Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G445800.1
Synonym Sb01g041890
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WRP8
Pfam -
Panther DB PTHR34936 PTHR34936:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G20460 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g12630.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a001445
Brachypodium KQK22729
Barley HORVU4Hr1G065410.1 , HORVU4Hr1G065410.2 , HORVU4Hr1G065410.3
Wheat TraesCS4B02G234000 , TraesCS4A02G077900 , TraesCS4D02G235100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G129400 cytochrome c oxidase polypeptide Vc, putative, expressed -
2 Sobic.003G321700 KH domain containing protein, putative, expressed K11884: PNO1, RNA-binding protein PNO1
3 Sobic.002G078400 ADP-ribosylation factor, putative, expressed K07937: ADP-ribosylation factor 1/2
K07977: Arf/Sar family, other
4 Sobic.003G249800 60S ribosomal protein L18a-1, putative, expressed -
5 Sobic.002G046100 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
6 Sobic.010G018400 expressed protein K02153: ATPeV0E, V-type H+-transporting ATPase subunit e
7 Sobic.010G154700 - -
8 Sobic.001G019900 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed K15707: RING finger protein 170
9 Sobic.002G190900 expressed protein -
10 Sobic.001G084900 expressed protein -
11 Sobic.004G145801 - K02978: RP-S27e, small subunit ribosomal protein S27e
12 Sobic.010G213400 protein transport protein SEC61 subunit gamma, putative, expressed K07342: SEC61G, SSS1, protein transport protein SEC61 subunit gamma and related proteins
13 Sobic.001G091801 - K02978: RP-S27e, small subunit ribosomal protein S27e
14 Sobic.001G048832 - -
15 Sobic.010G153100 prefoldin, putative, expressed K14009: BCAP31, B-cell receptor-associated protein 31
16 Sobic.002G345300 ZOS7-05 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
17 Sobic.006G010600 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed K09578: peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1
18 Sobic.003G155400 miro, putative, expressed K07953: GTP-binding protein SAR1
19 Sobic.007G190800 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim, putative, expressed K17780: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM8
20 Sobic.004G272800 VHS and GAT domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G445800 Sobic001G445800 Sobic008G129400 Sobic008G129400 Sobic001G445800--Sobic008G129400 Sobic003G321700 Sobic003G321700 Sobic001G445800--Sobic003G321700 Sobic002G078400 Sobic002G078400 Sobic001G445800--Sobic002G078400 Sobic003G249800 Sobic003G249800 Sobic001G445800--Sobic003G249800 Sobic002G046100 Sobic002G046100 Sobic001G445800--Sobic002G046100 Sobic010G018400 Sobic010G018400 Sobic001G445800--Sobic010G018400 Sobic010G154700 Sobic010G154700 Sobic001G445800--Sobic010G154700 Sobic001G019900 Sobic001G019900 Sobic001G445800--Sobic001G019900 Sobic002G190900 Sobic002G190900 Sobic001G445800--Sobic002G190900 Sobic008G129400--Sobic010G018400 Sobic009G176000 Sobic009G176000 Sobic008G129400--Sobic009G176000 Sobic008G129400--Sobic002G190900 Sobic002G398901 Sobic002G398901 Sobic008G129400--Sobic002G398901 Sobic007G051000 Sobic007G051000 Sobic008G129400--Sobic007G051000 Sobic006G083500 Sobic006G083500 Sobic008G129400--Sobic006G083500 Sobic010G012500 Sobic010G012500 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Sobic002G190900--Sobic004G211833 Sobic001G374700 Sobic001G374700 Sobic002G190900--Sobic001G374700
Octagon: transcription factors


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