Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G351500.1
Synonym Sb04g037830
Functional annotation -
UniProt C5XWK8
Pfam -
Panther DB PTHR37756 PTHR37756:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G03460 : -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.004G351500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G364500 peptide methionine sulfoxide reductase msrB, putative, expressed K07305: peptide-methionine (R)-S-oxide reductase
2 Sobic.001G087900 expressed protein -
3 Sobic.002G155500 ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed K06689: UBE2D, UBC4, ubiquitin-conjugating enzyme E2 D
4 Sobic.001G034700 actin-depolymerizing factor, putative, expressed K05765: cofilin
5 Sobic.009G062000 ribosomal protein L51, putative, expressed K03946: NADH dehydrogenase (ubiquinone) 1 alpha subcomplex subunit 2
6 Sobic.004G225500 bolA, putative, expressed K05527: BolA family transcriptional regulator, general stress-responsive regulator
7 Sobic.001G536500 expressed protein -
8 Sobic.002G078400 ADP-ribosylation factor, putative, expressed K07937: ADP-ribosylation factor 1/2
K07977: Arf/Sar family, other
9 Sobic.008G129400 cytochrome c oxidase polypeptide Vc, putative, expressed -
10 Sobic.001G445800 expressed protein -
11 Sobic.008G128900 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, putative, expressed K03017: RPB9, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
12 Sobic.004G272300 expressed protein -
13 Sobic.001G048832 - -
14 Sobic.001G095632 - -
15 Sobic.001G538600 rhodanese, putative, expressed K18065: Cdc25 family phosphatase
16 Sobic.004G284500 ORM1, putative, expressed -
17 Sobic.010G018400 expressed protein K02153: ATPeV0E, V-type H+-transporting ATPase subunit e
18 Sobic.010G041600 profilin domain containing protein, expressed K05759: profilin
19 Sobic.001G353600 expressed protein -
20 Sobic.007G157900 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G351500 Sobic004G351500 Sobic001G364500 Sobic001G364500 Sobic004G351500--Sobic001G364500 Sobic001G087900 Sobic001G087900 Sobic004G351500--Sobic001G087900 Sobic002G155500 Sobic002G155500 Sobic004G351500--Sobic002G155500 Sobic001G034700 Sobic001G034700 Sobic004G351500--Sobic001G034700 Sobic009G062000 Sobic009G062000 Sobic004G351500--Sobic009G062000 Sobic004G225500 Sobic004G225500 Sobic004G351500--Sobic004G225500 Sobic001G536500 Sobic001G536500 Sobic004G351500--Sobic001G536500 Sobic002G078400 Sobic002G078400 Sobic004G351500--Sobic002G078400 Sobic008G129400 Sobic008G129400 Sobic004G351500--Sobic008G129400 Sobic001G364500--Sobic004G351500 Sobic001G364500--Sobic004G225500 Sobic004G224900 Sobic004G224900 Sobic001G364500--Sobic004G224900 Sobic001G005900 Sobic001G005900 Sobic001G364500--Sobic001G005900 Sobic001G048832 Sobic001G048832 Sobic001G364500--Sobic001G048832 Sobic007G078100 Sobic007G078100 Sobic001G364500--Sobic007G078100 Sobic001G364500--Sobic002G155500 Sobic001G132100 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Octagon: transcription factors


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