sobic002G157000 Sobic009G134500--Sobic002G157000 Sobic008G041700 Sobic008G041700 Sobic009G134500--Sobic008G041700 Sobic005G187200 Sobic005G187200 Sobic009G134500--Sobic005G187200 Sobic009G134500--Sobic007G037900 Sobic009G134500--Sobic007G178700 Sobic002G313300 Sobic002G313300 Sobic004G082500--Sobic002G313300 Sobic006G124900 Sobic006G124900 Sobic004G082500--Sobic006G124900 Sobic005G177800 Sobic005G177800 Sobic004G082500--Sobic005G177800 Sobic001G192900 Sobic001G192900 Sobic004G082500--Sobic001G192900 Sobic002G001600 Sobic002G001600 Sobic004G082500--Sobic002G001600 Sobic005G130200 Sobic005G130200 Sobic004G082500--Sobic005G130200 Sobic004G082500--Sobic001G543900 Sobic004G196700 Sobic004G196700 Sobic004G082500--Sobic004G196700 Sobic007G078000 Sobic007G078000 Sobic004G082500--Sobic007G078000 Sobic006G082600--Sobic001G162300 Sobic006G082600--Sobic007G178700 Sobic007G037100 Sobic007G037100 Sobic006G082600--Sobic007G037100 Sobic001G251700 Sobic001G251700 Sobic006G082600--Sobic001G251700 Sobic006G082600--Sobic004G196700 Sobic006G082600--Sobic009G134500 Sobic010G124001 Sobic010G124001 Sobic006G082600--Sobic010G124001 Sobic006G082600--Sobic009G127900 Sobic006G082600--Sobic002G157000 Sobic003G087400--Sobic007G178700 Sobic003G087400--Sobic004G007100 Sobic009G104201 Sobic009G104201 Sobic003G087400--Sobic009G104201 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic003G087400--Sobic006G048500 Sobic003G087400--Sobic009G127900 Sobic002G006900 Sobic002G006900 Sobic003G087400--Sobic002G006900 Sobic003G176500 Sobic003G176500 Sobic003G087400--Sobic003G176500 Sobic010G056000 Sobic010G056000 Sobic003G087400--Sobic010G056000 Sobic001G205200 Sobic001G205200 Sobic003G087400--Sobic001G205200 Sobic004G290800--Sobic009G127900 Sobic004G290800--Sobic001G420200 Sobic004G290800--Sobic007G178700 Sobic004G290800--Sobic007G037900 Sobic004G290800--Sobic003G268300 Sobic004G290800--Sobic001G162300 Sobic004G290800--Sobic002G157000 Sobic004G290800--Sobic001G111900 Sobic004G290800--Sobic001G446900 Sobic007G096600 Sobic007G096600 Sobic003G268300--Sobic007G096600 Sobic003G268300--Sobic002G157000 Sobic003G268300--Sobic001G420200 Sobic003G200200 Sobic003G200200 Sobic003G268300--Sobic003G200200 Sobic002G248400 Sobic002G248400 Sobic003G268300--Sobic002G248400 Sobic003G268300--Sobic009G127900 Sobic003G268300--Sobic007G178700 Sobic003G268300--Sobic007G037900 Sobic003G268300--Sobic008G173900
Octagon: transcription factors


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