Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G353600.1
Synonym Sb01g033840
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WYJ7
Pfam -
Panther DB PTHR12681
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G22140 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g26791.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G041600 profilin domain containing protein, expressed K05759: profilin
2 Sobic.001G034700 actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin
3 Sobic.001G087900 expressed protein -
4 Sobic.004G225500 bolA, putative, expressed K05527: BolA family transcriptional regulator, general stress-responsive regulator
5 Sobic.010G121300 nitrate-induced NOI protein, putative, expressed -
6 Sobic.004G351500 - -
7 Sobic.001G131400 thioesterase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.004G308400 xyloglucan fucosyltransferase, putative, expressed K13681: xyloglucan fucosyltransferase
9 Sobic.001G536500 expressed protein -
10 Sobic.009G131100 transmembrane BAX inhibitor motif-containing protein, putative, expressed K06890: uncharacterized protein
11 Sobic.008G189300 ubiquitin-conjugating enzyme E2 W, putative, expressed K10688: UBE2W, ubiquitin-conjugating enzyme E2 W
12 Sobic.001G048832 - -
13 Sobic.009G185800 translation initiation factor SUI1, putative, expressed K03113: EIF1, translation initiation factor 1
14 Sobic.008G011600 ubiquitin-like protein 5, putative, expressed K13113: UBL5, ubiquitin-like protein 5
15 Sobic.009G023200 glycine-rich protein A3, putative, expressed -
16 Sobic.001G445800 expressed protein -
17 Sobic.001G086300 cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G300900 OsGrx_C3 - glutaredoxin subgroup I, expressed K03676: grxC, GLRX, glutaredoxin 3
19 Sobic.008G185400 ras-related protein, putative, expressed K07889: Ras-related protein Rab-5C
20 Sobic.001G005900 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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