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Transcriptome id Sobic.004G285450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RQ17
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G087400 - -
2 Sobic.005G132033 - -
3 Sobic.004G220700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@Lyase(PubMedID : 30367619)@phenylalanine ammonia-lyase, putative, expressed K10775: phenylalanine ammonia-lyase
4 Sobic.009G108050 - -
5 Sobic.006G099001 - -
6 Sobic.001G236050 - -
7 Sobic.003G234600 carbonic anhydrase(PubMedID : 26904072)@-(PubMedID : 26976818)@C4 carbon fixation(PubMedID : 28620409)@carbonic anhydrase, chloroplast precursor, putative, expressed K01673: cynT, carbonic anhydrase
8 Sobic.002G020200 expressed protein -
9 Sobic.003G406000 OsFBO2 - F-box and other domain containing protein, expressed -
10 Sobic.007G090451 - -
11 Sobic.004G084900 SPX domain containing protein, putative, expressed -
12 Sobic.001G457466 - -
13 Sobic.003G409000 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR3 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
14 Sobic.010G254300 Myb-like DNA-binding domain containing protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G029300 HAD superfamily phosphatase, putative, expressed -
16 Sobic.007G090445 - -
17 Sobic.002G125200 aquaporin protein, putative, expressed K09872: aquaporin PIP
18 Sobic.002G413750 - -
19 Sobic.009G157450 - -
20 Sobic.009G159100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G285450 Sobic004G285450 Sobic002G087400 Sobic002G087400 Sobic004G285450--Sobic002G087400 Sobic005G132033 Sobic005G132033 Sobic004G285450--Sobic005G132033 Sobic004G220700 Sobic004G220700 Sobic004G285450--Sobic004G220700 Sobic009G108050 Sobic009G108050 Sobic004G285450--Sobic009G108050 Sobic006G099001 Sobic006G099001 Sobic004G285450--Sobic006G099001 Sobic001G236050 Sobic001G236050 Sobic004G285450--Sobic001G236050 Sobic003G234600 Sobic003G234600 Sobic004G285450--Sobic003G234600 Sobic002G020200 Sobic002G020200 Sobic004G285450--Sobic002G020200 Sobic003G406000 Sobic003G406000 Sobic004G285450--Sobic003G406000 Sobic002G087400--Sobic005G132033 Sobic005G112033 Sobic005G112033 Sobic002G087400--Sobic005G112033 Sobic002G087400--Sobic004G285450 Sobic003G409000 Sobic003G409000 Sobic002G087400--Sobic003G409000 Sobic010G254300 Sobic010G254300 Sobic002G087400--Sobic010G254300 Sobic004G003600 Sobic004G003600 Sobic002G087400--Sobic004G003600 Sobic008G157600 Sobic008G157600 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Sobic001G042901 Sobic001G042901 Sobic003G406000--Sobic001G042901 Sobic003G406000--Sobic002G196600
Octagon: transcription factors


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