Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G010600.1
Synonym Sb06g001060, PIN1AT
Functional annotation peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed
UniProt C5YBR7
Pfam PF00639
Panther DB PTHR10657 PTHR10657:SF4
NCBI CDD KOG3259; Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase
KEGG Orthology K09578; peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 1
Gene Ontology GO:0016853; isomerase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G18040 : peptidylprolyl cis/trans isomerase, NIMA-interacting 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g56800.1 : peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a055681
Brachypodium -
Barley HORVU6Hr1G068220.2 , HORVU6Hr1G068220.1 , HORVU6Hr1G068220.3
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G010600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G103700 ribosomal protein, putative, expressed K02866: RP-L10e, large subunit ribosomal protein L10e
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3 Sobic.004G145801 - K02978: RP-S27e, small subunit ribosomal protein S27e
4 Sobic.001G172000 expressed protein -
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K07977: Arf/Sar family, other
9 Sobic.004G310300 phosphate carrier protein, mitochondrial precursor, putative, expressed K15102: SLC25A3, PHC, solute carrier family 25 (mitochondrial phosphate transporter), member 3
10 Sobic.001G390300 OsCam1-1 - Calmodulin, expressed K02183: calmodulin
11 Sobic.003G362400 G10 protein, putative, expressed K12873: BUD31, bud site selection protein 31
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15 Sobic.007G134000 14-3-3 protein, putative, expressed K06630: 14-3-3 protein epsilon
16 Sobic.006G182100 ORM1, putative, expressed -
17 Sobic.010G150575 - -
18 Sobic.001G091801 - K02978: RP-S27e, small subunit ribosomal protein S27e
19 Sobic.004G284500 ORM1, putative, expressed -
20 Sobic.003G155400 miro, putative, expressed K07953: GTP-binding protein SAR1


Gene co-expression network
sample Sobic006G010600 Sobic006G010600 Sobic004G103700 Sobic004G103700 Sobic006G010600--Sobic004G103700 Sobic001G445800 Sobic001G445800 Sobic006G010600--Sobic001G445800 Sobic004G145801 Sobic004G145801 Sobic006G010600--Sobic004G145801 Sobic001G172000 Sobic001G172000 Sobic006G010600--Sobic001G172000 Sobic010G204600 Sobic010G204600 Sobic006G010600--Sobic010G204600 Sobic003G368500 Sobic003G368500 Sobic006G010600--Sobic003G368500 Sobic003G181500 Sobic003G181500 Sobic006G010600--Sobic003G181500 Sobic002G078400 Sobic002G078400 Sobic006G010600--Sobic002G078400 Sobic004G310300 Sobic004G310300 Sobic006G010600--Sobic004G310300 Sobic001G025600 Sobic001G025600 Sobic004G103700--Sobic001G025600 Sobic004G103700--Sobic001G172000 Sobic004G103700--Sobic006G010600 Sobic002G135200 Sobic002G135200 Sobic004G103700--Sobic002G135200 Sobic001G018800 Sobic001G018800 Sobic004G103700--Sobic001G018800 Sobic003G129800 Sobic003G129800 Sobic004G103700--Sobic003G129800 Sobic007G134000 Sobic007G134000 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Octagon: transcription factors


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