Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G236050.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S709
Pfam PF03080
Panther DB PTHR31589 PTHR31589:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G48230 : Protein of Unknown Function (DUF239)
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g05220.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G065800 Cupin domain containing protein, expressed -
2 Sobic.004G292001 - -
3 Sobic.003G364950 - -
4 Sobic.004G023500 GATA zinc finger domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G422300 ethylene-insensitive 3, putative, expressed K14514: ethylene-insensitive protein 3
6 Sobic.006G099001 - -
7 Sobic.002G130601 - -
8 Sobic.006G214600 - -
9 Sobic.007G065900 Cupin domain containing protein, expressed -
10 Sobic.006G268500 transporter family protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G030400 expressed protein -
12 Sobic.002G044800 SAM dependent carboxyl methyltransferase, putative, expressed -
13 Sobic.008G157800 BURP domain containing protein, expressed -
14 Sobic.002G389301 - -
15 Sobic.004G182000 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G108050 - -
17 Sobic.006G019200 "domain confirmed by Pfam database, expression not supported"(PubMedID : 20499123)@OsSAUR4 - Auxin-responsive SAUR gene family member, expressed K14488: SAUR family protein
18 Sobic.006G190700 - -
19 Sobic.008G170100 phospholipase, putative, expressed -
20 Sobic.010G043900 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic001G236050 Sobic001G236050 Sobic007G065800 Sobic007G065800 Sobic001G236050--Sobic007G065800 Sobic004G292001 Sobic004G292001 Sobic001G236050--Sobic004G292001 Sobic003G364950 Sobic003G364950 Sobic001G236050--Sobic003G364950 Sobic004G023500 Sobic004G023500 Sobic001G236050--Sobic004G023500 Sobic002G422300 Sobic002G422300 Sobic001G236050--Sobic002G422300 Sobic006G099001 Sobic006G099001 Sobic001G236050--Sobic006G099001 Sobic002G130601 Sobic002G130601 Sobic001G236050--Sobic002G130601 Sobic006G214600 Sobic006G214600 Sobic001G236050--Sobic006G214600 Sobic007G065900 Sobic007G065900 Sobic001G236050--Sobic007G065900 Sobic007G065800--Sobic004G292001 Sobic007G065800--Sobic004G023500 Sobic007G065800--Sobic002G130601 Sobic007G065800--Sobic007G065900 Sobic008G157800 Sobic008G157800 Sobic007G065800--Sobic008G157800 Sobic004G061701 Sobic004G061701 Sobic007G065800--Sobic004G061701 Sobic005G217300 Sobic005G217300 Sobic007G065800--Sobic005G217300 Sobic002G150100 Sobic002G150100 Sobic007G065800--Sobic002G150100 Sobic004G292001--Sobic007G065900 Sobic004G292001--Sobic007G065800 Sobic004G292001--Sobic002G130601 Sobic004G292001--Sobic003G364950 Sobic004G292001--Sobic008G157800 Sobic005G213500 Sobic005G213500 Sobic004G292001--Sobic005G213500 Sobic004G278400 Sobic004G278400 Sobic004G292001--Sobic004G278400 Sobic004G292001--Sobic004G023500 Sobic007G030400 Sobic007G030400 Sobic004G292001--Sobic007G030400 Sobic003G364950--Sobic006G214600 Sobic010G043900 Sobic010G043900 Sobic003G364950--Sobic010G043900 Sobic003G364950--Sobic004G292001 Sobic003G364950--Sobic004G278400 Sobic003G364950--Sobic005G213500 Sobic003G364300 Sobic003G364300 Sobic003G364950--Sobic003G364300 Sobic003G364950--Sobic002G422300 Sobic003G364000 Sobic003G364000 Sobic003G364950--Sobic003G364000 Sobic002G004900 Sobic002G004900 Sobic003G364950--Sobic002G004900 Sobic004G023500--Sobic004G061701 Sobic004G023500--Sobic008G157800 Sobic009G099400 Sobic009G099400 Sobic004G023500--Sobic009G099400 Sobic004G023500--Sobic007G065900 Sobic003G344050 Sobic003G344050 Sobic004G023500--Sobic003G344050 Sobic004G023500--Sobic002G150100 Sobic002G220800 Sobic002G220800 Sobic004G023500--Sobic002G220800 Sobic002G422300--Sobic010G043900 Sobic008G158332 Sobic008G158332 Sobic002G422300--Sobic008G158332 Sobic002G010900 Sobic002G010900 Sobic002G422300--Sobic002G010900 Sobic001G114900 Sobic001G114900 Sobic002G422300--Sobic001G114900 Sobic006G268500 Sobic006G268500 Sobic002G422300--Sobic006G268500 Sobic009G071000 Sobic009G071000 Sobic002G422300--Sobic009G071000 Sobic008G027600 Sobic008G027600 Sobic002G422300--Sobic008G027600 Sobic006G101300 Sobic006G101300 Sobic002G422300--Sobic006G101300 Sobic003G026400 Sobic003G026400 Sobic002G422300--Sobic003G026400 Sobic009G108050 Sobic009G108050 Sobic006G099001--Sobic009G108050 Sobic006G099001--Sobic001G236050 Sobic010G239400 Sobic010G239400 Sobic006G099001--Sobic010G239400 Sobic002G095400 Sobic002G095400 Sobic006G099001--Sobic002G095400 Sobic002G343600 Sobic002G343600 Sobic006G099001--Sobic002G343600 Sobic010G154300 Sobic010G154300 Sobic006G099001--Sobic010G154300 Sobic003G232800 Sobic003G232800 Sobic006G099001--Sobic003G232800 Sobic004G316100 Sobic004G316100 Sobic006G099001--Sobic004G316100 Sobic004G086500 Sobic004G086500 Sobic006G099001--Sobic004G086500 Sobic002G130601--Sobic004G292001 Sobic002G130601--Sobic007G065800 Sobic002G130601--Sobic007G065900 Sobic002G130601--Sobic004G023500 Sobic002G130601--Sobic008G157800 Sobic010G113600 Sobic010G113600 Sobic002G130601--Sobic010G113600 Sobic002G130601--Sobic004G061701 Sobic002G130601--Sobic005G217300 Sobic002G130601--Sobic003G364950 Sobic006G214600--Sobic003G364950 Sobic006G214600--Sobic010G043900 Sobic006G214600--Sobic002G422300 Sobic006G214600--Sobic004G278400 Sobic006G190700 Sobic006G190700 Sobic006G214600--Sobic006G190700 Sobic001G054500 Sobic001G054500 Sobic006G214600--Sobic001G054500 Sobic005G108601 Sobic005G108601 Sobic006G214600--Sobic005G108601 Sobic004G045400 Sobic004G045400 Sobic006G214600--Sobic004G045400 Sobic006G227750 Sobic006G227750 Sobic006G214600--Sobic006G227750 Sobic007G065900--Sobic008G157800 Sobic007G065900--Sobic004G023500 Sobic007G065900--Sobic010G113600 Sobic007G065900--Sobic004G061701 Sobic007G065900--Sobic004G292001 Sobic008G170100 Sobic008G170100 Sobic007G065900--Sobic008G170100 Sobic003G112300 Sobic003G112300 Sobic007G065900--Sobic003G112300 Sobic008G039501 Sobic008G039501 Sobic007G065900--Sobic008G039501 Sobic007G065900--Sobic007G065800
Octagon: transcription factors


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