Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G087900.2
Synonym Sb01g007930
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S4X9
Pfam PF04241
Panther DB PTHR10584
NCBI CDD KOG3472; Predicted small membrane protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G04900 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g53980.2 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008176
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS5A02G390700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G351500 - -
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12 Sobic.003G305100 expressed protein -
13 Sobic.001G501200 ras-related protein, putative, expressed K07889: Ras-related protein Rab-5C
14 Sobic.003G277000 expressed protein -
15 Sobic.002G078400 ADP-ribosylation factor, putative, expressed K07937: ADP-ribosylation factor 1/2
K07977: Arf/Sar family, other
16 Sobic.001G131400 thioesterase family protein, putative, expressed -
17 Sobic.001G536500 expressed protein -
18 Sobic.008G189300 ubiquitin-conjugating enzyme E2 W, putative, expressed K10688: UBE2W, ubiquitin-conjugating enzyme E2 W
19 Sobic.001G116700 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K10704: ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant
20 Sobic.007G091000 thioredoxin domain-containing protein 9, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G087900 Sobic001G087900 Sobic004G351500 Sobic004G351500 Sobic001G087900--Sobic004G351500 Sobic001G428200 Sobic001G428200 Sobic001G087900--Sobic001G428200 Sobic001G353600 Sobic001G353600 Sobic001G087900--Sobic001G353600 Sobic009G131100 Sobic009G131100 Sobic001G087900--Sobic009G131100 Sobic009G198500 Sobic009G198500 Sobic001G087900--Sobic009G198500 Sobic004G272300 Sobic004G272300 Sobic001G087900--Sobic004G272300 Sobic004G026400 Sobic004G026400 Sobic001G087900--Sobic004G026400 Sobic001G095632 Sobic001G095632 Sobic001G087900--Sobic001G095632 Sobic001G034700 Sobic001G034700 Sobic001G087900--Sobic001G034700 Sobic001G364500 Sobic001G364500 Sobic004G351500--Sobic001G364500 Sobic004G351500--Sobic001G087900 Sobic002G155500 Sobic002G155500 Sobic004G351500--Sobic002G155500 Sobic004G351500--Sobic001G034700 Sobic009G062000 Sobic009G062000 Sobic004G351500--Sobic009G062000 Sobic004G225500 Sobic004G225500 Sobic004G351500--Sobic004G225500 Sobic001G536500 Sobic001G536500 Sobic004G351500--Sobic001G536500 Sobic002G078400 Sobic002G078400 Sobic004G351500--Sobic002G078400 Sobic008G129400 Sobic008G129400 Sobic004G351500--Sobic008G129400 Sobic001G428200--Sobic001G087900 Sobic001G428200--Sobic004G351500 Sobic001G428200--Sobic009G131100 Sobic003G369500 Sobic003G369500 Sobic001G428200--Sobic003G369500 Sobic001G428200--Sobic001G353600 Sobic003G325500 Sobic003G325500 Sobic001G428200--Sobic003G325500 Sobic001G428200--Sobic004G225500 Sobic004G060600 Sobic004G060600 Sobic001G428200--Sobic004G060600 Sobic001G428200--Sobic009G198500 Sobic010G041600 Sobic010G041600 Sobic001G353600--Sobic010G041600 Sobic001G353600--Sobic001G034700 Sobic001G353600--Sobic001G087900 Sobic001G353600--Sobic004G225500 Sobic010G121300 Sobic010G121300 Sobic001G353600--Sobic010G121300 Sobic001G353600--Sobic004G351500 Sobic001G131400 Sobic001G131400 Sobic001G353600--Sobic001G131400 Sobic004G308400 Sobic004G308400 Sobic001G353600--Sobic004G308400 Sobic001G353600--Sobic001G536500 Sobic009G131100--Sobic001G536500 Sobic009G131100--Sobic002G078400 Sobic009G131100--Sobic004G060600 Sobic007G091000 Sobic007G091000 Sobic009G131100--Sobic007G091000 Sobic010G194900 Sobic010G194900 Sobic009G131100--Sobic010G194900 Sobic003G277000 Sobic003G277000 Sobic009G131100--Sobic003G277000 Sobic009G131100--Sobic001G087900 Sobic004G265700 Sobic004G265700 Sobic009G131100--Sobic004G265700 Sobic006G281200 Sobic006G281200 Sobic009G131100--Sobic006G281200 Sobic009G198500--Sobic004G272300 Sobic003G124800 Sobic003G124800 Sobic009G198500--Sobic003G124800 Sobic002G400000 Sobic002G400000 Sobic009G198500--Sobic002G400000 Sobic007G168600 Sobic007G168600 Sobic009G198500--Sobic007G168600 Sobic009G198500--Sobic002G078400 Sobic004G300900 Sobic004G300900 Sobic009G198500--Sobic004G300900 Sobic001G005900 Sobic001G005900 Sobic009G198500--Sobic001G005900 Sobic007G096700 Sobic007G096700 Sobic009G198500--Sobic007G096700 Sobic006G212100 Sobic006G212100 Sobic009G198500--Sobic006G212100 Sobic004G272300--Sobic009G198500 Sobic004G272300--Sobic004G300900 Sobic004G272300--Sobic001G005900 Sobic004G272300--Sobic007G168600 Sobic004G272300--Sobic002G078400 Sobic004G272300--Sobic003G124800 Sobic004G272300--Sobic004G351500 Sobic004G272300--Sobic002G400000 Sobic001G314500 Sobic001G314500 Sobic004G272300--Sobic001G314500 Sobic001G084900 Sobic001G084900 Sobic004G026400--Sobic001G084900 Sobic002G187500 Sobic002G187500 Sobic004G026400--Sobic002G187500 Sobic001G432000 Sobic001G432000 Sobic004G026400--Sobic001G432000 Sobic001G445800 Sobic001G445800 Sobic004G026400--Sobic001G445800 Sobic003G150000 Sobic003G150000 Sobic004G026400--Sobic003G150000 Sobic003G285800 Sobic003G285800 Sobic004G026400--Sobic003G285800 Sobic001G225700 Sobic001G225700 Sobic004G026400--Sobic001G225700 Sobic010G009300 Sobic010G009300 Sobic004G026400--Sobic010G009300 Sobic003G072300 Sobic003G072300 Sobic004G026400--Sobic003G072300 Sobic001G095632--Sobic009G062000 Sobic001G286200 Sobic001G286200 Sobic001G095632--Sobic001G286200 Sobic004G060500 Sobic004G060500 Sobic001G095632--Sobic004G060500 Sobic001G304400 Sobic001G304400 Sobic001G095632--Sobic001G304400 Sobic010G264300 Sobic010G264300 Sobic001G095632--Sobic010G264300 Sobic002G078300 Sobic002G078300 Sobic001G095632--Sobic002G078300 Sobic001G095632--Sobic008G129400 Sobic003G305100 Sobic003G305100 Sobic001G095632--Sobic003G305100 Sobic002G356400 Sobic002G356400 Sobic001G095632--Sobic002G356400 Sobic001G034700--Sobic010G041600 Sobic001G086300 Sobic001G086300 Sobic001G034700--Sobic001G086300 Sobic001G048832 Sobic001G048832 Sobic001G034700--Sobic001G048832 Sobic009G176000 Sobic009G176000 Sobic001G034700--Sobic009G176000 Sobic007G051000 Sobic007G051000 Sobic001G034700--Sobic007G051000 Sobic005G188100 Sobic005G188100 Sobic001G034700--Sobic005G188100 Sobic001G034700--Sobic003G285800 Sobic010G178200 Sobic010G178200 Sobic001G034700--Sobic010G178200 Sobic001G034700--Sobic003G150000
Octagon: transcription factors


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