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Transcriptome id Sobic.001G457466.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SAR3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G029400 no apical meristem protein, putative, expressed -
2 Sobic.008G076500 - -
3 Sobic.005G192500 cytochrome P450, putative, expressed -
4 Sobic.010G076100 - -
5 Sobic.006G153700 nitrilase, putative, expressed K13035: beta-cyano-L-alanine hydratase/nitrilase
6 Sobic.004G159733 - -
7 Sobic.005G067500 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase, putative, expressed K05933: aminocyclopropanecarboxylate oxidase
8 Sobic.001G353600 expressed protein -
9 Sobic.010G182200 elongation factor Tu, putative, expressed K03231: elongation factor 1-alpha
10 Sobic.004G088000 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
11 Sobic.007G151300 Cupin domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G245100 immediate-early fungal elicitor protein CMPG1, putative, expressed -
13 Sobic.003G228200 cytochrome P450 72A1, putative, expressed -
14 Sobic.001G101300 PIII3 - Proteinase inhibitor II family protein precursor, putative, expressed -
15 Sobic.001G397500 AMP-binding enzyme, putative, expressed -
16 Sobic.003G003200 ligA, putative, expressed K18482: 4-amino-4-deoxychorismate lyase
17 Sobic.010G104100 NF-X1-type zinc finger protein, putative, expressed K12236: transcriptional repressor NF-X1
18 Sobic.004G245200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
19 Sobic.001G211200 RIPER3 - Ripening-related family protein precursor, putative, expressed -
20 Sobic.003G411200 CRAL/TRIO domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G457466 Sobic001G457466 Sobic002G029400 Sobic002G029400 Sobic001G457466--Sobic002G029400 Sobic008G076500 Sobic008G076500 Sobic001G457466--Sobic008G076500 Sobic005G192500 Sobic005G192500 Sobic001G457466--Sobic005G192500 Sobic010G076100 Sobic010G076100 Sobic001G457466--Sobic010G076100 Sobic006G153700 Sobic006G153700 Sobic001G457466--Sobic006G153700 Sobic004G159733 Sobic004G159733 Sobic001G457466--Sobic004G159733 Sobic005G067500 Sobic005G067500 Sobic001G457466--Sobic005G067500 Sobic001G353600 Sobic001G353600 Sobic001G457466--Sobic001G353600 Sobic010G182200 Sobic010G182200 Sobic001G457466--Sobic010G182200 Sobic002G325800 Sobic002G325800 Sobic002G029400--Sobic002G325800 Sobic003G039600 Sobic003G039600 Sobic002G029400--Sobic003G039600 Sobic007G149800 Sobic007G149800 Sobic002G029400--Sobic007G149800 Sobic005G066600 Sobic005G066600 Sobic002G029400--Sobic005G066600 Sobic002G029400--Sobic001G457466 Sobic002G327400 Sobic002G327400 Sobic002G029400--Sobic002G327400 Sobic001G318000 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Octagon: transcription factors


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