Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G278600.1
Synonym Sb04g031540
Functional annotation OsFBX59 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5Y0V6
Pfam PF12937
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G45360 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g46140.2 : OsFBX59 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a032354
Brachypodium -
Barley HORVU0Hr1G027670.1 , HORVU6Hr1G066560.1
Wheat TraesCS6A02G261600 , TraesCS6D02G242300 , TraesCS6B02G288900 , TraesCS6B02G288900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G375200 expressed protein -
2 Sobic.003G118600 OsFBX276 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.001G308350 - -
4 Sobic.010G046601 - -
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11 Sobic.009G134832 - -
12 Sobic.001G314350 - -
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17 Sobic.004G353650 - -
18 Sobic.001G505066 - -
19 Sobic.002G108900 transporter family protein, putative, expressed -
20 Sobic.002G104450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G278600 Sobic004G278600 Sobic002G375200 Sobic002G375200 Sobic004G278600--Sobic002G375200 Sobic003G118600 Sobic003G118600 Sobic004G278600--Sobic003G118600 Sobic001G308350 Sobic001G308350 Sobic004G278600--Sobic001G308350 Sobic010G046601 Sobic010G046601 Sobic004G278600--Sobic010G046601 Sobic010G120900 Sobic010G120900 Sobic004G278600--Sobic010G120900 Sobic005G070901 Sobic005G070901 Sobic004G278600--Sobic005G070901 Sobic008G014400 Sobic008G014400 Sobic004G278600--Sobic008G014400 Sobic003G116200 Sobic003G116200 Sobic004G278600--Sobic003G116200 Sobic010G246800 Sobic010G246800 Sobic004G278600--Sobic010G246800 Sobic002G375200--Sobic008G014400 Sobic006G244200 Sobic006G244200 Sobic002G375200--Sobic006G244200 Sobic004G145550 Sobic004G145550 Sobic002G375200--Sobic004G145550 Sobic003G142800 Sobic003G142800 Sobic002G375200--Sobic003G142800 Sobic007G113101 Sobic007G113101 Sobic002G375200--Sobic007G113101 Sobic002G375200--Sobic005G070901 Sobic003G416200 Sobic003G416200 Sobic002G375200--Sobic003G416200 Sobic003G384750 Sobic003G384750 Sobic002G375200--Sobic003G384750 Sobic004G332200 Sobic004G332200 Sobic002G375200--Sobic004G332200 Sobic003G118600--Sobic010G120900 Sobic001G505066 Sobic001G505066 Sobic003G118600--Sobic001G505066 Sobic003G118600--Sobic010G046601 Sobic002G292000 Sobic002G292000 Sobic003G118600--Sobic002G292000 Sobic007G202360 Sobic007G202360 Sobic003G118600--Sobic007G202360 Sobic003G192500 Sobic003G192500 Sobic003G118600--Sobic003G192500 Sobic002G190600 Sobic002G190600 Sobic003G118600--Sobic002G190600 Sobic010G172633 Sobic010G172633 Sobic003G118600--Sobic010G172633 Sobic001G143850 Sobic001G143850 Sobic003G118600--Sobic001G143850 Sobic001G308350--Sobic010G246800 Sobic009G178650 Sobic009G178650 Sobic001G308350--Sobic009G178650 Sobic009G077901 Sobic009G077901 Sobic001G308350--Sobic009G077901 Sobic001G308350--Sobic003G116200 Sobic001G308350--Sobic001G143850 Sobic002G204700 Sobic002G204700 Sobic001G308350--Sobic002G204700 Sobic009G053700 Sobic009G053700 Sobic001G308350--Sobic009G053700 Sobic001G308350--Sobic010G120900 Sobic003G394150 Sobic003G394150 Sobic001G308350--Sobic003G394150 Sobic010G046601--Sobic007G202360 Sobic010G046601--Sobic001G505066 Sobic005G065050 Sobic005G065050 Sobic010G046601--Sobic005G065050 Sobic010G046601--Sobic010G120900 Sobic010G046601--Sobic002G190600 Sobic001G488800 Sobic001G488800 Sobic010G046601--Sobic001G488800 Sobic010G046601--Sobic003G118600 Sobic010G046601--Sobic003G192500 Sobic008G122250 Sobic008G122250 Sobic010G046601--Sobic008G122250 Sobic010G120900--Sobic001G505066 Sobic010G120900--Sobic003G192500 Sobic010G120900--Sobic003G116200 Sobic010G120900--Sobic002G190600 Sobic010G120900--Sobic007G202360 Sobic001G314350 Sobic001G314350 Sobic010G120900--Sobic001G314350 Sobic005G122000 Sobic005G122000 Sobic010G120900--Sobic005G122000 Sobic010G120900--Sobic010G246800 Sobic003G123900 Sobic003G123900 Sobic010G120900--Sobic003G123900 Sobic006G219400 Sobic006G219400 Sobic005G070901--Sobic006G219400 Sobic004G224733 Sobic004G224733 Sobic005G070901--Sobic004G224733 Sobic008G040501 Sobic008G040501 Sobic005G070901--Sobic008G040501 Sobic003G233266 Sobic003G233266 Sobic005G070901--Sobic003G233266 Sobic001G331650 Sobic001G331650 Sobic005G070901--Sobic001G331650 Sobic010G214150 Sobic010G214150 Sobic005G070901--Sobic010G214150 Sobic001G465600 Sobic001G465600 Sobic005G070901--Sobic001G465600 Sobic005G070901--Sobic001G488800 Sobic004G207800 Sobic004G207800 Sobic005G070901--Sobic004G207800 Sobic008G014400--Sobic002G375200 Sobic008G014400--Sobic004G145550 Sobic007G107800 Sobic007G107800 Sobic008G014400--Sobic007G107800 Sobic008G014400--Sobic007G113101 Sobic008G014400--Sobic006G244200 Sobic008G014400--Sobic005G070901 Sobic006G206600 Sobic006G206600 Sobic008G014400--Sobic006G206600 Sobic004G208800 Sobic004G208800 Sobic008G014400--Sobic004G208800 Sobic008G014400--Sobic003G384750 Sobic003G116200--Sobic001G314350 Sobic003G116200--Sobic010G246800 Sobic003G116200--Sobic010G120900 Sobic003G116200--Sobic010G214150 Sobic002G312550 Sobic002G312550 Sobic003G116200--Sobic002G312550 Sobic003G013300 Sobic003G013300 Sobic003G116200--Sobic003G013300 Sobic003G116200--Sobic001G308350 Sobic003G116200--Sobic005G122000 Sobic006G243300 Sobic006G243300 Sobic003G116200--Sobic006G243300 Sobic010G246800--Sobic009G178650 Sobic010G246800--Sobic009G077901 Sobic010G246800--Sobic003G116200 Sobic010G246800--Sobic001G314350 Sobic010G246800--Sobic001G308350 Sobic010G246800--Sobic001G143850 Sobic010G246800--Sobic009G053700 Sobic010G246800--Sobic010G214150 Sobic010G246800--Sobic002G312550
Octagon: transcription factors


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